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UniProtKB/Swiss-Prot P04072 (THET_THEVU)
Last modified
June 16, 2009.
Version 72.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (3) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Thermitase EC=3.4.21.66 |
| Organism | Thermoactinomyces vulgaris |
| Taxonomic identifier | 2026 [NCBI] |
| Taxonomic lineage | Bacteria › Firmicutes › Bacillales › Thermoactinomycetaceae › Thermoactinomyces |
Protein attributes
| Sequence length | 279 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | Hydrolysis of proteins, including collagen. |
| Cofactor | Binds 3 calcium ions or 2 calcium ions and 1 sodium ion per subunit. The sodium ion is bound at calcium concentrations up to 5 mM. At 100 mM calcium 3 calcium ions are bound. |
| Subcellular location | |
| Sequence similarities | Belongs to the peptidase S8 family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Secreted |
| Ligand | Calcium Metal-binding |
| Molecular function | Hydrolase Protease Serine protease |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | proteolysis Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular component | extracellular region Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | calcium ion binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW serine-type endopeptidase activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 279 | 279 | Thermitase | PRO_0000076421 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 38 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 71 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 225 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 5 | 1 | Calcium 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 47 | 1 | Calcium 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 57 | 1 | Calcium 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 60 | 1 | Calcium 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 62 | 1 | Calcium 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 64 | 1 | Calcium 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 66 | 1 | Calcium 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 82 | 1 | Calcium 1; via carbonyl oxygen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 85 | 1 | Calcium 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 87 | 1 | Calcium 1; via carbonyl oxygen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 89 | 1 | Calcium 1; via carbonyl oxygen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 8 – 11 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 14 – 17 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 20 – 24 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 33 – 39 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 46 – 51 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 52 – 57 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 58 – 61 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 68 – 70 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 71 – 80 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 84 – 88 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 97 – 102 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 112 – 124 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 128 – 132 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 136 – 138 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 141 – 152 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 156 – 160 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 163 – 166 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 172 – 174 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 178 – 184 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 202 – 205 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 207 – 213 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 214 – 216 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 217 – 221 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 224 – 239 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 240 – 242 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 245 – 254 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 260 – 264 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 267 – 270 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 273 – 278 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Complete primary structure of thermitase from Thermoactinomyces vulgaris and its structural features related to the subtilisin-type proteinases." Meloun B., Baudys M., Kostka V., Hausdorf G., Frommel C., Hohne W.E. FEBS Lett. 183:195-200(1985) Cited for: PROTEIN SEQUENCE. |
| [2] | "Crystal structure of thermitase from Thermoactinomyces vulgaris at 2.2-A resolution." Teplyakov A.V., Kuranova I.P., Harutyunyan E.H., Frommel C., Hohne W.E. FEBS Lett. 244:208-212(1989) [PubMed: 2647518] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.2 ANGSTROMS). |
| [3] | "Molecular dynamics refinement of a thermitase-eglin-c complex at 1.98-A resolution and comparison of two crystal forms that differ in calcium content." Gros P., Betzel C., Dauter Z., Wilson K.S., Hol W.G.J. J. Mol. Biol. 210:347-367(1989) [PubMed: 2689655] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.98 ANGSTROMS). |
| [4] | "Crystal structure of thermitase at 1.4-A resolution." Teplyakov A.V., Kuranova I.P., Harutyunyan E.H., Vainshtein B.K., Frommel C., Hohne W.E., Wilson K.S. J. Mol. Biol. 214:261-279(1990) [PubMed: 2196375] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.4 ANGSTROMS). |
| [5] | "Calcium binding to thermitase. Crystallographic studies of thermitase at 0, 5, and 100 mM calcium." Gros P., Kalk K.H., Hol W.G.J. J. Biol. Chem. 266:2953-2961(1991) [PubMed: 1993669] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.0 ANGSTROMS). |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PIR | SUMYTV. A00973. | ||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| MEROPS | S08.007. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 3.4.21.66. 18584. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000209. Pept_S8_S53. IPR015500. Peptidase_S8_subtilisin-rel. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.50.200. Pept_S8_S53. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR10795. SubtilSerProt. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00082. Peptidase_S8. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00723. SUBTILISIN. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00136. SUBTILASE_ASP. 1 hit. PS00137. SUBTILASE_HIS. 1 hit. PS00138. SUBTILASE_SER. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | THET_THEVU | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P04072 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| Peptidase families Classification of peptidase families and list of entries |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


