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UniProtKB/Swiss-Prot P03952 (KLKB1_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
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Documents (7) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Plasma kallikrein EC=3.4.21.34 Alternative name(s): Plasma prekallikrein Kininogenin Fletcher factor Cleaved into the following 2 chains: 1- Recommended name: Plasma kallikrein heavy chain 2- Recommended name: Plasma kallikrein light chain | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 638 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | The enzyme cleaves Lys-Arg and Arg-Ser bonds. It activates, in a reciprocal reaction, factor XII after its binding to a negatively charged surface. It also releases bradykinin from HMW kininogen and may also play a role in the renin-angiotensin system by converting prorenin into renin. |
| Catalytic activity | Cleaves selectively Arg-|-Xaa and Lys-|-Xaa bonds, including Lys-|-Arg and Arg-|-Ser bonds in (human) kininogen to release bradykinin. |
| Subunit structure | The zymogen is activated by factor XIIa, which cleaves the molecule into a light chain, which contains the active site, and a heavy chain, which associates with HMW kininogen. These chains are linked by one or more disulfide bonds. |
| Subcellular location | |
| Involvement in disease | Defects in KLKB1 are the cause of prekallikrein deficiency (PKK deficiency) [MIM:612423]; also called Fletcher factor deficiency. This disorder is a blood coagulation defect. |
| Sequence similarities | Belongs to the peptidase S1 family. Plasma kallikrein subfamily. Contains 4 apple domains. Contains 1 peptidase S1 domain. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 19 | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 20 – 390 | 371 | Plasma kallikrein heavy chain | PRO_0000028021 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 391 – 638 | 248 | Plasma kallikrein light chain | PRO_0000028022 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 21 – 104 | 84 | Apple 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 111 – 194 | 84 | Apple 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 201 – 284 | 84 | Apple 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 292 – 375 | 84 | Apple 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 391 – 626 | 236 | Peptidase S1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 434 | 1 | Charge relay system | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 483 | 1 | Charge relay system | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 578 | 1 | Charge relay system | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 127 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.8 Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 308 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.8 Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 396 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.8 Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 453 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.8 Ref.7 Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 494 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.8 Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 21 ↔ 104 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 47 ↔ 77 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 51 ↔ 57 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 111 ↔ 194 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 137 ↔ 166 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 141 ↔ 147 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 201 ↔ 284 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 227 ↔ 256 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 231 ↔ 237 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 292 ↔ 375 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 318 ↔ 347 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 322 ↔ 328 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 340 ↔ 345 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 383 ↔ 503 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 419 ↔ 435 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 517 ↔ 584 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 548 ↔ 563 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 574 ↔ 602 | Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 123 | 1 | G → R in PKK deficiency; reduces the binding activity of Apple domain 2 to HMW kininogen. | VAR_054907 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 143 | 1 | N → S in PKK deficiency; reduces the binding activity of Apple domain 2 to HMW kininogen. dbSNP rs3733402. | VAR_013598 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 178 | 1 | A → T: dbSNP rs4253257. Ref.4 | VAR_016280 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 202 | 1 | H → Q: dbSNP rs4253373. Ref.4 Ref.2 | VAR_013599 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 208 | 1 | H → P Ref.2 | VAR_013600 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 210 | 1 | A → E: dbSNP rs2278542. | VAR_020180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 269 | 1 | S → C: dbSNP rs4253376. Ref.4 | VAR_016281 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 311 | 1 | F → V: dbSNP rs4253377. Ref.4 | VAR_016282 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 358 | 1 | T → A: dbSNP rs4253379. Ref.4 | VAR_016283 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 381 | 1 | S → A: dbSNP rs4253301. Ref.4 | VAR_016284 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 442 | 1 | Q → P: dbSNP rs4253316. Ref.4 | VAR_016285 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 548 | 1 | C → Y in PKK deficiency. | VAR_054908 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 560 | 1 | R → Q: dbSNP rs4253325. Ref.4 Ref.5 | VAR_016286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 405 – 425 | 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 428 – 431 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 433 – 436 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 446 – 448 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 454 – 456 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 466 – 471 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 479 – 482 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 485 – 491 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 515 – 523 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 536 – 543 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 545 – 549 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 561 – 564 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 581 – 584 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 591 – 598 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 600 – 603 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 609 – 613 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 614 – 617 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 618 – 625 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M13143 mRNA. Translation: AAA60153.1. AF232742 AF232741 Genomic DNA. Translation: AAF79940.1. AK313378 mRNA. Translation: BAG36176.1. AY190920 Genomic DNA. Translation: AAN84794.1. BC117349 mRNA. Translation: AAI17350.1. BC117351 mRNA. Translation: AAI17352.1. | |||||||||||||||||||
| IPI | IPI00654888. | ||||||||||||||||||
| PIR | KQHUP. A00921. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000883.2. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.237642 | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||
| MEROPS | S01.212. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PRIDE | P03952. | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000164344. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||
| GeneID | 3818. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:3818. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| GeneCards | GC04P187385. | ||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0031513. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:6371. KLKB1. | ||||||||||||||||||
| HPA | HPA005634. | ||||||||||||||||||
| MIM | 229000. gene. 612423. phenotype. | ||||||||||||||||||
| Orphanet | 749. Congenital prekallikrein deficiency. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA30160. | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P03952. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BRENDA | 3.4.21.34. 247. | ||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_604. Hemostasis. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P03952. | ||||||||||||||||||
| Bgee | P03952. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_KLK3. HS_KLKB1. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000164344. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000177. Apple. IPR003014. PAN-1_domain. IPR003609. Pan_app. IPR018114. Peptidase_S1/S6_AS. IPR001254. Peptidase_S1_S6. IPR001314. Peptidase_S1A. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00024. PAN_1. 4 hits. PF00089. Trypsin. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00005. APPLEDOMAIN. PR00722. CHYMOTRYPSIN. | ||||||||||||||||||
| SMART | SM00223. APPLE. 4 hits. SM00020. Tryp_SPc. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00495. APPLE. 4 hits. PS50948. PAN. 4 hits. PS50240. TRYPSIN_DOM. 1 hit. PS00134. TRYPSIN_HIS. 1 hit. PS00135. TRYPSIN_SER. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||
| NextBio | 15011. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | KLKB1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P03952 Secondary accession number(s): B2R8H9, Q17RE8, Q17RE9 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 4 Human chromosome 4: entries, gene names and cross-references to MIM |
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