##gff-version 3 P02649 UniProtKB Signal peptide 1 18 . . . Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:7068630;Dbxref=PMID:7068630 P02649 UniProtKB Chain 19 317 . . . ID=PRO_0000001987;Note=Apolipoprotein E P02649 UniProtKB Repeat 80 101 . . . Note=1 P02649 UniProtKB Repeat 102 123 . . . Note=2 P02649 UniProtKB Repeat 124 145 . . . Note=3 P02649 UniProtKB Repeat 146 167 . . . Note=4 P02649 UniProtKB Repeat 168 189 . . . Note=5 P02649 UniProtKB Repeat 190 211 . . . Note=6 P02649 UniProtKB Repeat 212 233 . . . Note=7 P02649 UniProtKB Repeat 234 255 . . . Note=8 P02649 UniProtKB Region 80 255 . . . Note=8 X 22 AA approximate tandem repeats P02649 UniProtKB Region 158 168 . . . Note=LDL and other lipoprotein receptors binding;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:20030366,ECO:0000269|PubMed:2063194;Dbxref=PMID:20030366,PMID:2063194 P02649 UniProtKB Region 210 290 . . . 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C->R;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000303;evidence=ECO:0000269|PubMed:10903326,ECO:0000269|PubMed:11042151,ECO:0000269|PubMed:11447277,ECO:0000269|PubMed:12966036,ECO:0000269|PubMed:2280190,ECO:0000269|PubMed:2556398,ECO:0000269|PubMed:28111074,ECO:0000269|PubMed:2987927,ECO:0000269|PubMed:7891887,ECO:0000269|PubMed:7972031,ECO:0000269|PubMed:8071364,ECO:0000269|PubMed:8125051,ECO:0000269|PubMed:8287539,ECO:0000269|PubMed:8346443,ECO:0000269|PubMed:8367470,ECO:0000269|PubMed:8939961,ECO:0000269|PubMed:9360638,ECO:0000303|PubMed:7833947;Dbxref=dbSNP:rs429358,PMID:10903326,PMID:11042151,PMID:11447277,PMID:12966036,PMID:2280190,PMID:2556398,PMID:28111074,PMID:2987927,PMID:7833947,PMID:7891887,PMID:7972031,PMID:8071364,PMID:8125051,PMID:8287539,PMID:8346443,PMID:8367470,PMID:8939961,PMID:9360638 P02649 UniProtKB Natural variant 145 145 . . . ID=VAR_000653;Note=Found in a patient with hypercholesterolemia%3B uncertain significance%3B ApoE1 Weisgraber. G->D;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:26802169,ECO:0000269|PubMed:8287539;Dbxref=dbSNP:rs267606664,PMID:26802169,PMID:8287539 P02649 UniProtKB Natural variant 145 145 . . . ID=VAR_000654;Note=In HLPP3%3B ApoE3 Leiden%3B no effect on glycosylation. G->GEVQAMLG;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:2556398,ECO:0000269|PubMed:8468528;Dbxref=PMID:2556398,PMID:8468528 P02649 UniProtKB Natural variant 152 152 . . . ID=VAR_000655;Note=In ApoE2-type%3B no hyperlipidemia. R->Q;Ontology_term=ECO:0000303;evidence=ECO:0000303|PubMed:7833947;Dbxref=dbSNP:rs28931578,PMID:7833947 P02649 UniProtKB Natural variant 154 154 . . . ID=VAR_000657;Note=In HLPP3%3B ApoE2-type. R->C;Ontology_term=ECO:0000303;evidence=ECO:0000303|PubMed:7833947;Dbxref=dbSNP:rs121918393,PMID:7833947 P02649 UniProtKB Natural variant 154 154 . . . ID=VAR_000656;Note=In HLPP3%3B ApoE2 Christchurch%3B decreased binding to LDL receptor. R->S;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:22481068,ECO:0000269|PubMed:2831187,ECO:0000269|PubMed:8287539;Dbxref=dbSNP:rs121918393,PMID:22481068,PMID:2831187,PMID:8287539 P02649 UniProtKB Natural variant 160 160 . . . ID=VAR_000658;Note=In HLPP3%3B ApoE3**. R->C;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8287539;Dbxref=dbSNP:rs387906567,PMID:8287539 P02649 UniProtKB Natural variant 163 163 . . . ID=VAR_000659;Note=In HLPP3%3B also found in a patient with hypercholesterolemia%3B ApoE4 Philadelphia and ApoE2-type. R->C;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:11042151,ECO:0000269|PubMed:1674745,ECO:0000269|PubMed:26802169;Dbxref=dbSNP:rs769455,PMID:11042151,PMID:1674745,PMID:26802169 P02649 UniProtKB Natural variant 163 163 . . . ID=VAR_000660;Note=In HLPP3%3B uncertain significance%3B ApoEKochi. R->H;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:2101409;Dbxref=dbSNP:rs121918397,PMID:2101409 P02649 UniProtKB Natural variant 163 163 . . . ID=VAR_042735;Note=In LPG%3B ApoE2 Sendai%3B decreased binding to LDL receptor%3B induces intraglomerular deposition of ApoE-containing lipoproteins. R->P;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:10903326,ECO:0000269|PubMed:9176854;Dbxref=dbSNP:rs121918397,PMID:10903326,PMID:9176854 P02649 UniProtKB Natural variant 164 164 . . . ID=VAR_000662;Note=In HLPP3%3B ApoE1 Harrisburg%3B decreased binding to LDL receptor%3B probable dominant negative effect%3B decreased in vitro binding to heparin. K->E;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:7635945;Dbxref=dbSNP:rs121918394,PMID:7635945 P02649 UniProtKB Natural variant 164 164 . . . ID=VAR_000661;Note=In HLPP3%3B ApoE2**. K->Q;Dbxref=dbSNP:rs121918394 P02649 UniProtKB Natural variant 167 167 . . . ID=VAR_035015;Note=In SBHD%3B also found in patients with a diagnosis of familial combined hyperlipidemia. Missing;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:11095479,ECO:0000269|PubMed:16094309,ECO:0000269|PubMed:22481068,ECO:0000269|PubMed:22949395,ECO:0000269|PubMed:24267230,ECO:0000269|PubMed:26802169;Dbxref=PMID:11095479,PMID:16094309,PMID:22481068,PMID:22949395,PMID:24267230,PMID:26802169 P02649 UniProtKB Natural variant 170 170 . . . ID=VAR_000663;Note=In ApoE3*%3B decreased binding to LDL receptor. A->P;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:2831187,ECO:0000269|PubMed:6327682;Dbxref=dbSNP:rs267606662,PMID:2831187,PMID:6327682 P02649 UniProtKB Natural variant 176 176 . . . ID=VAR_000664;Note=In HLPP3%3B ApoE2%2C ApoE2 Fukuoka%2C ApoE1 Weisgraber and ApoE3**%3B ApoE3** is associated with HLPP3%3B changed protein structure%3B decreased binding to LDLR and other lipoprotein receptors%3B decreased in vitro binding to heparin%3B no effect on distribution among plasma lipoproteins. R->C;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:11042151,ECO:0000269|PubMed:12950167,ECO:0000269|PubMed:12966036,ECO:0000269|PubMed:2280190,ECO:0000269|PubMed:3243553,ECO:0000269|PubMed:7635945,ECO:0000269|PubMed:7994571,ECO:0000269|PubMed:8287539,ECO:0000269|PubMed:8756331;Dbxref=dbSNP:rs7412,PMID:11042151,PMID:12950167,PMID:12966036,PMID:2280190,PMID:3243553,PMID:7635945,PMID:7994571,PMID:8287539,PMID:8756331 P02649 UniProtKB Natural variant 228 317 . . . ID=VAR_081136;Note=In HLPP3%3B ApoE3 Washington. Missing;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:1361196;Dbxref=PMID:1361196 P02649 UniProtKB Natural variant 242 242 . . . ID=VAR_000665;Note=In ApoE2 Fukuoka. R->Q;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8664327;Dbxref=dbSNP:rs267606663,PMID:8664327 P02649 UniProtKB Natural variant 246 246 . . . ID=VAR_000666;Note=In ApoE2 Dunedin. R->C;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:2341812;Dbxref=dbSNP:rs121918395,PMID:2341812 P02649 UniProtKB Natural variant 254 254 . . . ID=VAR_000667;Note=In ApoE2 WG. V->E;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8488843;Dbxref=dbSNP:rs199768005,PMID:8488843 P02649 UniProtKB Natural variant 262 263 . . . ID=VAR_000668;Note=In HLPP3%3B ApoE7 Suita. EE->KK;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:2738044;Dbxref=PMID:2738044 P02649 UniProtKB Natural variant 269 269 . . . ID=VAR_000669;Note=In ApoE3 HB. R->G;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8488843,ECO:0000269|PubMed:9360638;Dbxref=dbSNP:rs267606661,PMID:8488843,PMID:9360638 P02649 UniProtKB Natural variant 270 270 . . . ID=VAR_000670;Note=In ApoE1 HE%3B requires 2 nucleotide substitutions. L->E;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8488843;Dbxref=PMID:8488843 P02649 UniProtKB Natural variant 292 292 . . . ID=VAR_000671;Note=In ApoE4 PD. R->H;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8488843;Dbxref=dbSNP:rs121918398,PMID:8488843 P02649 UniProtKB Natural variant 314 314 . . . ID=VAR_000672;Note=In ApoE4 HG. S->R;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8488843;Dbxref=dbSNP:rs28931579,PMID:8488843 P02649 UniProtKB Mutagenesis 79 79 . . . Note=Changes the plasma lipoprotein distribution of ApoE4 to the HDL. R->T;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8071364;Dbxref=PMID:8071364 P02649 UniProtKB Mutagenesis 127 127 . . . Note=No effect on plasma lipoprotein distribution. E->A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8071364;Dbxref=PMID:8071364 P02649 UniProtKB Mutagenesis 157 157 . . . Note=Increased binding to LDL receptor%3B when associated with A-167. S->R;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:2831187;Dbxref=PMID:2831187 P02649 UniProtKB Mutagenesis 158 158 . . . Note=Decreased binding to LDL receptor. H->A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:2831187;Dbxref=PMID:2831187 P02649 UniProtKB Mutagenesis 161 161 . . . Note=Decreased binding to LDL receptor. K->A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:2831187;Dbxref=PMID:2831187 P02649 UniProtKB Mutagenesis 162 162 . . . Note=Decreased binding to LDL receptor. L->P;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:2831187;Dbxref=PMID:2831187 P02649 UniProtKB Mutagenesis 167 167 . . . Note=Increased binding to LDL receptor%3B when associated with R-157. L->A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:2831187;Dbxref=PMID:2831187 P02649 UniProtKB Mutagenesis 168 168 . . . Note=Decreased binding to LDL receptor. R->A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:2831187;Dbxref=PMID:2831187 P02649 UniProtKB Mutagenesis 172 172 . . . Note=Restores the LDL receptor binding activity of ApoE2. D->A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8756331;Dbxref=PMID:8756331 P02649 UniProtKB Mutagenesis 212 212 . . . Note=Loss of O-glycosylation. T->A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:2498325;Dbxref=PMID:2498325 P02649 UniProtKB Beta strand 22 24 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:2KC3 P02649 UniProtKB Helix 31 39 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:2KC3 P02649 UniProtKB Turn 40 42 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:2KC3 P02649 UniProtKB Helix 43 60 . . . 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