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UniProtKB/Swiss-Prot P02526 (CRGB_BOVIN)
Last modified
November 4, 2008.
Version 87.
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Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (2) |
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Names and origin · Protein attributes · General annotation (Comments) · Ontologies · Sequence annotation (Features) · Sequences · References · Cross-references · Entry information · Relevant documents
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Gamma-crystallin B Alternative name(s): Gamma-B-crystallin Gamma-crystallin II | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Bos taurus (Bovine) | ||
| Taxonomic identifier | 9913 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Laurasiatheria › Cetartiodactyla › Ruminantia › Pecora › Bovidae › Bovinae › Bos |
Protein attributes
| Sequence length | 175 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Crystallins are the dominant structural components of the vertebrate eye lens. |
| Domain | Has a two-domain beta-structure, folded into four very similar Greek key motifs. |
| Sequence similarities | Belongs to the beta/gamma-crystallin family. Contains 4 beta/gamma crystallin 'Greek key' domains. |
Ontologies
Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Eye lens protein |
| Domain | Repeat |
| PTM | Glycation Glycoprotein Oxidation Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
Gene Ontology (GO) | |
| Molecular function | structural constituent of eye lens Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 175 | 174 | Gamma-crystallin B | PRO_0000057581 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 2 – 40 | 39 | Beta/gamma crystallin 'Greek key' 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 41 – 83 | 43 | Beta/gamma crystallin 'Greek key' 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 89 – 129 | 41 | Beta/gamma crystallin 'Greek key' 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 130 – 172 | 43 | Beta/gamma crystallin 'Greek key' 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 84 – 88 | 5 | Connecting peptide | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 69 | 1 | Susceptible to oxidation By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 70 | 1 | Susceptible to oxidation By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 63 | 1 | Phosphotyrosine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 66 | 1 | Phosphotyrosine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 3 | 1 | N-linked (Glc) (glycation); in vitro | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 19 ↔ 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 120 | 1 | T → S in CAA25518. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 3 – 9 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 10 – 12 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 13 – 19 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 27 – 29 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 34 – 41 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 43 – 48 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 49 – 51 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 52 – 58 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 60 – 65 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 66 – 69 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 72 – 74 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 78 – 81 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 90 – 96 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 97 – 99 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 100 – 106 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 113 – 117 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 124 – 130 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 132 – 137 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 138 – 140 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 141 – 147 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 149 – 152 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 155 – 158 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 167 – 170 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [3] | Wistow G. Submitted (JAN-2007) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Lens. |
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| [8] | "X-ray analysis of the eye lens protein gamma-II crystallin at 1.9-A resolution." Wistow G., Turnell B., Summers L., Slingsby C., Moss D., Miller L., Lindley P., Blundell T.L. J. Mol. Biol. 170:175-202(1983) [PubMed: 6631960] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.9 ANGSTROMS). |
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| [11] | "X-ray structures of three interface mutants of gammaB-crystallin from bovine eye lens." Palme S., Jaenicke R., Slingsby C. Protein Sci. 7:611-618(1998) [PubMed: 9541393] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.85 ANGSTROMS). |
| [12] | "Unusual domain pairing in a mutant of bovine lens gammaB-crystallin." Palme S., Jaenicke R., Slingsby C. J. Mol. Biol. 279:1053-1059(1998) [PubMed: 9642083] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.2 ANGSTROMS) OF MUTANT ALA-57. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| X01036 mRNA. Translation: CAA25518.1. M16894 mRNA. Translation: AAA30476.1. EF208024 mRNA. Translation: ABM97504.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | CYBOG. A29655. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001013612.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Bt.399 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSBTAG00000021770. Bos taurus. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 281720. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | bta:281720. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P02526. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001064. Crystallin. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.60.20.10. Crystallin. 2 hits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00030. Crystall. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR01367. BGCRYSTALLIN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00247. XTALbg. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50915. CRYSTALLIN_BETA_GAMMA. 4 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LinkHub | P02526. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | CRGB_BOVIN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P02526 Secondary accession number(s): A2TJU8 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


