Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot P02062 (HBB_HORSE)
Last modified
June 16, 2009.
Version 81.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (2) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Hemoglobin subunit beta Alternative name(s): Hemoglobin beta chain Beta-globin | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Equus caballus (Horse) | ||
| Taxonomic identifier | 9796 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Laurasiatheria › Perissodactyla › Equidae › Equus |
Protein attributes
| Sequence length | 146 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Involved in oxygen transport from the lung to the various peripheral tissues. |
| Subunit structure | Heterotetramer of two alpha chains and two beta chains. |
| Tissue specificity | Red blood cells. |
| Sequence similarities | Belongs to the globin family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Oxygen transport Transport |
| Ligand | Heme Iron Metal-binding |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | oxygen transport Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular component | hemoglobin complex Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Molecular function | heme binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro oxygen bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro oxygen transporter activityInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 146 | 146 | Hemoglobin subunit beta | PRO_0000052975 | ||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 63 | 1 | Iron (heme distal ligand) | |||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 92 | 1 | Iron (heme proximal ligand) | |||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 5 – 15 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 20 – 34 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 36 – 45 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 51 – 56 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 58 – 75 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 76 – 80 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 81 – 94 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 101 – 118 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 119 – 121 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 124 – 141 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 143 – 145 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Hemoglobins, XXXIII. Note on the sequence of the hemoglobins of the horse." Matsuda G., Maita T., Braunitzer G., Schrank B. Hoppe-Seyler's Z. Physiol. Chem. 361:1107-1116(1980) [PubMed: 7409745] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE. |
| [2] | "Amino acid sequences of some tryptic peptides from the beta-chain of horse hemoglobin." Smith D.B. Can. J. Biochem. 46:825-843(1968) [PubMed: 4876811] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 1-82 AND 117-146. |
| [3] | "Amide groups of some tryptic peptides from the beta-chain of horse hemoglobin." Smith D.B., Chung W.P. Can. J. Biochem. 48:1160-1164(1970) [PubMed: 5529282] [Abstract] Cited for: DETERMINATION OF AMIDES, PROTEIN SEQUENCE OF 52-54. |
| [4] | "Three-dimensional Fourier synthesis of horse oxyhaemoglobin at 2.8-A resolution: (1) X-ray analysis." Perutz M.F., Miurhead H., Cox J.M., Goaman L.C., Mathews F.S., McGandy E.L., Webb L.E. Nature 219:29-32(1968) [PubMed: 5659617] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.8 ANGSTROMS). |
| [5] | "Three-dimensional Fourier synthesis of horse oxyhaemoglobin at 2.8 A resolution: the atomic model." Perutz M.F., Muirhead H., Cox J.M., Goaman L.C. Nature 219:131-139(1968) [PubMed: 5659637] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.8 ANGSTROMS). |
| [6] | "The structure of horse methaemoglobin at 2.0-A resolution." Ladner R.C., Heidner E.J., Perutz M.F. J. Mol. Biol. 114:385-414(1977) [PubMed: 561852] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.0 ANGSTROMS). |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PIR | HBHO. B91688. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | XP_001504239.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSECAG00000010020. Equus caballus. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 100054109. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | ecb:100054109. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P02062. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | P02062. LPWLTTP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR012292. Globin. IPR000971. Globin_subset. IPR002337. Haemoglobin_b. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:1.10.490.10. Globin_related. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11442:SF7. Beta_haem. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00042. Globin. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00814. BETAHAEM. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS01033. GLOBIN. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | HBB_HORSE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P02062 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


