P01889 (1B07_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: HLA class I histocompatibility antigen, B-7 alpha chain Alternative name(s): MHC class I antigen B*7 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 362 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Involved in the presentation of foreign antigens to the immune system. |
| Subunit structure | Heterodimer of an alpha chain and a beta chain (beta-2-microglobulin). Interacts with human herpesvirus 8 MIR1 protein By similarity. Interacts with HTLV-1 accessory protein p12I. Ref.17 |
| Subcellular location | |
| Post-translational modification | Polyubiquitinated in a post ER compartment by interaction with human herpesvirus 8 MIR1 protein. This targets the protein for rapid degradation via the ubiquitin system By similarity. |
| Polymorphism | The following alleles of B-7 are known: B*07:02 (B7.2), B*07:03 (BPOT), B*07:04, B*07:05, B*07:06 (B7_L79), B*07:18 and B*07:24. The sequence shown is B*07:02. |
| Sequence similarities | Belongs to the MHC class I family. Contains 1 Ig-like C1-type (immunoglobulin-like) domain. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 24 | 24 | Ref.16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 25 – 362 | 338 | HLA class I histocompatibility antigen, B-7 alpha chain | PRO_0000018833 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 25 – 309 | 285 | Extracellular Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 310 – 333 | 24 | Helical; Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 334 – 362 | 29 | Cytoplasmic Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 209 – 295 | 87 | Ig-like C1-type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 25 – 114 | 90 | Alpha-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 115 – 206 | 92 | Alpha-2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 207 – 298 | 92 | Alpha-3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 299 – 309 | 11 | Connecting peptide | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 110 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 125 ↔ 188 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 227 ↔ 283 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 4 | 1 | M → T. Corresponds to variant rs1050458 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 9 | 1 | V → L. Corresponds to variant rs1050462 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 17 | 1 | L → V. Corresponds to variant rs1131165 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050334 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 35 | 1 | S → A. Corresponds to variant rs1131170 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050335 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 36 | 1 | V → M. Corresponds to variant rs1050486 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050336 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 48 | 1 | S → A. Corresponds to variant rs713031 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_061386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 48 | 1 | S → P. Corresponds to variant rs713031 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_061387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 48 | 1 | S → T. Corresponds to variant rs713031 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_061388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 65 | 1 | A → T. Ref.19 Corresponds to variant rs1050529 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 87 | 1 | N → D. Corresponds to variant rs1050570 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050338 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 87 | 1 | N → K. Corresponds to variant rs1065386 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_059467 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 93 – 95 | 3 | AQA → TNT in allele B*07:03. | VAR_016351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 97 | 1 | T → A. Corresponds to variant rs1050393 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 98 | 1 | D → Y. Corresponds to variant rs1131215 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_059468 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 101 | 1 | S → N. Corresponds to variant rs1050388 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050340 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 118 – 119 | 2 | TL → II in allele B*07:18. | VAR_016352 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 121 | 1 | S → R in allele B*07:18. | VAR_016353 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 137 | 1 | H → Y. Corresponds to variant rs1050379 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050341 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 138 | 1 | D → H. Corresponds to variant rs709055 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_061389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 138 | 1 | D → N in allele B*07:05 and allele B*07:06. | VAR_016354 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 155 | 1 | R → S. Corresponds to variant rs1050654 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 180 | 1 | R → D in allele B*07:04; requires 2 nucleotide substitutions. | VAR_016355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 187 | 1 | E → A. Corresponds to variant rs2308466 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_059469 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 187 | 1 | E → G. Corresponds to variant rs2308466 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_059470 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 187 | 1 | E → K. Corresponds to variant rs2523600 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_059471 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 187 | 1 | E → L in allele B*07:24; requires 2 nucleotide substitutions. | VAR_016616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 187 | 1 | E → Q. Corresponds to variant rs2523600 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_059472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 187 | 1 | E → V. Corresponds to variant rs2308466 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_059473 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 195 | 1 | Y → H. Corresponds to variant rs1050696 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 306 | 1 | V → I in allele B*07:05. Corresponds to variant rs1131500 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_016356 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 329 | 1 | A → T. Corresponds to variant rs1051488 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050344 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 349 | 1 | C → S. Corresponds to variant rs2308655 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_061390 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 349 | 1 | C → Y. Corresponds to variant rs2308655 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_061391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 15 – 18 | 4 | AALA → GPW in AAA59622. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 266 | 1 | Q → E AA sequence Ref.16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 268 | 1 | W → S in AAA59622. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 297 | 1 | R → G in AAA59622. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 314 – 315 | 2 | GL → RP in AAA59622. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 27 – 36 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 45 – 52 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 55 – 61 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 64 – 66 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 74 – 76 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 81 – 108 | 28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 118 – 127 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 133 – 142 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 145 – 150 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 157 – 161 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 162 – 173 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 176 – 185 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 187 – 198 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 200 – 203 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 210 – 235 | 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 238 – 243 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 249 – 251 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 252 – 254 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 261 – 263 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 265 – 274 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 278 – 280 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 281 – 286 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 290 – 292 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 294 – 296 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [1] | "Rapid cloning of HLA-A,B cDNA by using the polymerase chain reaction: frequency and nature of errors produced in amplification." Ennis P.D., Zemmour J., Salter R.D., Parham P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87:2833-2837(1990) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ALLELE B*07:02). |
| [2] | "Diversity of class I HLA molecules: functional and evolutionary interactions with T cells." Parham P., Benjamin R.J., Chen B.P., Clayberger C., Ennis P.D., Krensky A.M., Lawlor D.A., Littman D.R., Norment A.M., Orr H.T., Salter R.D., Zemmour J. Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 54:529-543(1989) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE (ALLELE B*07:02). |
| [3] | "Structure and polymorphism of class I MHC antigen mRNA." Sood A.K., Pan J., Biro P.A., Pereira D., Srivastava R., Reddy V.B., Duceman B.W., Weissman S.M. Immunogenetics 22:101-121(1985) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ALLELE B*07:02). |
| [4] | Ellexson M.E., Zhang L., Hildebrand W.H. Submitted (JUN-1995) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE (ALLELE B*07:02). |
| [5] | "Complete nucleotide sequence of HLA-B*0703, a B7-variant (BPOT)." Bergmans A., Tijssen H., Lardy J., Reekers P. Hum. Immunol. 38:159-162(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ALLELE B*07:03). |
| [6] | "Definition of a new HLA-B7 subtype (B*0704) by isoelectric focusing, family studies and DNA sequence analysis." Kubens B.S., Arnett K.L., Adams E.J., Parham P., Grosse-Wilde H. Tissue Antigens 45:322-327(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ALLELE B*07:04). |
| [7] | "Structure of a novel subtype of B7 (B*0705) isolated from a Chinese individual." Arnett K.L., Adams E.J., Domena J.D., Parham P. Tissue Antigens 44:318-321(1994) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ALLELE B*07:05). |
| [8] | "Alloreactive cytotoxic T-lymphocyte-defined HLA-B7 subtypes differ in peptide antigen presentation." Smith K.D., Epperson D.F., Lutz C.T. Immunogenetics 43:27-37(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ALLELES B*07:03 AND B*07:05). |
| [9] | "Haplotypic association of two new HLA class I alleles: Cw*15052 and B*0706: evolutionary relationships of HLA-Cw*15 alleles." Sanz L., Vilches C., de Pablo R., Bunce M., Moreno M.E., Kreisler M. Tissue Antigens 47:329-332(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ALLELE B*07:06). |
| [10] | "A new HLA-B allele." Bettinotti M.P., Hadzikadic L., Dhillon G., Barracchini K., Marincola F.M. Submitted (SEP-1999) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE (ALLELE B*07:18). |
| [11] | "Intron sequences of HLA class I." Marsh S.G.E. Submitted (MAR-2001) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE (ALLELE B*07:02). |
| [12] | "Cloning and sequencing full-length HLA-B and -C genes." Cox S.T., McWhinnie A.J., Robinson J., Marsh S.G.E., Parham P., Madrigal J.A., Little A.-M. Tissue Antigens 61:20-48(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE (ALLELE B*07:02). Tissue: Blood. |
| [13] | "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs." Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., Otsuki T., Sugiyama T., Irie R., Wakamatsu A., Hayashi K., Sato H., Nagai K., Kimura K., Makita H., Sekine M., Obayashi M., Nishi T., Shibahara T., Tanaka T., Ishii S. Sugano S.Nat. Genet. 36:40-45(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Subthalamic nucleus. |
| [14] | "The DNA sequence and analysis of human chromosome 6." Mungall A.J., Palmer S.A., Sims S.K., Edwards C.A., Ashurst J.L., Wilming L., Jones M.C., Horton R., Hunt S.E., Scott C.E., Gilbert J.G.R., Clamp M.E., Bethel G., Milne S., Ainscough R., Almeida J.P., Ambrose K.D., Andrews T.D. Beck S.Nature 425:805-811(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [15] | "Characterisation of a new HLA-B allele, HLA-B*0724." Middleton D., Curran M.D., Anholts J.D., Reilly E.R., Schreuder G.M. Tissue Antigens 57:471-473(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 26-206 (ALLELE B*07:24). Tissue: Peripheral blood. |
| [16] | "Complete amino acid sequence of a papain-solubilized human histocompatibility antigen, HLA-B7. 2. Sequence determination and search for homologies." Orr H.T., Lopez de Castro J.A., Lancet D., Strominger J.L. Biochemistry 18:5711-5720(1979) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 25-295 (B*07:02). |
| [17] | "Free major histocompatibility complex class I heavy chain is preferentially targeted for degradation by human T-cell leukemia/lymphotropic virus type 1 p12(I) protein." Johnson J.M., Nicot C., Fullen J., Ciminale V., Casareto L., Mulloy J.C., Jacobson S., Franchini G. J. Virol. 75:6086-6094(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH HTLV-1 ACCESSORY PROTEIN P12I. |
| [18] | "Glycoproteomics analysis of human liver tissue by combination of multiple enzyme digestion and hydrazide chemistry." Chen R., Jiang X., Sun D., Han G., Wang F., Ye M., Wang L., Zou H. J. Proteome Res. 8:651-661(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-110, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Liver. |
| [19] | "Initial characterization of the human central proteome." Burkard T.R., Planyavsky M., Kaupe I., Breitwieser F.P., Buerckstuemmer T., Bennett K.L., Superti-Furga G., Colinge J. BMC Syst. Biol. 5:17-17(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANT [LARGE SCALE ANALYSIS] THR-65, MASS SPECTROMETRY. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | M32317 mRNA. Translation: AAA36230.1. M16102 mRNA. Translation: AAA59622.1. Sequence problems. U29057 mRNA. Translation: AAA91229.1. X64454 mRNA. Translation: CAA45785.1. U04245 mRNA. Translation: AAA87398.1. L33922 mRNA. Translation: AAA65639.1. U21052 mRNA. Translation: AAA92563.1. U21053 mRNA. Translation: AAA92564.1. X91749 mRNA. Translation: CAA62864.1. AF189017 mRNA. Translation: AAF01052.1. AJ309047 Genomic DNA. Translation: CAC35468.1. AJ292075 Genomic DNA. Translation: CAC33440.1. AL671883 Genomic DNA. Translation: CAI18148.1. AK313911 mRNA. Translation: BAG36634.1. AJ401222 Genomic DNA. Translation: CAC10402.1. | ||||||||||||
| IPI | IPI00004657. | ||||||||||||
| PIR | HLHUB7. B35997. I54418. I59651. S60601. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_005505.2. NM_005514.6. | ||||||||||||
| UniGene | Hs.654404. Hs.77961. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | P01889. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| IntAct | P01889. 4 interactions. | ||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||
| DMDM | 122162. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PaxDb | P01889. | ||||||||||||
| PRIDE | P01889. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENST00000412585; ENSP00000399168; ENSG00000234745. | ||||||||||||
| GeneID | 3106. | ||||||||||||
| KEGG | hsa:3106. | ||||||||||||
| UCSC | uc003ntg.1. human. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CTD | 3106. | ||||||||||||
| GeneCards | GC06M031321. | ||||||||||||
| HGNC | HGNC:4932. HLA-B. | ||||||||||||
| HPA | CAB015418. | ||||||||||||
| MIM | 142830. gene. | ||||||||||||
| neXtProt | NX_P01889. | ||||||||||||
| PharmGKB | PA35056. | ||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | NOG42056. | ||||||||||||
| HOVERGEN | HBG016709. | ||||||||||||
| KO | K06751. | ||||||||||||
| OMA | WEAARWA. | ||||||||||||
| OrthoDB | EOG4F4SBG. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| Reactome | REACT_6900. Immune System. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | P01889. | ||||||||||||
| Bgee | P01889. | ||||||||||||
| CleanEx | HS_HLA-B. | ||||||||||||
| Genevestigator | P01889. | ||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000204523. Homo sapiens. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| Gene3D | 2.60.40.10. 1 hit. 3.30.500.10. 1 hit. | ||||||||||||
| InterPro | IPR007110. Ig-like_dom. IPR013783. Ig-like_fold. IPR003006. Ig/MHC_CS. IPR003597. Ig_C1-set. IPR011161. MHC_I-like_Ag-recog. IPR011162. MHC_I/II-like_Ag-recog. IPR001039. MHC_I_a_a1/a2. IPR010579. MHC_I_a_C. [Graphical view] | ||||||||||||
| Pfam | PF07654. C1-set. 1 hit. PF00129. MHC_I. 1 hit. PF06623. MHC_I_C. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PRINTS | PR01638. MHCCLASSI. | ||||||||||||
| SMART | SM00407. IGc1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF54452. MHC_I/II-like_Ag-recog. 1 hit. | ||||||||||||
| PROSITE | PS50835. IG_LIKE. 1 hit. PS00290. IG_MHC. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| ChiTaRS | HLA-B. human. | ||||||||||||
| GenomeRNAi | 3106. | ||||||||||||
| NextBio | 12323. | ||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | 1B07_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P01889 Secondary accession number(s): Q29638 Q9TP95 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
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