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UniProtKB/Swiss-Prot P01631 (KV2A7_MOUSE)
Last modified
October 13, 2009.
Version 69.
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Ig kappa chain V-II region 26-10 |
| Organism | Mus musculus (Mouse) |
| Taxonomic identifier | 10090 [NCBI] |
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Glires › Rodentia › Sciurognathi › Muroidea › Muridae › Murinae › Mus |
Protein attributes
| Sequence length | 113 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Miscellaneous | This chain was isolated from an IgG2a hybridoma protein that binds digoxin. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Domain | Immunoglobulin V region Immunoglobulin domain |
| Molecular function | Monoclonal antibody |
| PTM | Disulfide bond |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing Hybridoma |
| Gene Ontology (GO) | |
| Molecular function | antigen binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – ›113 | ›113 | Ig kappa chain V-II region 26-10 | PRO_0000059776 | ||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 1 – 23 | 23 | Framework-1 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 24 – 39 | 16 | Complementarity-determining-1 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 40 – 54 | 15 | Framework-2 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 55 – 61 | 7 | Complementarity-determining-2 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 62 – 93 | 32 | Framework-3 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 94 – 102 | 9 | Complementarity-determining-3 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 103 – 112 | 10 | Framework-4 | |||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 23 ↔ 93 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-terminal residue | 113 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 4 – 7 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 9 – 13 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 19 – 27 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 38 – 43 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 50 – 54 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 55 – 57 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 67 – 71 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 73 – 82 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 85 – 87 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 89 – 95 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 97 – 100 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 107 – 111 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
References
| [1] | "Amino acid sequence of the light chain variable region from a mouse anti-digoxin hybridoma antibody." Novotny J., Margolies M.N. Biochemistry 22:1153-1158(1983) [PubMed: 6404298] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE. Strain: A/J. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| IPI | IPI00464378. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | KVMS26. A01914. A32248. B32248. C32248. F32530. H31485. PH1030. PH1031. S53750. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.304143 Mm.333124 Mm.389773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P01631. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P01631. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P01631. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P01631. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR007110. Ig-like. IPR013783. Ig-like_fold. IPR013106. Ig_V-set. IPR003596. Ig_V-set_sub. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.60.40.10. Ig-like_fold. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF07686. V-set. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00406. IGv. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50835. IG_LIKE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00693. Fluorescein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | KV2A7_MOUSE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P01631 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||

Clusters with


