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UniProtKB/Swiss-Prot P01215 (GLHA_HUMAN)
Last modified
December 15, 2009.
Version 112.
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Documents (5) |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Glycoprotein hormones alpha chain Alternative name(s): Anterior pituitary glycoprotein hormones common subunit alpha Follitropin alpha chain Follicle-stimulating hormone alpha chain Short name=FSH-alpha Lutropin alpha chain Luteinizing hormone alpha chain LSH-alpha Thyrotropin alpha chain Thyroid-stimulating hormone alpha chain Short name=TSH-alpha Choriogonadotropin alpha chain Chorionic gonadotrophin subunit alpha Short name=CG-alpha | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 116 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Subunit structure | Heterodimer of a common alpha chain and a unique beta chain which confers biological specificity to thyrotropin, lutropin, follitropin and gonadotropin. |
| Subcellular location | |
| Sequence similarities | Belongs to the glycoprotein hormones subunit alpha family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Secreted |
| Domain | Signal |
| Molecular function | Hormone |
| PTM | Disulfide bond Glycoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | G-protein coupled receptor protein signaling pathway Inferred from Experiment. Source: Reactome |
| Cellular component | extracellular region Ref.13 Inferred from Experiment. Source: Reactome soluble fraction Ref.1Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Molecular function | hormone activity Ref.1 Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 24 | 24 | Ref.9 Ref.11 Ref.12 Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||
| Chain | 25 – 116 | 92 | Glycoprotein hormones alpha chain | PRO_0000011640 | |||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 76 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.18 | CAR_000036 | |||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 102 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.18 | CAR_000037 | |||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 31 ↔ 55 | Ref.18 Ref.13 Ref.14 Ref.16 | |||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 34 ↔ 84 | Ref.18 Ref.13 Ref.14 Ref.16 | |||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 52 ↔ 106 | Ref.18 Ref.13 Ref.14 Ref.16 | |||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 56 ↔ 108 | Ref.18 Ref.13 Ref.14 Ref.16 | |||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 83 ↔ 111 | Ref.18 Ref.13 Ref.14 Ref.16 | |||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 29 | 1 | Q → E AA sequence Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 108 – 109 | 2 | CS → SC Ref.6 | ||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 108 – 109 | 2 | CS → SC Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 35 – 38 | 4 | |||||||||||||||||||||||||
| Turn | 40 – 42 | 3 | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 50 – 62 | 13 | |||||||||||||||||||||||||
| Helix | 65 – 70 | 6 | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 76 – 80 | 5 | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 84 – 89 | 6 | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 92 – 94 | 3 | |||||||||||||||||||||||||
| Turn | 95 – 97 | 3 | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 98 – 100 | 3 | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 103 – 108 | 6 | |||||||||||||||||||||||||
Sequences
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| J00152, J00150, J00151 Genomic DNA. Translation: AAD13690.1. S70585, S70583, S70584 Genomic DNA. Translation: AAB30827.1. BC020782 mRNA. Translation: AAH20782.1. BC055080 mRNA. Translation: AAH55080.1. V00518 mRNA. Translation: CAA23777.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00000833. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | TTHUAP. A93213. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000726.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.119689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-6182N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P01215. 2 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P01215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GlycoSuiteDB | P01215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P01215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P01215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000369582; ENSP00000358595; ENSG00000135346; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 1081. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:1081. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc003plj.1. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 1081. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC06M087851. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0006048. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:1885. CGA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB023350. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 118850. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA26433. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG269421. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P01215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P01215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | DGEFTMQ. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG92FW3Z. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_14797. Signaling by GPCR. REACT_15314. Hormone biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P01215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P01215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_CGA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P01215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000135346. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000476. Glyco_hormone. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11509. Glyco_hormone. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00236. Hormone_6. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00274. GLYCOHORMONE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00067. GHA. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00779. GLYCO_HORMONE_ALPHA_1. 1 hit. PS00780. GLYCO_HORMONE_ALPHA_2. 1 hit. PS50277. GLYCO_HORMONE_ALPHA_3. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 4504. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | GLHA_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P01215 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 6 Human chromosome 6: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| Protein Spotlight Protein Spotlight articles and cited UniProtKB/Swiss-Prot entries |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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