P00966 (ASSY_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Argininosuccinate synthase EC=6.3.4.5 Alternative name(s): Citrulline--aspartate ligase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 412 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Is indirectly involved in the control of blood pressure By similarity. |
| Catalytic activity | ATP + L-citrulline + L-aspartate = AMP + diphosphate + N(omega)-(L-arginino)succinate. |
| Pathway | |
| Subunit structure | |
| Involvement in disease | Citrullinemia 1 (CTLN1) [MIM:215700]: The classic form of citrullinemia, an autosomal recessive disease characterized primarily by elevated serum and urine citrulline levels. Ammonia intoxication is another manifestation. It is a disorder of the urea cycle, usually manifesting in the first few days of life. Affected infants appear normal at birth, but as ammonia builds up in the body they present symptoms such as lethargy, poor feeding, vomiting, seizures and loss of consciousness. Less commonly, a milder form can develop later in childhood or adulthood. |
| Sequence similarities | Belongs to the argininosuccinate synthase family. Type 1 subfamily. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Amino-acid biosynthesis Arginine biosynthesis Urea cycle |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Disease | Disease mutation |
| Ligand | ATP-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Ligase |
| PTM | Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | arginine biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-UniPathway urea cycleTraceable author statement. Source: Reactome |
| Cellular_component | cytosol Traceable author statement. Source: Reactome |
| Molecular_function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW argininosuccinate synthase activityInferred from experiment. Source: Reactome |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| ARAF | P10398 | 4 | EBI-536842,EBI-365961 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 412 | 412 | Argininosuccinate synthase | PRO_0000148554 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 10 – 18 | 9 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 115 – 123 | 9 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 36 | 1 | ATP; via amide nitrogen and carbonyl oxygen By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 87 | 1 | Citrulline | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 92 | 1 | Citrulline | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 119 | 1 | Aspartate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 123 | 1 | Aspartate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 123 | 1 | Citrulline | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 124 | 1 | Aspartate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 127 | 1 | Citrulline | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 180 | 1 | Citrulline | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 189 | 1 | Citrulline | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 270 | 1 | Citrulline | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 282 | 1 | Citrulline | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 180 | 1 | Phosphoserine Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 219 | 1 | Phosphothreonine Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 14 | 1 | G → S in CTLN1. Ref.14 Ref.20 | VAR_000681 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 18 | 1 | S → L in CTLN1. Ref.15 | VAR_000682 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 19 | 1 | C → R in CTLN1. Ref.19 | VAR_015891 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 40 | 1 | Q → L in CTLN1. Ref.20 | VAR_058337 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 65 | 1 | S → I. Corresponds to variant rs2229556 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050427 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 69 | 1 | V → A in CTLN1. Ref.18 | VAR_016013 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 79 | 1 | S → P in CTLN1. | VAR_058338 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 86 | 1 | R → C in CTLN1. Ref.15 | VAR_000683 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 86 | 1 | R → H in CTLN1. Ref.19 | VAR_015892 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 95 | 1 | R → S in CTLN1. Ref.19 | VAR_015893 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 96 | 1 | P → H in CTLN1. | VAR_058339 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 96 | 1 | P → S in CTLN1. Ref.19 | VAR_015894 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 108 | 1 | R → L in CTLN1. Ref.3 Ref.18 Corresponds to variant rs35269064 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_016014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 117 | 1 | G → D in CTLN1. Ref.18 Ref.19 | VAR_015896 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 117 | 1 | G → S in CTLN1. Ref.19 | VAR_015895 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 118 | 1 | A → T in CTLN1. Ref.16 | VAR_000684 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 119 | 1 | T → I in CTLN1. Ref.18 | VAR_016015 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 124 | 1 | D → N in CTLN1. Ref.21 | VAR_058340 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 127 | 1 | R → Q in CTLN1. Ref.20 | VAR_058341 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 127 | 1 | R → W in CTLN1; severe clinical course. | VAR_058342 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 157 | 1 | R → C in CTLN1. Ref.19 | VAR_015897 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 157 | 1 | R → H in CTLN1. Ref.14 Ref.21 | VAR_000685 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 160 | 1 | L → P in CTLN1. | VAR_058343 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 179 | 1 | W → R in CTLN1; mild. Ref.3 Ref.19 Ref.20 | VAR_015898 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 180 | 1 | S → N in CTLN1. Ref.14 | VAR_000686 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 190 | 1 | Y → D in CTLN1. Ref.20 | VAR_058344 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 191 | 1 | E → K in CTLN1. Ref.19 | VAR_015899 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 191 | 1 | E → Q in CTLN1. | VAR_058345 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 192 | 1 | A → V in CTLN1. Ref.16 | VAR_000687 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 202 | 1 | A → E in CTLN1. | VAR_058346 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 206 | 1 | L → P in CTLN1. | VAR_058347 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 263 | 1 | V → M in CTLN1; mild clinical course. Ref.20 | VAR_058348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 265 | 1 | R → C in CTLN1; severe clinical course. | VAR_058349 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 265 | 1 | R → H in CTLN1. Ref.19 | VAR_015900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 269 | 1 | V → M in CTLN1. Ref.19 Ref.20 | VAR_015901 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 270 | 1 | E → Q in CTLN1. Ref.18 Ref.21 | VAR_016007 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 272 | 1 | R → C in CTLN1. Ref.16 Ref.19 | VAR_000688 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 277 | 1 | K → T in CTLN1. | VAR_058350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 279 | 1 | R → Q in CTLN1. Ref.21 | VAR_016008 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 280 | 1 | G → R in CTLN1. Ref.16 | VAR_000689 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 283 | 1 | E → K in CTLN1. Ref.19 Ref.21 | VAR_015902 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 284 | 1 | T → I in CTLN1; mild clinical course. | VAR_058351 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 291 | 1 | Y → S in CTLN1. | VAR_058352 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 296 | 1 | D → G in CTLN1. | VAR_058353 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 302 | 1 | M → V in CTLN1. | VAR_058354 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 304 | 1 | R → W in CTLN1. Ref.14 Ref.16 Ref.19 | VAR_000690 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 307 | 1 | R → C in CTLN1. | VAR_058355 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 310 | 1 | K → Q in CTLN1. Ref.19 | VAR_016009 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 310 | 1 | K → R in CTLN1. | VAR_015903 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 324 | 1 | G → S in CTLN1. Ref.14 Ref.19 Ref.20 Ref.21 | VAR_000691 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 324 | 1 | G → V in CTLN1. | VAR_058356 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 341 | 1 | S → F in CTLN1. | VAR_058357 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 345 | 1 | V → G in CTLN1. | VAR_058358 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 347 | 1 | G → R in CTLN1; severe clinical course. | VAR_058359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 359 | 1 | Y → D in CTLN1; mild clinical course. | VAR_058360 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 362 | 1 | G → V in CTLN1; mild. Ref.3 Ref.19 Ref.20 | VAR_015904 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 363 | 1 | R → G in CTLN1. Ref.21 | VAR_016010 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 363 | 1 | R → L in CTLN1. Ref.16 | VAR_000692 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 363 | 1 | R → Q in CTLN1. Ref.19 | VAR_016011 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 363 | 1 | R → W in CTLN1. Ref.14 Ref.19 | VAR_000693 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 389 | 1 | T → I in CTLN1. Ref.19 | VAR_016012 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 390 | 1 | G → R in CTLN1. Ref.3 Ref.14 Ref.18 Ref.19 Ref.21 | VAR_000694 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 325 – 327 | 3 | FWH → LRP in CAA25771. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 325 – 327 | 3 | FWH → LRP in AAA51783. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 5 – 10 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 15 – 26 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 29 – 39 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 44 – 54 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 57 – 63 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 65 – 71 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 73 – 78 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 84 – 86 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 90 – 93 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 94 – 109 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 112 – 115 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 124 – 135 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 140 – 142 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 144 – 146 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 148 – 151 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 158 – 166 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 181 – 183 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 188 – 190 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 193 – 196 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 204 – 206 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 213 – 215 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 221 – 228 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 231 – 237 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 238 – 240 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 247 – 261 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 265 – 271 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 277 – 283 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 285 – 301 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 304 – 323 | 20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 326 – 328 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 329 – 341 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 342 – 344 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 347 – 354 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 357 – 364 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 372 – 375 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 385 – 404 | 20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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