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UniProtKB/Swiss-Prot P00950 (PMG1_YEAST)
Last modified
June 16, 2009.
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Phosphoglycerate mutase 1 Short name=PGAM 1 EC=5.4.2.1 Alternative name(s): Phosphoglyceromutase 1 MPGM 1 BPG-dependent PGAM 1 | ||||||||
| Gene names |
| ||||||||
| Organism | Saccharomyces cerevisiae (Baker's yeast) [Complete proteome] | ||||||||
| Taxonomic identifier | 4932 [NCBI] | ||||||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Fungi › Dikarya › Ascomycota › Saccharomycotina › Saccharomycetes › Saccharomycetales › Saccharomycetaceae › Saccharomyces |
Protein attributes
| Sequence length | 247 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Interconversion of 3- and 2-phosphoglycerate with 2,3-bisphosphoglycerate as the primer of the reaction. Can also Catalyze the reaction of EC 5.4.2.4 (synthase) and EC 3.1.3.13 (phosphatase), but with a reduced activity. |
| Catalytic activity | 2-phospho-D-glycerate = 3-phospho-D-glycerate. |
| Pathway | Carbohydrate degradation; glycolysis; pyruvate from D-glyceraldehyde 3-phosphate: step 3/5. |
| Subunit structure | Homotetramer. |
| Miscellaneous | Present with 172000 molecules/cell in log phase SD medium. Ref.9 |
| Sequence similarities | Belongs to the phosphoglycerate mutase family. BPG-dependent PGAM subfamily. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Glycolysis |
| Molecular function | Isomerase |
| PTM | Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | gluconeogenesis Inferred from mutant phenotype. Source: SGD glycolysisInferred from mutant phenotype. Source: SGD |
| Cellular component | cytosol Inferred from direct assay. Source: SGD mitochondrionInferred from direct assay. Source: SGD |
| Molecular function | phosphoglycerate mutase activity Inferred from direct assay. Source: SGD protein bindingInferred from physical interaction. Source: IntAct |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed Ref.1 Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 247 | 246 | Phosphoglycerate mutase 1 | PRO_0000179839 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 233 – 242 | 10 | Ala-rich | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 9 | 1 | Tele-phosphohistidine intermediate Ref.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 182 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 60 | 1 | Interaction with carboxyl group of phosphoglycerates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 12 | 1 | Phosphoserine Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 116 | 1 | Phosphoserine Ref.11 Ref.10 Ref.12 Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 127 | 1 | Phosphoserine Ref.12 Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 128 | 1 | Phosphoserine Ref.11 Ref.12 Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 131 | 1 | Phosphoserine Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 185 | 1 | Phosphoserine Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 197 | 1 | Phosphoserine Ref.12 Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 3 – 8 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 13 – 16 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 30 – 45 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 51 – 55 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 59 – 71 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 79 – 81 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 83 – 85 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 91 – 93 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 98 – 115 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 136 – 138 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 143 – 145 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 152 – 165 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 167 – 172 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 177 – 181 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 183 – 194 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 198 – 200 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 201 – 203 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 212 – 216 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 222 – 224 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 227 – 230 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 231 – 233 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| X06408 Genomic DNA. Translation: CAA29698.1. X58789 Genomic DNA. Translation: CAA41595.1. Z26877 Genomic DNA. Translation: CAA81501.1. Z28152 Genomic DNA. Translation: CAA81994.1. S57976 Genomic DNA. Translation: AAB26026.1. Different termination. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | PMBYY. S00358. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_012770.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP:6260N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P00950. 23 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2-D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SWISS-2DPAGE | P00950. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COMPLUYEAST-2DPAGE | P00950. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P00950. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P00950. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | YKL152C. Saccharomyces cerevisiae. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 853705. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus YKL152C in contig Y13137_GR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | sce:YKL152C. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|4932.3.peg.3749. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CYGD | YKL152c. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SGD | S000001635. GPM1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Yeast-GFP | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | P00950. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | P00950. PMRFLGD. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 5.4.2.1. 250. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | YKL152C. Saccharomyces cerevisiae. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001345. PG/BPGM_mutase. IPR013078. PG_mutase. IPR005952. Phosphogly_mut1. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11931. Phosphogly_mut1. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00300. PGAM. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01258. pgm_1. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00175. PG_MUTASE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 974701. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | PMG1_YEAST | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P00950 Secondary accession number(s): Q02117 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | FPAP (Fungal Proteome Annotation Project) | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |
| Yeast Yeast (Saccharomyces cerevisiae): entries, gene names and cross-references to SGD |
| Yeast chromosome XI Yeast (Saccharomyces cerevisiae) chromosome XI: entries and gene names |

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