P00736 (C1R_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 29, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Complement C1r subcomponent EC=3.4.21.41 Alternative name(s): Complement component 1 subcomponent r Cleaved into the following 2 chains: | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 705 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | C1r B chain is a serine protease that combines with C1q and C1s to form C1, the first component of the classical pathway of the complement system. |
| Catalytic activity | Selective cleavage of Lys(or Arg)-|-Ile bond in complement subcomponent C1s to form the active form of C1s (EC 3.4.21.42). |
| Subunit structure | C1 is a calcium-dependent trimolecular complex of C1q, C1r and C1s in the molar ration of 1:2:2. C1r is a dimer of identical chains, each of which is activated by cleavage into two chains, A and B, connected by disulfide bonds. |
| Post-translational modification | The iron and 2-oxoglutarate dependent 3-hydroxylation of aspartate and asparagine is (R) stereospecific within EGF domains. |
| Polymorphism | Complement component C1r deficiency [MIM:216950] leads to the failure of the classical complement system activation pathway (C1 deficiency). Individuals with C1 deficiency are highly susceptible to infections by microorganisms and have greater risk in developing autoimmune diseases such as systemic lupus erythematosus (SLE). |
| Sequence similarities | Belongs to the peptidase S1 family. Contains 2 CUB domains. Contains 1 EGF-like domain. Contains 1 peptidase S1 domain. Contains 2 Sushi (CCP/SCR) domains. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Complement pathway Immunity Innate immunity |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Domain | EGF-like domain Repeat Signal Sushi |
| Molecular function | Hydrolase Protease Serine protease |
| PTM | Disulfide bond Glycoprotein Hydroxylation Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | complement activation, classical pathway Traceable author statement. Source: Reactome innate immune responseTraceable author statement. Source: Reactome proteolysisInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular_component | extracellular region Non-traceable author statement PubMed 14718574. Source: UniProtKB |
| Molecular_function | calcium ion binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro serine-type endopeptidase activityInferred from experiment. Source: Reactome |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| C1S | P09871 | 3 | EBI-3926504,EBI-2810045 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 17 | 17 | Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 18 – 705 | 688 | Complement C1r subcomponent | PRO_0000027577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 18 – 463 | 446 | Complement C1r subcomponent heavy chain | PRO_0000027578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 464 – 705 | 242 | Complement C1r subcomponent light chain | PRO_0000027579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 18 – 141 | 124 | CUB 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 142 – 190 | 49 | EGF-like; calcium-binding Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 193 – 305 | 113 | CUB 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 307 – 373 | 67 | Sushi 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 374 – 449 | 76 | Sushi 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 464 – 702 | 239 | Peptidase S1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 502 | 1 | Charge relay system | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 557 | 1 | Charge relay system | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 654 | 1 | Charge relay system | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 167 | 1 | (3R)-3-hydroxyasparagine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 206 | 1 | Phosphoserine; by CK2 Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 125 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 221 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 514 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.11 Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 581 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 71 ↔ 89 | Probable | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 146 ↔ 165 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 161 ↔ 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 176 ↔ 189 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 193 ↔ 220 | Probable | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 250 ↔ 268 | Probable | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 309 ↔ 358 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 338 ↔ 371 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 376 ↔ 429 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 406 ↔ 447 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 451 ↔ 577 | Interchain (between heavy and light chains) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 620 ↔ 639 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 650 ↔ 680 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 131 | 1 | Y → H. Ref.3 | VAR_018667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 152 | 1 | S → L Common polymorphism. Ref.2 Ref.3 Ref.6 Ref.16 Corresponds to variant rs1801046 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_016103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 163 | 1 | H → Y. Ref.3 | VAR_018668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 184 | 1 | E → K Polymorphism confirmed at protein level. Ref.3 Ref.17 Corresponds to variant rs1126605 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_018669 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 186 | 1 | T → R. Ref.1 Ref.2 Ref.3 Ref.6 Corresponds to variant rs4519167 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_047933 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 261 | 1 | G → R Polymorphism confirmed at protein level. Ref.3 Ref.17 Corresponds to variant rs3813728 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_018670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 145 – 147 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 150 – 152 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 156 – 158 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 162 – 168 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 171 – 175 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 319 – 323 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 326 – 328 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 333 – 338 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 342 – 348 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 350 – 352 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 354 – 358 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 364 – 366 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 370 – 373 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 385 – 392 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 401 – 406 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 408 – 410 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 411 – 413 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 426 – 429 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 433 – 436 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 438 – 442 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 447 – 449 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 478 – 492 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 493 – 495 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 496 – 499 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 501 – 503 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 519 – 522 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 526 – 532 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 537 – 542 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 548 – 552 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 559 – 565 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 571 – 573 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 582 – 585 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 590 – 595 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 600 – 603 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 608 – 614 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 617 – 626 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 637 – 641 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 643 – 650 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 651 – 655 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 657 – 662 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 663 – 666 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 667 – 676 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 678 – 683 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 685 – 689 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 690 – 692 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 694 – 702 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [1] | "Nucleotide sequence of the cDNA coding for human complement C1r." Leytus S.P., Kurachi K., Sakariassen K.S., Davie E.W. Biochemistry 25:4855-4863(1986) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], VARIANT ARG-186. |
| [2] | "Cloning and sequencing of full-length cDNA encoding the precursor of human complement component C1r." Journet A., Tosi M. Biochem. J. 240:783-787(1986) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], VARIANTS LEU-152 AND ARG-186. |
| [3] | "The human complement component C1R gene: the exon-intron structure and the molecular basis of allelic diversity." Nakagawa M., Yuasa I., Irizawa Y., Umetsu K. Ann. Hum. Genet. 67:207-215(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], VARIANTS HIS-131; LEU-152; TYR-163; LYS-184; ARG-186 AND ARG-261. |
| [4] | "The full-ORF clone resource of the German cDNA consortium." Bechtel S., Rosenfelder H., Duda A., Schmidt C.P., Ernst U., Wellenreuther R., Mehrle A., Schuster C., Bahr A., Bloecker H., Heubner D., Hoerlein A., Michel G., Wedler H., Koehrer K., Ottenwaelder B., Poustka A., Wiemann S., Schupp I. BMC Genomics 8:399-399(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Colon endothelium. |
| [5] | "The finished DNA sequence of human chromosome 12." Scherer S.E., Muzny D.M., Buhay C.J., Chen R., Cree A., Ding Y., Dugan-Rocha S., Gill R., Gunaratne P., Harris R.A., Hawes A.C., Hernandez J., Hodgson A.V., Hume J., Jackson A., Khan Z.M., Kovar-Smith C., Lewis L.R. Gibbs R.A.Nature 440:346-351(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [6] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA], VARIANTS LEU-152 AND ARG-186. Tissue: Skin. |
| [7] | "Complete amino acid sequence of the A chain of human complement-classical-pathway enzyme C1r." Arlaud G.J., Willis A.C., Gagnon J. Biochem. J. 241:711-720(1987) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 18-463. |
| [8] | "Complete amino acid sequence of the catalytic chain of human complement subcomponent C1-r." Arlaud G.J., Gagnon J. Biochemistry 22:1758-1764(1983) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 464-705. |
| [9] | "Identification of erythro-beta-hydroxyasparagine in the EGF-like domain of human C1r." Arlaud G.J., van Dorsselaer A., Bell A., Mancini M., Aude C., Gagnon J. FEBS Lett. 222:129-134(1987) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 152-186, HYDROXYLATION. |
| [10] | "Identification of a cryptic protein kinase CK2 phosphorylation site in human complement protease Clr, and its use to probe intramolecular interaction." Pelloux S., Thielens N.M., Hudry-Clergeon G., Petillot Y., Filhol O., Arlaud G.J. FEBS Lett. 386:15-20(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 133-137; 187-211 AND 609-613, PHOSPHORYLATION AT SER-206 BY CK2. |
| [11] | "Human plasma N-glycoproteome analysis by immunoaffinity subtraction, hydrazide chemistry, and mass spectrometry." Liu T., Qian W.-J., Gritsenko M.A., Camp D.G. II, Monroe M.E., Moore R.J., Smith R.D. J. Proteome Res. 4:2070-2080(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-125; ASN-221 AND ASN-514, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Plasma. |
| [12] | "Glycoproteomics analysis of human liver tissue by combination of multiple enzyme digestion and hydrazide chemistry." Chen R., Jiang X., Sun D., Han G., Wang F., Ye M., Wang L., Zou H. J. Proteome Res. 8:651-661(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-514, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Liver. |
| [13] | "Solution structure of the epidermal growth factor (EGF)-like module of human complement protease C1r, an atypical member of the EGF family." Bersch B., Hernandez J.-F., Marion D., Arlaud G.J. Biochemistry 37:1204-1214(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: STRUCTURE BY NMR OF 140-192. |
| [14] | "The crystal structure of the zymogen catalytic domain of complement protease C1r reveals that a disruptive mechanical stress is required to trigger activation of the C1 complex." Budayova-Spano M., Lacroix M., Thielens N.M., Arlaud G.J., Fontecilla-Camps J.-C., Gaboriaud C. EMBO J. 21:231-239(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.9 ANGSTROMS) OF 307-702. |
| [15] | "Monomeric structures of the zymogen and active catalytic domain of complement protease c1r: further insights into the c1 activation mechanism." Budayova-Spano M., Grabarse W., Thielens N.M., Hillen H., Lacroix M., Schmidt M., Fontecilla-Camps J.-C., Arlaud G.J., Gaboriaud C. Structure 10:1509-1519(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.2 ANGSTROMS) OF 375-702. |
| [16] | "A common amino acid polymorphism in complement component C1R." Nothen M.M., Dewald G. Hum. Mol. Genet. 3:217-217(1994) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANT LEU-152. |
| [17] | "Quantitative detection of single amino acid polymorphisms by targeted proteomics." Su Z.D., Sun L., Yu D.X., Li R.X., Li H.X., Yu Z.J., Sheng Q.H., Lin X., Zeng R., Wu J.R. J. Mol. Cell Biol. 3:309-315(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS LYS-184 AND ARG-261, MASS SPECTROMETRY. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | M14058 mRNA. Translation: AAA51851.1. X04701 mRNA. Translation: CAA28407.1. AB083037 Genomic DNA. Translation: BAC19850.2. AC094008 Genomic DNA. No translation available. AC140077 Genomic DNA. No translation available. CR749540 mRNA. Translation: CAH18343.1. BC035220 mRNA. Translation: AAH35220.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00296165. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | C1HURB. A24170. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001724.3. NM_001733.4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.524224. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P00736. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P00736. 3 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-8045732. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000290575. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MEROPS | S01.192. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P00736. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 218511956. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | P00736. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P00736. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P00736. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DNASU | 715. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000290575; ENSP00000290575; ENSG00000159403. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 715. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:715. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 715. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC12M007187. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:1246. C1R. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA001551. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 216950. phenotype. 613785. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P00736. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA25635. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG5640. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG000559. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K01330. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4P8FHG. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_6900. Immune System. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P00736. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P00736. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_C1R. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P00736. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 2.60.120.290. 2 hits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000859. CUB_dom. IPR001881. EGF-like_Ca-bd. IPR013032. EGF-like_CS. IPR000152. EGF-type_Asp/Asn_hydroxyl_site. IPR018097. EGF_Ca-bd_CS. IPR024175. Pept_S1A_C1r/C1S/mannan-bd. IPR001254. Peptidase_S1. IPR018114. Peptidase_S1_AS. IPR001314. Peptidase_S1A. IPR000436. Sushi_SCR_CCP. IPR009003. Trypsin-like_Pept_dom. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00431. CUB. 2 hits. PF07645. EGF_CA. 1 hit. PF00084. Sushi. 2 hits. PF00089. Trypsin. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF001155. C1r_C1s_MASP. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00722. CHYMOTRYPSIN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00032. CCP. 2 hits. SM00042. CUB. 2 hits. SM00179. EGF_CA. 1 hit. SM00020. Tryp_SPc. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF57535. Complement_control_module. 2 hits. SSF49854. CUB. 2 hits. SSF50494. Pept_Ser_Cys. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00010. ASX_HYDROXYL. 1 hit. PS01180. CUB. 2 hits. PS00022. EGF_1. False negative. PS01186. EGF_2. 1 hit. PS50026. EGF_3. False negative. PS01187. EGF_CA. 1 hit. PS50923. SUSHI. 2 hits. PS50240. TRYPSIN_DOM. 1 hit. PS00134. TRYPSIN_HIS. False negative. PS00135. TRYPSIN_SER. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BindingDB | P00736. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL4611. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChiTaRS | C1R. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00054. Abciximab. DB00051. Adalimumab. DB00092. Alefacept. DB00087. Alemtuzumab. DB00074. Basiliximab. DB00112. Bevacizumab. DB00002. Cetuximab. DB00111. Daclizumab. DB00095. Efalizumab. DB00005. Etanercept. DB00056. Gemtuzumab ozogamicin. DB00078. Ibritumomab. DB00028. Immune globulin. DB00075. Muromonab. DB00108. Natalizumab. DB00110. Palivizumab. DB00073. Rituximab. DB00081. Tositumomab. DB00072. Trastuzumab. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P00736. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 715. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 2906. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | C1R_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P00736 Secondary accession number(s): A6NJQ8, Q68D77, Q8J012 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
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