P00367 (DHE3_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 157.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial Short name=GDH 1 EC=1.4.1.3 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 558 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | May be involved in learning and memory reactions by increasing the turnover of the excitatory neurotransmitter glutamate By similarity. |
| Catalytic activity | L-glutamate + H2O + NAD(P)+ = 2-oxoglutarate + NH3 + NAD(P)H. |
| Enzyme regulation | Subject to allosteric regulation. Activated by ADP. Inhibited by GTP and ATP. ADP can occupy the NADH binding site and activate the enzyme. |
| Subunit structure | Homohexamer. |
| Subcellular location | |
| Post-translational modification | Stoichiometry shows that ADP-ribosylation occurs in one subunit per catalytically active homohexamer. |
| Involvement in disease | Familial hyperinsulinemic hypoglycemia 6 (HHF6) [MIM:606762]: Familial hyperinsulinemic hypoglycemia [MIM:256450], also referred to as congenital hyperinsulinism, nesidioblastosis, or persistent hyperinsulinemic hypoglycemia of infancy (PPHI), is the most common cause of persistent hypoglycemia in infancy and is due to defective negative feedback regulation of insulin secretion by low glucose levels. In HHF6 elevated oxidation rate of glutamate to alpha-ketoglutarate stimulates insulin secretion in the pancreatic beta cells, while they impair detoxification of ammonium in the liver. |
| Sequence similarities | Belongs to the Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenases family. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Transit peptide | 1 – 53 | 53 | Mitochondrion Ref.8 Ref.9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 54 – 558 | 505 | Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial | PRO_0000007206 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 141 – 143 | 3 | NAD By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 183 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 147 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 171 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 176 | 1 | NAD By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 252 | 1 | NAD By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 266 | 1 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 270 | 1 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 319 | 1 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 322 | 1 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 438 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 444 | 1 | NAD By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 450 | 1 | ADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 516 | 1 | ADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 84 | 1 | N6-acetyllysine Ref.14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 84 | 1 | N6-succinyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 110 | 1 | N6-acetyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 110 | 1 | N6-succinyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 135 | 1 | Phosphotyrosine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 162 | 1 | N6-acetyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 162 | 1 | N6-succinyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 172 | 1 | ADP-ribosylcysteine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 183 | 1 | N6-acetyllysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 191 | 1 | N6-acetyllysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 227 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 363 | 1 | N6-acetyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 363 | 1 | N6-succinyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 365 | 1 | N6-acetyllysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 386 | 1 | N6-acetyllysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 399 | 1 | N6-acetyllysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 415 | 1 | N6-acetyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 415 | 1 | N6-succinyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 450 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 457 | 1 | N6-acetyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 457 | 1 | N6-malonyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 457 | 1 | N6-succinyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 480 | 1 | N6-acetyllysine Ref.14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 503 | 1 | N6-acetyllysine Ref.14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 503 | 1 | N6-malonyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 503 | 1 | N6-succinyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 512 | 1 | Phosphotyrosine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 527 | 1 | N6-acetyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 527 | 1 | N6-malonyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 527 | 1 | N6-succinyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 545 | 1 | N6-acetyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 545 | 1 | N6-succinyllysine; alternate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 270 | 1 | S → C in HHF6; diminished sensitivity to GTP. Ref.24 | VAR_016760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 274 | 1 | R → C in HHF6; diminished sensitivity to GTP. Ref.23 Ref.24 Corresponds to variant rs56275071 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_016761 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 318 | 1 | R → K in HHF6. Ref.22 | VAR_009270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 318 | 1 | R → T in HHF6; diminished sensitivity to GTP. Ref.24 | VAR_016762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 319 | 1 | Y → C in HHF6. Ref.24 | VAR_016763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 322 | 1 | R → C in HHF6; diminished sensitivity to GTP. Ref.24 | VAR_016764 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 322 | 1 | R → H in HHF6; diminished sensitivity to GTP. Ref.23 Ref.24 | VAR_016765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 349 | 1 | E → A in HHF6. Ref.22 | VAR_009271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 498 | 1 | S → L in HHF6. Ref.21 | VAR_008666 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 499 | 1 | G → D in HHF6. Ref.21 | VAR_008667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 499 | 1 | G → S in HHF6. Ref.21 | VAR_008668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 501 | 1 | S → P in HHF6. Ref.21 | VAR_008669 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 507 | 1 | H → Y in HHF6; abolishes inhibition by ATP; no effect on activation by ADP. Ref.16 Ref.17 Ref.21 | VAR_008670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 501 | 1 | S → A: Reduces activity and inhibition by GTP. Ref.17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 507 | 1 | H → A: Strongly reduces inhibition by GTP. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 516 | 1 | R → A: Abolishes activation by ADP. Ref.17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 66 – 90 | 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 91 – 93 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 95 – 97 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 99 – 102 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 104 – 109 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 113 – 123 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 125 – 127 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 129 – 138 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 142 – 152 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 158 – 174 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 180 – 186 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 190 – 192 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 195 – 211 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 217 – 219 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 220 – 223 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 230 – 242 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 243 – 247 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 251 – 253 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 260 – 262 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 271 – 284 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 287 – 293 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 298 – 300 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 303 – 307 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 311 – 322 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 326 – 331 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 345 – 354 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 355 – 358 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 371 – 373 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 377 – 381 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 383 – 386 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 390 – 392 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 393 – 395 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 399 – 402 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 405 – 407 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 411 – 419 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 423 – 425 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 427 – 430 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 433 – 447 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 451 – 455 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 456 – 475 | 20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 476 – 479 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 481 – 484 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 491 – 498 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 502 – 527 | 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 534 – 551 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Comparison of human brain and liver glutamate dehydrogenase cDNAs." Nakatani Y., Banner C., von Herrat M., Schneider M.E., Smith H.H., Freese E. Biochem. Biophys. Res. Commun. 149:405-410(1987) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Brain and Liver. |
| [2] | "Molecular cloning and nucleotide sequence of the cDNA for human liver glutamate dehydrogenase precursor." Amuro N., Yamaura M., Goto Y., Okazaki T. Biochem. Biophys. Res. Commun. 152:1395-1400(1988) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Liver. |
| [3] | "Complete nucleotide sequence of human glutamate dehydrogenase cDNA." Nakatani Y., Schneider M.E., Banner C., Freese E. Nucleic Acids Res. 16:6237-6237(1988) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [4] | "Isolation and characterization of cDNA clones encoding human liver glutamate dehydrogenase: evidence for a small gene family." Mavrothalassitis G., Tzimagiorgis G., Mitsialis A., Zannis V., Plaitakis A., Papamatheakis J., Moschonas N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85:3494-3498(1988) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Liver. |
| [5] | "The human glutamate dehydrogenase gene family: gene organization and structural characterization." Michaelidis T.M., Tzimagiorgis G., Moschonas N.K., Papamatheakis J. Genomics 16:150-160(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Tissue: Placenta. |
| [6] | "The DNA sequence and comparative analysis of human chromosome 10." Deloukas P., Earthrowl M.E., Grafham D.V., Rubenfield M., French L., Steward C.A., Sims S.K., Jones M.C., Searle S., Scott C., Howe K., Hunt S.E., Andrews T.D., Gilbert J.G.R., Swarbreck D., Ashurst J.L., Taylor A., Battles J. Rogers J.Nature 429:375-381(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [7] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Duodenum and Eye. |
| [8] | "Partial amino acid sequence of the glutamate dehydrogenase of human liver and a revision of the sequence of the bovine enzyme." Julliard J.H., Smith E.L. J. Biol. Chem. 254:3427-3438(1979) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 54-558. Tissue: Liver. |
| [9] | "Human liver protein map: a reference database established by microsequencing and gel comparison." Hochstrasser D.F., Frutiger S., Paquet N., Bairoch A., Ravier F., Pasquali C., Sanchez J.-C., Tissot J.-D., Bjellqvist B., Vargas R., Appel R.D., Hughes G.J. Electrophoresis 13:992-1001(1992) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 54-69. Tissue: Liver. |
| [10] | "Isolation of a human brain cDNA for glutamate dehydrogenase." Banner C., Silverman S., Thomas J.W., Lampel K.A., Vitkovic L., Huie D., Wenthold R.J. J. Neurochem. 49:246-252(1987) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 301-558. Tissue: Brain. |
| [11] | Lubec G., Vishwanath V. Submitted (MAR-2007) to UniProtKB Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 481-496, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Brain and Cajal-Retzius cell. |
| [12] | "Structure and expression analysis of a member of the human glutamate dehydrogenase (GLUD) gene family mapped to chromosome 10p11.2." Tzimagiorgis G., Leversha M.A., Chroniary K., Goulielmos G., Sargent C.A., Ferguson-Smith M., Moschonas N.K. Hum. Genet. 91:433-438(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 540-558. |
| [13] | "Identification of ADP-ribosylation site in human glutamate dehydrogenase isozymes." Choi M.M., Huh J.W., Yang S.J., Cho E.H., Choi S.Y., Cho S.W. FEBS Lett. 579:4125-4130(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: ADP-RIBOSYLATION AT CYS-172. |
| [14] | "Lysine acetylation targets protein complexes and co-regulates major cellular functions." Choudhary C., Kumar C., Gnad F., Nielsen M.L., Rehman M., Walther T.C., Olsen J.V., Mann M. Science 325:834-840(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: ACETYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT LYS-84; LYS-480 AND LYS-503, MASS SPECTROMETRY. |
| [15] | "Initial characterization of the human central proteome." Burkard T.R., Planyavsky M., Kaupe I., Breitwieser F.P., Buerckstuemmer T., Bennett K.L., Superti-Furga G., Colinge J. BMC Syst. Biol. 5:17-17(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION BY MASS SPECTROMETRY [LARGE SCALE ANALYSIS]. |
| [16] | "Structures of bovine glutamate dehydrogenase complexes elucidate the mechanism of purine regulation." Smith T.J., Peterson P.E., Schmidt T., Fang J., Stanley C.A. J. Mol. Biol. 307:707-720(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: CHARACTERIZATION OF VARIANT TYR-507, ALLOSTERIC REGULATION. |
| [17] | "Expression, purification and characterization of human glutamate dehydrogenase (GDH) allosteric regulatory mutations." Fang J., Hsu B.Y.L., MacMullen C.M., Poncz M., Smith T.J., Stanley C.A. Biochem. J. 363:81-87(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: MUTAGENESIS OF SER-501 AND ARG-516, CHARACTERIZATION OF VARIANT TYR-507, ALLOSTERIC REGULATION. |
| [18] | "The structure of apo human glutamate dehydrogenase details subunit communication and allostery." Smith T.J., Schmidt T., Fang J., Wu J., Siuzdak G., Stanley C.A. J. Mol. Biol. 318:765-777(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.7 ANGSTROMS) OF 54-558. |
| [19] | "Structural studies on ADP activation of mammalian glutamate dehydrogenase and the evolution of regulation." Banerjee S., Schmidt T., Fang J., Stanley C.A., Smith T.J. Biochemistry 42:3446-3456(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.3 ANGSTROMS) OF 63-558 OF MUTANT ALA-516, ALLOSTERIC REGULATION. |
| [20] | "Congenital hyperinsulinism: molecular basis of a heterogeneous disease." Meissner T., Beinbrech B., Mayatepek E. Hum. Mutat. 13:351-361(1999) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: REVIEW ON VARIANTS. |
| [21] | "Hyperinsulinism and hyperammonemia in infants with regulatory mutations of the glutamate dehydrogenase gene." Stanley C.A., Lieu Y.K., Hsu B.Y.L., Burlina A.B., Greenberg C.R., Hopwood N.J., Perlman K., Rich B.H., Zammarchi E., Poncz M. N. Engl. J. Med. 338:1352-1357(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS HHF6 LEU-498; SER-499; ASP-499; PRO-501 AND TYR-507. |
| [22] | "Novel missense mutations in the glutamate dehydrogenase gene in the congenital hyperinsulinism-hyperammonemia syndrome." Miki Y., Taki T., Ohura T., Kato H., Yanagisawa M., Hayashi Y. J. Pediatr. 136:69-72(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS HHF6 LYS-318 AND ALA-349. |
| [23] | "Novel missense mutations outside the allosteric domain of glutamate dehydrogenase are prevalent in European patients with the congenital hyperinsulinism-hyperammonemia syndrome." Santer R., Kinner M., Passarge M., Superti-Furga A., Mayatepek E., Meissner T., Schneppenheim R., Schaub J. Hum. Genet. 108:66-71(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS HHF6 CYS-274 AND HIS-322. |
| [24] | "Hyperinsulinism/hyperammonemia syndrome in children with regulatory mutations in the inhibitory guanosine triphosphate-binding domain of glutamate dehydrogenase." MacMullen C., Fang J., Hsu B.Y.L., Kelly A., de Lonlay-Debeney P., Saudubray J.-M., Ganguly A., Smith T.J., Stanley C.A., Brown R., Buist N., Dasouki M., Fefferman R., Grange D., Karaviti L., Luedke C., Marriage B., McLaughlin J. van Vliet G.J. Clin. Endocrinol. Metab. 86:1782-1787(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS HHF6 CYS-270; CYS-274; THR-318; CYS-319; CYS-322 AND HIS-322. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
| GeneReviews |
| Wikipedia Glutamate dehydrogenase 1 entry |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X07674 mRNA. Translation: CAA30521.1. M20867 mRNA. Translation: AAA52526.1. M37154 mRNA. Translation: AAA52525.1. X07769 mRNA. Translation: CAA30598.1. J03248 mRNA. Translation: AAA52523.1. X66300 X66312 Genomic DNA. Translation: CAA46994.2.AL136982 Genomic DNA. Translation: CAI17120.1. BC040132 mRNA. Translation: AAH40132.1. BC112946 mRNA. Translation: AAI12947.1. X67491 Genomic DNA. Translation: CAA47830.1. | ||||||||||||||||||
| IPI | IPI00016801. | ||||||||||||||||||
| PIR | DEHUE. A28208. I37424. S29331. S60192. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_005262.1. NM_005271.3. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.500409. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P00367. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| IntAct | P00367. 16 interactions. | ||||||||||||||||||
| MINT | MINT-5005913. | ||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000277865. | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P00367. | ||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||
| DMDM | 118541. | ||||||||||||||||||
2D gel databases | |||||||||||||||||||
| REPRODUCTION-2DPAGE | IPI00016801. | ||||||||||||||||||
| SWISS-2DPAGE | P00367. | ||||||||||||||||||
| UCD-2DPAGE | P00367. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PaxDb | P00367. | ||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P00367. | ||||||||||||||||||
| PRIDE | P00367. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000277865; ENSP00000277865; ENSG00000148672. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 2746. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:2746. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc001keg.3. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 2746. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC10M088800. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:4335. GLUD1. | ||||||||||||||||||
| HPA | HPA042492. HPA044839. | ||||||||||||||||||
| MIM | 138130. gene. 606762. phenotype. | ||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P00367. | ||||||||||||||||||
| Orphanet | 35878. Hyperinsulinism-hyperammonemia syndrome. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA28737. | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0334. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000243801. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG005479. | ||||||||||||||||||
| InParanoid | P00367. | ||||||||||||||||||
| KO | K00261. | ||||||||||||||||||
| OMA | TCIGVIE. | ||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4H72B7. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P00367. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BioCyc | MetaCyc:HS07548-MONOMER. | ||||||||||||||||||
| BRENDA | 1.4.1.3. 2681. | ||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_111217. Metabolism. | ||||||||||||||||||
| SABIO-RK | P00367. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P00367. | ||||||||||||||||||
| Bgee | P00367. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_GLUD1. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | P00367. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000148672. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| Gene3D | 3.40.50.720. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR006095. Glu/Leu/Phe/Val_DH. IPR006096. Glu/Leu/Phe/Val_DH_C. IPR006097. Glu/Leu/Phe/Val_DH_dimer_dom. IPR016040. NAD(P)-bd_dom. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00208. ELFV_dehydrog. 1 hit. PF02812. ELFV_dehydrog_N. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00082. GLFDHDRGNASE. | ||||||||||||||||||
| SMART | SM00839. ELFV_dehydrog. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00074. GLFV_DEHYDROGENASE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00142. L-Glutamic Acid. DB00157. NADH. | ||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P00367. | ||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 2746. | ||||||||||||||||||
| NextBio | 10824. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | DHE3_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P00367 Secondary accession number(s): Q5TBU3 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 10 Human chromosome 10: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
