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UniProtKB/Swiss-Prot O88844 (IDHC_MOUSE)
Last modified
November 25, 2008.
Version 66.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (3) |
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Names and origin · Protein attributes · General annotation (Comments) · Ontologies · Sequence annotation (Features) · Sequences · References · Cross-references · Entry information · Relevant documents
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic Short name=IDH EC=1.1.1.42 Alternative name(s): Cytosolic NADP-isocitrate dehydrogenase Oxalosuccinate decarboxylase NADP(+)-specific ICDH IDP | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Mus musculus (Mouse) | ||
| Taxonomic identifier | 10090 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Glires › Rodentia › Sciurognathi › Muroidea › Muridae › Murinae › Mus |
Protein attributes
| Sequence length | 414 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | Isocitrate + NADP(+) = 2-oxoglutarate + CO(2) + NADPH. Oxalosuccinate + NADP(+) = 2-oxoglutarate + CO(2) + NADPH. |
| Cofactor | Binds 1 magnesium or manganese ion per subunit By similarity. |
| Subunit structure | Homodimer By similarity. |
| Subcellular location | |
| Sequence similarities | Belongs to the isocitrate and isopropylmalate dehydrogenases family. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 414 | 414 | Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic | PRO_0000083578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 75 – 77 | 3 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 310 – 315 | 6 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 94 – 100 | 7 | Substrate binding By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 252 | 1 | Magnesium or manganese By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 275 | 1 | Magnesium or manganese By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 77 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 82 | 1 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 109 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 132 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 260 | 1 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 328 | 1 | NADP; via amide nitrogen and carbonyl oxygen By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 139 | 1 | Critical for catalysis By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 212 | 1 | Critical for catalysis By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 5 – 14 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 17 – 30 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 31 – 34 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 35 – 43 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 46 – 51 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 52 – 54 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 55 – 67 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 68 – 72 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 80 – 86 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 95 – 103 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 106 – 111 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 128 – 133 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 137 – 140 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 142 – 146 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 148 – 162 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 165 – 172 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 177 – 185 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 186 – 203 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 207 – 211 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 213 – 215 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 219 – 234 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 236 – 241 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 246 – 250 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 251 – 260 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 265 – 269 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 271 – 285 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 290 – 296 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 303 – 306 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 313 – 320 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 330 – 347 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 350 – 368 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 374 – 381 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 383 – 385 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 388 – 390 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 394 – 412 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Cytosolic isocitrate dehydrogenase in humans, mice, and voles and phylogenetic analysis of the enzyme family." Nekrutenko A., Hillis D.M., Patton J.C., Bradley R.D., Baker R.J. Mol. Biol. Evol. 15:1674-1684(1998) [PubMed: 9866202] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | Lubec G., Yang J.W., Zigmond M. Submitted (JUL-2007) to UniProtKB Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 30-49. Tissue: Brain. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AF020039 mRNA. Translation: AAD02919.1. | |||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.9925 | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | O88844. | ||||||||||||||||||
2-D gel databases | |||||||||||||||||||
| SWISS-2DPAGE | O88844. | ||||||||||||||||||
| REPRODUCTION-2DPAGE | O88844. | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSMUSG00000025950. Mus musculus. [Contig view] | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| MGI | MGI:96413. Idh1. | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| HOVERGEN | O88844. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | O88844. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | MM_IDH1. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSMUSG00000025950. Mus musculus. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR004790. IsoCit_DHase_NADP-dep_euk. IPR001804. IsoCit_IM_DHase. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.718.10. IDH_IMDH. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11822. IDH_NADP_euk. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00180. Iso_dh. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF000108. IDH_NADP. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00127. nadp_idh_euk. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00470. IDH_IMDH. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | IDHC_MOUSE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O88844 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| MGD cross-references Mouse Genome Database (MGD) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


