O75891 (AL1L1_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase Short name=10-FTHFDH Short name=FDH EC=1.5.1.6 Alternative name(s): Aldehyde dehydrogenase family 1 member L1 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 902 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | 10-formyltetrahydrofolate + NADP+ + H2O = tetrahydrofolate + CO2 + NADPH. |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | Highly expressed in liver, pancreas and kidney. Ref.5 |
| Sequence similarities | In the N-terminal section; belongs to the GART family. In the C-terminal section; belongs to the aldehyde dehydrogenase family. ALDH1L subfamily. Contains 1 acyl carrier domain. |
| Sequence caution | The sequence CAH18667.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally shortened. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: O75891-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: O75891-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 118-218: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 902 | 902 | Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase | PRO_0000199419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 323 – 392 | 70 | Acyl carrier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 571 – 573 | 3 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 597 – 600 | 4 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 630 – 635 | 6 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 650 – 651 | 2 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 804 – 806 | 3 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 1 – 203 | 203 | GART | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 88 – 90 | 3 | Substrate binding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 417 – 902 | 486 | Aldehyde dehydrogenase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 106 | 1 | Proton donor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 673 | 1 | Proton acceptor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 707 | 1 | Proton donor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 142 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 757 | 1 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 142 | 1 | Essential for catalytic activity By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 354 | 1 | O-(pantetheine 4'-phosphoryl)serine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 118 – 218 | 101 | Missing in isoform 2. | VSP_045569 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 254 | 1 | L → P. Corresponds to variant rs3796191 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_052290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 330 | 1 | V → F. Corresponds to variant rs2886059 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_052291 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 429 | 1 | E → A. Corresponds to variant rs9282691 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_052292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 436 | 1 | A → T. Corresponds to variant rs9282692 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_052293 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 436 | 1 | A → V. Corresponds to variant rs9282693 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_052294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 448 | 1 | S → N. Corresponds to variant rs9282697 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_052295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 481 | 1 | S → G. Corresponds to variant rs2276724 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_052296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 511 | 1 | A → V in a colorectal cancer sample; somatic mutation. Ref.8 | VAR_036101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 793 | 1 | D → G. Corresponds to variant rs1127717 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_052297 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 803 | 1 | E → K. Corresponds to variant rs9282689 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_052298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 812 | 1 | I → V. Corresponds to variant rs4646750 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_052299 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 63 | 1 | G → A in AAC35000. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 85 | 1 | F → S in AAC35000. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 176 | 1 | M → V in AAC35000. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 195 | 1 | E → K in AAC35000. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 470 | 1 | D → G in AAC35000. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 472 | 1 | F → L in BAG57647. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 677 | 1 | K → E in AAC35000. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 680 | 1 | L → F in AAC35000. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 702 | 1 | N → S in AAC35000. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 6 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 9 – 21 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 25 – 31 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 41 – 49 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 53 – 55 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 67 – 74 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 79 – 85 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 92 – 95 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 102 – 108 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 110 – 113 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 114 – 116 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 118 – 124 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 128 – 136 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 139 – 142 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 146 – 153 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 160 – 166 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 167 – 169 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 170 – 185 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 206 – 209 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 217 – 225 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 226 – 231 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 234 – 237 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 240 – 249 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 258 – 261 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 270 – 273 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 276 – 280 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 286 – 293 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 299 – 301 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 302 – 304 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 320 – 334 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 347 – 351 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 356 – 367 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 375 – 380 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 384 – 397 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AF052732 mRNA. Translation: AAC35000.1. AK294392 mRNA. Translation: BAG57647.1. CR749807 mRNA. Translation: CAH18667.1. Different initiation. AC079848 Genomic DNA. No translation available. | ||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00290553. IPI00966217. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001257293.1. NM_001270364.1. NP_001257294.1. NM_001270365.1. NP_036322.2. NM_012190.3. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.434435. | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | O75891. | ||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000377083. | ||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | O75891. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | O75891. | ||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | O75891. | ||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||
| DNASU | 10840. | ||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000273450; ENSP00000273450; ENSG00000144908. ENST00000393434; ENSP00000377083; ENSG00000144908. ENST00000452905; ENSP00000395881; ENSG00000144908. ENST00000472186; ENSP00000420293; ENSG00000144908. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 10840. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:10840. | ||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc003eim.1. human. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| CTD | 10840. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC03M125822. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:3978. ALDH1L1. | ||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA036900. | ||||||||||||||||||||||||
| MIM | 600249. gene. | ||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_O75891. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA28393. | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG1012. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG051668. | ||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | O75891. | ||||||||||||||||||||||||
| KO | K00289. | ||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG45TCMG. | ||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | O75891. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | O75891. | ||||||||||||||||||||||||
| Bgee | O75891. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_ALDH1L1. | ||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | O75891. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000144908. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 1.10.1200.10. 1 hit. 3.10.25.10. 1 hit. 3.40.309.10. 1 hit. 3.40.50.170. 1 hit. 3.40.605.10. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR011407. 10_FTHF_DH. IPR009081. Acyl_carrier_prot-like. IPR016161. Ald_DH/histidinol_DH. IPR016163. Ald_DH_C. IPR016160. Ald_DH_CS. IPR016162. Ald_DH_N. IPR015590. Aldehyde_DH_dom. IPR005793. Formyl_trans_C. IPR002376. Formyl_transf_N. IPR011034. Formyl_transferase_C-like. IPR001555. GART_AS. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00171. Aldedh. 1 hit. PF02911. Formyl_trans_C. 1 hit. PF00551. Formyl_trans_N. 1 hit. PF00550. PP-binding. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF036489. 10-FTHFDH. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF47336. ACP_like. 1 hit. SSF53720. Aldehyde_DH/Histidinol_DH. 1 hit. SSF50486. FMT_C_like. 1 hit. SSF53328. formyl_transf. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50075. ACP_DOMAIN. 1 hit. PS00070. ALDEHYDE_DEHYDR_CYS. 1 hit. PS00687. ALDEHYDE_DEHYDR_GLU. 1 hit. PS00373. GART. 1 hit. PS00012. PHOSPHOPANTETHEINE. False negative. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00116. Tetrahydrofolic acid. | ||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | O75891. | ||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 10840. | ||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 41156. | ||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | AL1L1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O75891 Secondary accession number(s): B4DG36, E9PBX3, Q68CS1 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
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