O75326 (SEM7A_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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January 25, 2012.
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| Protein names | Recommended name: Semaphorin-7A Alternative name(s): CDw108 JMH blood group antigen John-Milton-Hargen human blood group Ag Semaphorin-K1 Short name=Sema K1 Semaphorin-L Short name=Sema L CD_antigen=CD108 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 666 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Plays an important role in integrin-mediated signaling and functions both in regulating cell migration and immune responses. Promotes formation of focal adhesion complexes, activation of the protein kinase PTK2/FAK1 and subsequent phosphorylation of MAPK1 and MAPK3. Promotes production of proinflammatory cytokines by monocytes and macrophages. Plays an important role in modulating inflammation and T cell-mediated immune responses. Promotes axon growth in the embryonic olfactory bulb. Promotes attachment, spreading and dendrite outgrowth in melanocytes. Ref.8 Ref.9 Ref.10 |
| Subunit structure | Interacts with ITGA1 and ITGB1 Probable. Interacts with PLXNC1. Ref.8 Ref.9 Ref.10 Ref.11 |
| Subcellular location | Cell membrane; Lipid-anchor › GPI-anchor; Extracellular side. Note: Detected in a punctate pattern on the cell membrane of basal and supra-basal skin keratinocytes. Ref.2 Ref.3 Ref.10 |
| Tissue specificity | Detected in skin keratinocytes and on endothelial cells from skin blood vessels (at protein level). Expressed in fibroblasts, keratinocytes, melanocytes, placenta, testis, ovary, spleen, brain, spinal chord, lung, heart, adrenal gland, lymph nodes, thymus, intestine and kidney. Ref.2 Ref.3 Ref.10 |
| Induction | Up-regulated in UV-irradiated fibroblasts, but not in UV-irradiated keratinocytes. Ref.10 |
| Sequence similarities | Belongs to the semaphorin family. Contains 1 Ig-like C2-type (immunoglobulin-like) domain. Contains 1 PSI domain. Contains 1 Sema domain. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| NCK1 | P16333 | 2 | EBI-1753538,EBI-389883 | |
| PLXNC1 | O60486 | 4 | EBI-1753538,EBI-2927384 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 44 | 44 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 45 – 648 | 604 | Semaphorin-7A | PRO_0000032347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Propeptide | 649 – 666 | 18 | Removed in mature form Potential | PRO_0000032348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 53 – 490 | 438 | Sema | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 544 – 629 | 86 | Ig-like C2-type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 267 – 269 | 3 | Interaction with integrins | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 267 – 269 | 3 | Cell attachment site Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Lipidation | 648 | 1 | GPI-anchor amidated alanine Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 105 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 157 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 258 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 330 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 602 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Probable | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 120 ↔ 126 | Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 143 ↔ 152 | Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 266 ↔ 366 | Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 291 ↔ 335 | Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 493 ↔ 511 | Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 500 ↔ 541 | Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 503 ↔ 518 | Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 566 ↔ 613 | Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 587 ↔ 596 | Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 115 | 1 | S → T. Ref.5 Corresponds to variant rs16968733 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_029282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 207 | 1 | R → Q. Ref.4 Corresponds to variant rs55637216 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_038836 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 207 | 1 | R → W. Ref.4 Corresponds to variant rs56367230 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_038837 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 460 | 1 | R → H. Ref.4 Corresponds to variant rs56204206 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_038838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 461 | 1 | R → C. Ref.4 Corresponds to variant rs56001514 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_038839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 267 | 1 | R → K: Abolishes ITGB1-dependent enhancement of axon growth; when associated with E-269. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 269 | 1 | D → E: Abolishes ITGB1-dependent enhancement of axon growth; when associated with K-267. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 68 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 86 – 89 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 95 – 99 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 132 – 134 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 141 – 143 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 146 – 148 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 153 – 155 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 160 – 162 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 180 – 182 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 187 – 189 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 204 – 207 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 223 – 230 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 235 – 237 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 239 – 247 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 257 – 266 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 275 – 279 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 285 – 289 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 294 – 296 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 302 – 309 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 316 – 318 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 320 – 322 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 324 – 326 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 332 – 334 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 342 – 348 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 368 – 370 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 376 – 383 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 386 – 389 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 401 – 406 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 408 – 417 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 423 – 431 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 436 – 440 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 451 – 456 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 467 – 471 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 472 – 475 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 476 – 480 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 482 – 489 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 523 – 526 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 533 – 535 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 537 – 540 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 541 – 545 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 551 – 556 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 562 – 567 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 573 – 579 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 582 – 587 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 593 – 602 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 611 – 616 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 621 – 631 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [1] | "New eukaryotic semaphorins with close homology to semaphorins of DNA viruses." Lange C., Liehr T., Goen M., Gebhart E., Fleckenstein B., Ensser A. Genomics 51:340-350(1998) [PubMed: 9721204] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA / MRNA]. |
| [2] | "Molecular cloning of a glycosylphosphatidylinositol-anchored molecule CDw108." Yamada A., Kubo K., Takeshita T., Harashima N., Kawano K., Mine T., Sagawa K., Sugamura K., Itoh K. J. Immunol. 162:4094-4100(1999) [PubMed: 10201933] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], SUBCELLULAR LOCATION, GLYCOSYLATION, TISSUE SPECIFICITY. |
| [3] | "Human semaphorin K1 is glycosylphosphatidylinositol-linked and defines a new subfamily of viral-related semaphorins." Xu X., Ng S., Wu Z.-L., Nguyen D., Homburger S., Seidel-Dugan C., Ebens A., Luo Y. J. Biol. Chem. 273:22428-22434(1998) [PubMed: 9712866] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], SUBCELLULAR LOCATION, TISSUE SPECIFICITY. Tissue: Placenta. |
| [4] | "The molecular diversity of Sema7A, the semaphorin that carries the JMH blood group antigens." Seltsam A., Strigens S., Levene C., Yahalom V., Moulds M., Moulds J.J., Hustinx H., Weisbach V., Figueroa D., Bade-Doeding C., DeLuca D.S., Blasczyk R. Transfusion 47:133-146(2007) [PubMed: 17207242] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], VARIANTS GLN-207; TRP-207; HIS-460 AND CYS-461. Tissue: Peripheral blood. |
| [5] | SeattleSNPs variation discovery resource Submitted (JAN-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], VARIANT THR-115. |
| [6] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Brain cortex. |
| [7] | "Characterization of the human leukocyte GPI-anchored glycoprotein CDw108 and its relation to other similar molecules." Angelisova P., Drbal K., Cerny J., Hilgert I., Horejsi V. Immunobiology 200:234-245(1999) [PubMed: 10416131] [Abstract] Cited for: CHARACTERIZATION. |
| [8] | "Semaphorin 7A promotes axon outgrowth through integrins and MAPKs." Pasterkamp R.J., Peschon J.J., Spriggs M.K., Kolodkin A.L. Nature 424:398-405(2003) [PubMed: 12879062] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH ITGB1, MUTAGENESIS OF ARG-267 AND ASP-269. |
| [9] | "Semaphorin 7A initiates T-cell-mediated inflammatory responses through alpha1beta1 integrin." Suzuki K., Okuno T., Yamamoto M., Pasterkamp R.J., Takegahara N., Takamatsu H., Kitao T., Takagi J., Rennert P.D., Kolodkin A.L., Kumanogoh A., Kikutani H. Nature 446:680-684(2007) [PubMed: 17377534] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH ITGA1 AND ITGB1. |
| [10] | "Semaphorin 7a promotes spreading and dendricity in human melanocytes through beta1-integrins." Scott G.A., McClelland L.A., Fricke A.F. J. Invest. Dermatol. 128:151-161(2008) [PubMed: 17671519] [Abstract] Cited for: FUNCTION, SUBCELLULAR LOCATION, INTERACTION WITH ITGB1, INDUCTION, TISSUE SPECIFICITY. |
| [11] | "Structural basis of semaphorin-plexin recognition and viral mimicry from Sema7A and A39R complexes with PlexinC1." Liu H., Juo Z.S., Shim A.H., Focia P.J., Chen X., Garcia K.C., He X. Cell 142:749-761(2010) [PubMed: 20727575] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.4 ANGSTROMS) OF 45-634 IN COMPLEX WITH PLXNC1, SUBUNIT, DISULFIDE BONDS, GLYCOSYLATION AT ASN-105; ASN-157; ASN-258 AND ASN-330. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
| dbRBC/BGMUT Blood group antigen gene mutation database |
| SeattleSNPs |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AF030698 mRNA. Translation: AAC34261.1. AF030697 Genomic DNA. Translation: AAC34741.1. AF069493 mRNA. Translation: AAC82642.1. AF071542 mRNA. Translation: AAC80456.1. AM180445 mRNA. Translation: CAJ55398.1. AM180446 mRNA. Translation: CAJ55399.1. AM180447 mRNA. Translation: CAJ55400.1. AM180448 mRNA. Translation: CAJ55401.1. AM180449 mRNA. Translation: CAJ55402.1. AM180450 mRNA. Translation: CAJ55403.1. AM180451 mRNA. Translation: CAJ55404.1. AY885237 Genomic DNA. Translation: AAW62253.1. BC101643 mRNA. Translation: AAI01644.1. BC101647 mRNA. Translation: AAI01648.1. | ||||||||||||
| IPI | IPI00025257. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_001139501.1. NM_001146029.1. NP_001139502.1. NM_001146030.1. NP_003603.1. NM_003612.3. | ||||||||||||
| UniGene | Hs.24640. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | O75326. | ||||||||||||
| SMR | O75326. Positions 46-633. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| IntAct | O75326. 7 interactions. | ||||||||||||
| MINT | MINT-1958248. | ||||||||||||
| STRING | O75326. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PeptideAtlas | O75326. | ||||||||||||
| PRIDE | O75326. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENST00000261918; ENSP00000261918; ENSG00000138623. | ||||||||||||
| GeneID | 8482. | ||||||||||||
| KEGG | hsa:8482. | ||||||||||||
| UCSC | uc002axv.1. human. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CTD | 8482. | ||||||||||||
| GeneCards | GC15M074701. | ||||||||||||
| H-InvDB | HIX0012429. | ||||||||||||
| HGNC | HGNC:10741. SEMA7A. | ||||||||||||
| HPA | HPA042273. | ||||||||||||
| MIM | 607961. gene+phenotype. | ||||||||||||
| neXtProt | NX_O75326. | ||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | prNOG17208. | ||||||||||||
| GeneTree | ENSGT00390000013125. | ||||||||||||
| HOGENOM | HBG127219. | ||||||||||||
| HOVERGEN | HBG079171. | ||||||||||||
| InParanoid | O75326. | ||||||||||||
| OMA | CILFIEN. | ||||||||||||
| OrthoDB | EOG4N30ND. | ||||||||||||
| PhylomeDB | O75326. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| Reactome | REACT_111045. Developmental Biology. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | O75326. | ||||||||||||
| Bgee | O75326. | ||||||||||||
| CleanEx | HS_SEMA7A. | ||||||||||||
| Genevestigator | O75326. | ||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000138623. Homo sapiens. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR007110. Ig-like. IPR013783. Ig-like_fold. IPR003599. Ig_sub. IPR003659. Plexin-like. IPR016201. Plexin-like_fold. IPR002165. Plexin_repeat. IPR001627. Semaphorin/CD100_Ag. IPR015943. WD40/YVTN_repeat-like_dom. [Graphical view] | ||||||||||||
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| KO | K06529. | ||||||||||||
| Pfam | PF01437. PSI. 1 hit. PF01403. Sema. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SMART | SM00409. IG. 1 hit. SM00423. PSI. 1 hit. SM00630. Sema. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF103575. Plexin-like_fold. 1 hit. SSF101912. Sema. 1 hit. | ||||||||||||
| PROSITE | PS50835. IG_LIKE. 1 hit. PS51004. SEMA. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| NextBio | 31739. | ||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | SEM7A_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O75326 Secondary accession number(s): Q1XE81 Q3MIY5 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
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