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UniProtKB/Swiss-Prot O75173 (ATS4_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
Version 103.
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Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (7) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 4 Short name=ADAMTS-4 Short name=ADAM-TS 4 Short name=ADAM-TS4 EC=3.4.24.82 Alternative name(s): Aggrecanase-1 ADMP-1 | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 837 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Cleaves aggrecan, a cartilage proteoglycan, and may be involved in its turnover. May play an important role in the destruction of aggrecan in arthritic diseases. Could also be a critical factor in the exacerbation of neurodegeneration in Alzheimer disease. Cleaves aggrecan at the '392-Glu-|-Ala-393' site. |
| Catalytic activity | Glutamyl endopeptidase; bonds cleaved include 370-Thr-Glu-Gly-Glu-|-Ala-Arg-Gly-Ser-377 in the interglobular domain of mammalian aggrecan. |
| Cofactor | Binds 1 zinc ion per subunit By similarity. |
| Subcellular location | Secreted › extracellular space › extracellular matrix By similarity. |
| Tissue specificity | Expressed in brain, lung and heart. Expressed at very low level in placenta and skeletal muscles. |
| Induction | By interleukin-1. |
| Domain | The spacer domain and the TSP type-1 domains are important for a tight interaction with the extracellular matrix. The conserved cysteine present in the cysteine-switch motif binds the catalytic zinc ion, thus inhibiting the enzyme. The dissociation of the cysteine from the zinc ion upon the activation-peptide release activates the enzyme. |
| Post-translational modification | The precursor is cleaved by a furin endopeptidase. |
| Sequence similarities | Contains 1 disintegrin domain. Contains 1 peptidase M12B domain. Contains 1 TSP type-1 domain. |
| Caution | Has sometimes been referred to as ADAMTS2. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Extracellular matrix Secreted |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Domain | Signal |
| Ligand | Metal-binding Zinc |
| Molecular function | Hydrolase Metalloprotease Protease |
| PTM | Cleavage on pair of basic residues Disulfide bond Glycoprotein Zymogen |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | proteolysis Traceable author statement. Source: ProtInc skeletal system development Ref.1Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Cellular component | extracellular space Inferred from direct assay. Source: UniProtKB proteinaceous extracellular matrixInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | metalloendopeptidase activity Inferred from electronic annotation. Source: InterPro protease bindingInferred from physical interaction. Source: UniProtKB zinc ion bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 51 | 51 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Propeptide | 52 – 212 | 161 | PRO_0000029164 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 213 – 837 | 625 | A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 4 | PRO_0000029165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 218 – 428 | 211 | Peptidase M12B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 437 – 519 | 83 | Disintegrin | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 520 – 575 | 56 | TSP type-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 686 – 837 | 152 | Spacer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 192 – 199 | 8 | Cysteine switch By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 247 – 252 | 6 | Poly-Ala | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 577 – 685 | 109 | Cys-rich | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 362 | 1 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 194 | 1 | Zinc; in inhibited form By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 361 | 1 | Zinc; catalytic By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 365 | 1 | Zinc; catalytic By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 371 | 1 | Zinc; catalytic By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 68 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 339 ↔ 423 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 377 ↔ 407 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 532 ↔ 569 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 536 ↔ 574 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 547 ↔ 559 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 4 | 1 | T → I: dbSNP rs17855814. Ref.6 | VAR_030636 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 77 | 1 | A → T: dbSNP rs34448954. | VAR_057073 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 304 | 1 | D → N: dbSNP rs17855813. Ref.6 | VAR_030637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 369 | 1 | M → V: dbSNP rs17855812. Ref.6 | VAR_030638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 552 | 1 | P → T: dbSNP rs17855815. Ref.6 | VAR_030639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 564 | 1 | T → A: dbSNP rs17855816. Ref.6 | VAR_030640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 626 | 1 | R → Q: dbSNP rs4233367. Ref.6 Ref.2 Ref.5 | VAR_022450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 836 | 1 | R → K: dbSNP rs11807350. | VAR_030641 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 306 | 1 | D → G in AAQ89245. Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 682 | 1 | G → R in AAL02262. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 218 – 226 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 228 – 234 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 235 – 237 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 238 – 253 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 256 – 258 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 262 – 271 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 274 – 276 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 285 – 295 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 296 – 298 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 311 – 317 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 322 – 324 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 328 – 333 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 341 – 343 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 345 – 349 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 355 – 366 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 375 – 381 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 393 – 395 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 406 – 417 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 418 – 423 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 439 – 442 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 445 – 453 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 463 – 465 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 466 – 468 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 471 – 474 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 481 – 484 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 494 – 496 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 499 – 506 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [1] | "Purification and cloning of aggrecanase-1: a member of the ADAMTS family of proteins." Tortorella M.D., Burn T.C., Pratta M.A., Abbaszade I., Hollis J.M., Liu R.-Q., Rosenfeld S.A., Copeland R.A., Decicco C.P., Wynn R., Rockwell A., Yang F., Duke J.L., Solomon K., George H., Bruckner R., Nagase H., Itoh Y. Arner E.C.Science 284:1664-1666(1999) [PubMed: 10356395] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "ADAMTS-4 genomic locus." Sawaji Y., Nagase H., Saklatvala J., Clark A.R. Submitted (JUL-2001) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], VARIANT GLN-626. |
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| [7] | "The thrombospondin motif of aggrecanase-1 (ADAMTS-4) is critical for aggrecan substrate recognition and cleavage." Tortorella M.D., Pratta M.A., Liu R.-Q., Abbaszade I., Ross H., Burn T.C., Arner E.C. J. Biol. Chem. 275:25791-25797(2000) [PubMed: 10827174] [Abstract] Cited for: PARTIAL PROTEIN SEQUENCE, CHARACTERIZATION. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AF148213 mRNA. Translation: AAD41494.1. AY044847 Genomic DNA. Translation: AAL02262.1. AB014588 mRNA. Translation: BAA31663.2. Different initiation. AY358886 mRNA. Translation: AAQ89245.1. AL590714 Genomic DNA. Translation: CAH72146.1. BC063293 mRNA. Translation: AAH63293.1. | |||||||||||||||||||
| IPI | IPI00307276. | ||||||||||||||||||
| PIR | T00355. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_005090.3. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.211604 | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||
| MEROPS | M12.221. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PRIDE | O75173. | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000158859. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||
| GeneID | 9507. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:9507. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| GeneCards | GC01M159426. | ||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0001237. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:220. ADAMTS4. | ||||||||||||||||||
| MIM | 603876. gene. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA24548. | ||||||||||||||||||
| HUGE | Search... | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| HOGENOM | O75173. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | O75173. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BRENDA | 3.4.24.82. 247. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | O75173. | ||||||||||||||||||
| Bgee | O75173. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_ADAMTS4. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000158859. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR010294. ADAM_spacer1. IPR018358. Disintegrin_CS. IPR006025. Pept_M_Zn_BS. IPR001590. Peptidase_M12B. IPR013273. Peptidase_M12B_ADAM-TS. IPR002870. Peptidase_M12B_N. IPR000884. Thrombospondin_1_rpt. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF05986. ADAM_spacer1. 1 hit. PF01562. Pep_M12B_propep. 1 hit. PF01421. Reprolysin. 1 hit. PF00090. TSP_1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR01857. ADAMTSFAMILY. | ||||||||||||||||||
| SMART | SM00209. TSP1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50215. ADAM_MEPRO. 1 hit. PS00427. DISINTEGRIN_1. False negative. PS50214. DISINTEGRIN_2. False negative. PS50092. TSP1. 1 hit. PS00142. ZINC_PROTEASE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||
| NextBio | 35624. | ||||||||||||||||||
| PMAP-CutDB | O75173. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ATS4_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O75173 Secondary accession number(s): Q5VTW2 Q9UN83 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 1 Human chromosome 1: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| Peptidase families Classification of peptidase families and list of entries |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


