O67610 (FABG_AQUAE) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 88.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG EC=1.1.1.100 Alternative name(s): 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase Beta-ketoacyl-ACP reductase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Aquifex aeolicus (strain VF5) [Reference proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 224324 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Aquificae › Aquificales › Aquificaceae › Aquifex › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 248 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the NADPH-dependent reduction of beta-ketoacyl-ACP substrates to beta-hydroxyacyl-ACP products, the first reductive step in the elongation cycle of fatty acid biosynthesis By similarity. |
| Catalytic activity | (3R)-3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] + NADP+ = 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] + NADPH. |
| Pathway | |
| Subunit structure | Homotetramer. Ref.2 |
| Sequence similarities | Belongs to the short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Fatty acid biosynthesis Fatty acid metabolism Lipid biosynthesis Lipid metabolism |
| Ligand | NADP |
| Molecular function | Oxidoreductase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | fatty acid elongation Inferred from sequence or structural similarity. Source: UniProtKB |
| Molecular_function | 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADPH) activity Inferred from sequence or structural similarity. Source: UniProtKB NAD bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro NADP bindingInferred from sequence or structural similarity. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 248 | 248 | 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG | PRO_0000054664 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 14 – 17 | 4 | NADP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 65 – 66 | 2 | NADP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 157 – 161 | 5 | NADP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 157 | 1 | Proton acceptor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 39 | 1 | NADP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 92 | 1 | NADP; via carbonyl oxygen By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 144 | 1 | Substrate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 190 | 1 | NADP; via amide nitrogen and carbonyl oxygen By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 9 – 12 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 18 – 29 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 33 – 40 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 41 – 55 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 59 – 63 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 69 – 82 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 87 – 91 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 101 – 103 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 106 – 116 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 118 – 127 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 129 – 134 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 137 – 142 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 145 – 149 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 155 – 175 | 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 176 – 178 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 180 – 187 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 193 – 197 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 200 – 208 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 218 – 229 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 231 – 233 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 240 – 244 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "The complete genome of the hyperthermophilic bacterium Aquifex aeolicus." Deckert G., Warren P.V., Gaasterland T., Young W.G., Lenox A.L., Graham D.E., Overbeek R., Snead M.A., Keller M., Aujay M., Huber R., Feldman R.A., Short J.M., Olsen G.J., Swanson R.V. Nature 392:353-358(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: VF5. |
| [2] | "Crystal structure of aq_1716 from Aquifex aeolicus VF5." Southeast collaboratory for structural genomics (SECSG) Submitted (APR-2007) to the PDB data bank Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.84 ANGSTROMS), SUBUNIT. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE000657 Genomic DNA. Translation: AAC07575.1. | ||||||||||||||||||
| PIR | H70447. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_214176.1. NC_000918.1. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | O67610. | ||||||||||||||||||
| SMR | O67610. Positions 1-248. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| STRING | 224324.aq_1716. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | AAC07575; AAC07575; aq_1716. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 1193325. | ||||||||||||||||||
| KEGG | aae:aq_1716. | ||||||||||||||||||
| PATRIC | 20960424. VBIAquAeo85532_1317. | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | COG1028. | ||||||||||||||||||
| KO | K00059. | ||||||||||||||||||
| OMA | YLASNEG. | ||||||||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK2299806. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BioCyc | AAEO224324:GJBH-1227-MONOMER. | ||||||||||||||||||
| UniPathway | UPA00094. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| Gene3D | 3.40.50.720. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR011284. 3oxo_ACP_reduc. IPR002198. DH_sc/Rdtase_SDR. IPR002347. Glc/ribitol_DH. IPR016040. NAD(P)-bd_dom. IPR020904. Sc_DH/Rdtase_CS. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF000126. 11-beta-HSD1. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00081. GDHRDH. PR00080. SDRFAMILY. | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01830. 3oxo_ACP_reduc. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00061. ADH_SHORT. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | O67610. | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | FABG_AQUAE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O67610 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
