O67610 (FABG_AQUAE) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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January 25, 2012.
Version 77.
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| Protein names | Recommended name: 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG EC=1.1.1.100 Alternative name(s): 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase Beta-ketoacyl-ACP reductase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Aquifex aeolicus (strain VF5) | ||||
| Taxonomic identifier | 224324 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Aquificae › Aquificales › Aquificaceae › Aquifex |
Protein attributes
| Sequence length | 248 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the NADPH-dependent reduction of beta-ketoacyl-ACP substrates to beta-hydroxyacyl-ACP products, the first reductive step in the elongation cycle of fatty acid biosynthesis By similarity. |
| Catalytic activity | (3R)-3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] + NADP+ = 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] + NADPH. |
| Pathway | |
| Subunit structure | Homotetramer. Ref.2 |
| Sequence similarities | Belongs to the short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Fatty acid biosynthesis Lipid synthesis |
| Ligand | NADP |
| Molecular function | Oxidoreductase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | fatty acid biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADPH) activity Inferred from electronic annotation. Source: EC NAD bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 248 | 248 | 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG | PRO_0000054664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 14 – 17 | 4 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 65 – 66 | 2 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 157 – 161 | 5 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 157 | 1 | Proton acceptor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 39 | 1 | NADP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 92 | 1 | NADP; via carbonyl oxygen By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 144 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 190 | 1 | NADP; via amide nitrogen and carbonyl oxygen By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 9 – 14 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 18 – 29 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 33 – 39 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 41 – 55 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 59 – 63 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 69 – 82 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 87 – 91 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 101 – 103 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 106 – 116 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 118 – 127 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 129 – 134 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 137 – 142 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 146 – 149 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 155 – 175 | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 176 – 178 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 180 – 187 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 193 – 197 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 200 – 207 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 218 – 229 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 231 – 233 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 240 – 244 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
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References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "The complete genome of the hyperthermophilic bacterium Aquifex aeolicus." Deckert G., Warren P.V., Gaasterland T., Young W.G., Lenox A.L., Graham D.E., Overbeek R., Snead M.A., Keller M., Aujay M., Huber R., Feldman R.A., Short J.M., Olsen G.J., Swanson R.V. Nature 392:353-358(1998) [PubMed: 9537320] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: VF5. |
| [2] | "Crystal structure of aq_1716 from Aquifex aeolicus VF5." Southeast collaboratory for structural genomics (SECSG) Submitted (APR-2007) to the PDB data bank Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.84 ANGSTROMS), SUBUNIT. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE000657 Genomic DNA. Translation: AAC07575.1. | ||||||||||||||||||
| PIR | H70447. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_214176.1. NC_000918.1. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | O67610. | ||||||||||||||||||
| SMR | O67610. Positions 1-248. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| GeneID | 1193325. | ||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus aq_1716 in contig AE000657_GR. | ||||||||||||||||||
| KEGG | aae:aq_1716. | ||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|224324.1.peg.1191. | ||||||||||||||||||
| PATRIC | 20960424. VBIAquAeo85532_1317. | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG750976. | ||||||||||||||||||
| OMA | PENAKEM. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | O67610. | ||||||||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK2299806. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BioCyc | AAEO224324:AQ_1716-MONOMER. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR011284. 3oxo_ACP_reduc. IPR002198. DH_sc/Rdtase_SDR. IPR002347. Glc/ribitol_DH. IPR016040. NAD(P)-bd_dom. IPR020904. Sc_DH/Rdtase_CS. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.50.720. NAD(P)-bd. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| KO | K00059. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00106. adh_short. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00081. GDHRDH. PR00080. SDRFAMILY. | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01830. 3oxo_ACP_reduc. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00061. ADH_SHORT. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | FABG_AQUAE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O67610 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with