O67505 (FABI_AQUAE) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 92.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH] FabI Short name=ENR EC=1.3.1.9 Alternative name(s): NADH-dependent enoyl-ACP reductase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Aquifex aeolicus (strain VF5) [Reference proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 224324 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Aquificae › Aquificales › Aquificaceae › Aquifex › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 270 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the reduction of a carbon-carbon double bond in an enoyl moiety that is covalently linked to an acyl carrier protein (ACP). Involved in the elongation cycle of fatty acid which are used in the lipid metabolism By similarity. |
| Catalytic activity | Acyl-[acyl-carrier-protein] + NAD+ = trans-2,3-dehydroacyl-[acyl-carrier-protein] + NADH. |
| Pathway | |
| Subunit structure | Homotetramer. Ref.2 |
| Sequence similarities | Belongs to the short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family. FabI subfamily. |
| Sequence caution | The sequence AAC07465.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally shortened. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Fatty acid biosynthesis Fatty acid metabolism Lipid biosynthesis Lipid metabolism |
| Ligand | NAD |
| Molecular function | Oxidoreductase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | fatty acid elongation Inferred from sequence or structural similarity. Source: UniProtKB protein homotetramerizationInferred from sequence or structural similarity. Source: UniProtKB |
| Molecular_function | enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) activity Inferred from sequence or structural similarity. Source: UniProtKB nucleotide bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 270 | 270 | Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH] FabI | PRO_0000054894 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 19 – 20 | 2 | NAD By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 64 – 65 | 2 | NAD By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 192 – 196 | 5 | NAD By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 146 | 1 | Proton acceptor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 156 | 1 | Proton acceptor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 13 | 1 | NAD; via carbonyl oxygen By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 92 | 1 | NAD; via carbonyl oxygen By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 95 | 1 | Substrate; via amide nitrogen and carbonyl oxygen By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 163 | 1 | NAD By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 3 – 6 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 8 – 11 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 20 – 30 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 34 – 41 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 42 – 44 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 45 – 54 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 60 – 62 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 68 – 81 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 87 – 90 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 97 – 100 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 104 – 106 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 109 – 119 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 121 – 130 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 131 – 134 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 140 – 145 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 147 – 149 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 154 – 157 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 158 – 178 | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 179 – 181 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 183 – 189 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 203 – 213 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 222 – 232 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 235 – 237 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 244 – 248 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 251 – 253 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
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References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "The complete genome of the hyperthermophilic bacterium Aquifex aeolicus." Deckert G., Warren P.V., Gaasterland T., Young W.G., Lenox A.L., Graham D.E., Overbeek R., Snead M.A., Keller M., Aujay M., Huber R., Feldman R.A., Short J.M., Olsen G.J., Swanson R.V. Nature 392:353-358(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: VF5. |
| [2] | "Crystal structure of enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) from Aquifex aeolicus VF5." Southeast collaboratory for structural genomics (SECSG) Submitted (APR-2007) to the PDB data bank Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.0 ANGSTROMS), SUBUNIT. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE000657 Genomic DNA. Translation: AAC07465.1. Different initiation. | ||||||||||||
| PIR | G70434. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_214070.1. NC_000918.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | O67505. | ||||||||||||
| SMR | O67505. Positions 2-257. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| STRING | 224324.aq_1552. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| EnsemblBacteria | AAC07465; AAC07465; aq_1552. | ||||||||||||
| GeneID | 1193128. | ||||||||||||
| KEGG | aae:aq_1552. | ||||||||||||
| PATRIC | 20960182. VBIAquAeo85532_1204. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG0623. | ||||||||||||
| KO | K00208. | ||||||||||||
| OMA | LVHCLAF. | ||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK2299749. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | AAEO224324:GJBH-1112-MONOMER. | ||||||||||||
| UniPathway | UPA00094. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| Gene3D | 3.40.50.720. 1 hit. | ||||||||||||
| InterPro | IPR014358. Enoyl-ACP_Rdtase_NADH. IPR002347. Glc/ribitol_DH. IPR016040. NAD(P)-bd_dom. [Graphical view] | ||||||||||||
| PIRSF | PIRSF000094. Enoyl-ACP_rdct. 1 hit. | ||||||||||||
| PRINTS | PR00081. GDHRDH. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| EvolutionaryTrace | O67505. | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | FABI_AQUAE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O67505 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
