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UniProtKB/Swiss-Prot O67505 (FABI_AQUAE)
Last modified
June 16, 2009.
Version 62.
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Documents (3) |
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Names and origin · Protein attributes · General annotation (Comments) · Ontologies · Sequence annotation (Features) · Sequences · References · Cross-references · Entry information · Relevant documents
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH] EC=1.3.1.9 Alternative name(s): NADH-dependent enoyl-ACP reductase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Aquifex aeolicus [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 63363 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Aquificae › Aquificales › Aquificaceae › Aquifex |
Protein attributes
| Sequence length | 270 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | Acyl-[acyl-carrier-protein] + NAD+ = trans-2,3-dehydroacyl-[acyl-carrier-protein] + NADH. |
| Pathway | |
| Sequence similarities | Belongs to the short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family. FabI subfamily. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Fatty acid biosynthesis Lipid synthesis |
| Ligand | NAD |
| Molecular function | Oxidoreductase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | fatty acid biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW oxidation reductionInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 270 | 270 | Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH] | PRO_0000054894 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 10 – 36 | 27 | NAD By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 156 | 1 | Proton acceptor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 3 – 6 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 8 – 11 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 20 – 30 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 34 – 41 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 42 – 44 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 45 – 54 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 60 – 62 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 68 – 81 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 87 – 90 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 97 – 100 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 104 – 106 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 109 – 119 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 121 – 130 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 131 – 134 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 140 – 145 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 147 – 149 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 154 – 157 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 158 – 178 | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 179 – 181 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 183 – 189 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 203 – 213 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 222 – 232 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 235 – 237 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 244 – 248 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 251 – 253 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "The complete genome of the hyperthermophilic bacterium Aquifex aeolicus." Deckert G., Warren P.V., Gaasterland T., Young W.G., Lenox A.L., Graham D.E., Overbeek R., Snead M.A., Keller M., Aujay M., Huber R., Feldman R.A., Short J.M., Olsen G.J., Swanson R.V. Nature 392:353-358(1998) [PubMed: 9537320] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: VF5. |
| [2] | "Crystal structure of enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) from Aquifex aeolicus VF5." Southeast collaboratory for structural genomics (SECSG) Submitted (APR-2007) to the PDB data bank Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.0 ANGSTROMS). |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AE000657 Genomic DNA. Translation: AAC07465.1. Different initiation. | |||||||||||||
| PIR | G70434. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_214070.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| |||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 1193128. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus aq_1552 in contig AE000657_GR. | ||||||||||||
| KEGG | aae:aq_1552. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|224324.1.peg.1085. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | O67505. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | AAEO224324:AQ_1552-MON. | ||||||||||||
| BRENDA | 1.3.1.9. 189781. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR002198. DH_sc/Rdtase_SDR. IPR014358. Enoyl-ACP_Rdtase_NADH. IPR002347. Glc/ribitol_DH. IPR016040. NAD(P)-bd_dom. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.50.720. NAD(P)-bd. 1 hit. | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR19410. ADH_short_C2. 1 hit. PTHR19410:SF12. Enoyl-ACP_rdct. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF00106. adh_short. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PRINTS | PR00081. GDHRDH. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | FABI_AQUAE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O67505 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


