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UniProtKB/Swiss-Prot O67004 (SURE_AQUAE)
Last modified
November 3, 2009.
Version 56.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (2) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: 5'-nucleotidase surE EC=3.1.3.5 Alternative name(s): Nucleoside 5'-monophosphate phosphohydrolase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Aquifex aeolicus [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 63363 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Aquificae › Aquificales › Aquificaceae › Aquifex |
Protein attributes
| Sequence length | 251 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Nucleotidase that shows phosphatase activity on nucleoside 5'-monophosphates By similarity. |
| Catalytic activity | A 5'-ribonucleotide + H2O = a ribonucleoside + phosphate. HAMAP MF_00060 |
| Cofactor | Binds 1 divalent metal cation per subunit By similarity. |
| Subcellular location | Cytoplasm Potential. |
| Sequence similarities | Belongs to the surE nucleotidase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | Metal-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Hydrolase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | 5'-nucleotidase activity Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP metal ion bindingInferred from electronic annotation. Source: HAMAP nucleotide bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 251 | 251 | 5'-nucleotidase surE HAMAP MF_00060 | PRO_0000111788 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 9 | 1 | Divalent metal cation By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 10 | 1 | Divalent metal cation By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 40 | 1 | Divalent metal cation By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 94 | 1 | Divalent metal cation By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 3 – 7 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 15 – 24 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 25 – 27 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 28 – 37 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 52 – 58 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 64 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 69 – 78 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 79 – 83 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 87 – 96 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 100 – 105 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 107 – 117 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 122 – 128 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 130 – 132 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 135 – 152 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 158 – 167 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 169 – 171 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 174 – 177 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 184 – 193 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 199 – 207 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 208 – 211 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 217 – 222 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 225 – 233 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 238 – 248 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "The complete genome of the hyperthermophilic bacterium Aquifex aeolicus." Deckert G., Warren P.V., Gaasterland T., Young W.G., Lenox A.L., Graham D.E., Overbeek R., Snead M.A., Keller M., Aujay M., Huber R., Feldman R.A., Short J.M., Olsen G.J., Swanson R.V. Nature 392:353-358(1998) [PubMed: 9537320] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: VF5. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AE000657 Genomic DNA. Translation: AAC06967.1. | |||||||||||||
| PIR | A70372. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_213565.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| |||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 1193454. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus aq_832 in contig AE000657_GR. | ||||||||||||
| KEGG | aae:aq_832. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|224324.1.peg.580. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | O67004. | ||||||||||||
| OMA | NLNIPPC. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | AAEO224324:AQ_832-MON. | ||||||||||||
| BRENDA | 3.1.3.5. 189781. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00060. [Tree] | ||||||||||||
| InterPro | IPR002828. SurE-like_Pase/nucleotidase. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.1210.10. SurE-like_Pase/nucleotidase. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF01975. SurE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProDom | PD005378. SurE. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00087. surE. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | SURE_AQUAE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O67004 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


