O67004 (SURE_AQUAE) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 68.
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| Protein names | Recommended name: 5'-nucleotidase surE EC=3.1.3.5 Alternative name(s): Nucleoside 5'-monophosphate phosphohydrolase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Aquifex aeolicus (strain VF5) | ||||
| Taxonomic identifier | 224324 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Aquificae › Aquificales › Aquificaceae › Aquifex |
Protein attributes
| Sequence length | 251 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Nucleotidase that shows phosphatase activity on nucleoside 5'-monophosphates By similarity. HAMAP MF_00060 |
| Catalytic activity | A 5'-ribonucleotide + H2O = a ribonucleoside + phosphate. HAMAP MF_00060 |
| Cofactor | Binds 1 divalent metal cation per subunit By similarity. |
| Subcellular location | Cytoplasm Potential HAMAP MF_00060. |
| Sequence similarities | Belongs to the surE nucleotidase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | Metal-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Hydrolase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | 5'-nucleotidase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC metal ion bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW nucleotide bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 251 | 251 | 5'-nucleotidase surE HAMAP MF_00060 | PRO_0000111788 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 9 | 1 | Divalent metal cation By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 10 | 1 | Divalent metal cation By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 40 | 1 | Divalent metal cation By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 94 | 1 | Divalent metal cation By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 3 – 7 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 15 – 24 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 25 – 27 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 28 – 37 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 52 – 58 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 64 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 69 – 78 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 79 – 83 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 87 – 96 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 100 – 105 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 107 – 117 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 122 – 128 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 130 – 132 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 135 – 152 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 158 – 167 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 169 – 171 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 174 – 177 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 184 – 193 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 199 – 207 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 208 – 211 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 217 – 222 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 225 – 233 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 238 – 248 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "The complete genome of the hyperthermophilic bacterium Aquifex aeolicus." Deckert G., Warren P.V., Gaasterland T., Young W.G., Lenox A.L., Graham D.E., Overbeek R., Snead M.A., Keller M., Aujay M., Huber R., Feldman R.A., Short J.M., Olsen G.J., Swanson R.V. Nature 392:353-358(1998) [PubMed: 9537320] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: VF5. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE000657 Genomic DNA. Translation: AAC06967.1. | ||||||||||||
| PIR | A70372. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_213565.1. NC_000918.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | O67004. | ||||||||||||
| SMR | O67004. Positions 2-249. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 1193454. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus aq_832 in contig AE000657_GR. | ||||||||||||
| KEGG | aae:aq_832. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|224324.1.peg.580. | ||||||||||||
| PATRIC | 20959050. VBIAquAeo85532_0650. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | HBG600532. | ||||||||||||
| OMA | NGFYYVN. | ||||||||||||
| PhylomeDB | O67004. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK00346. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | AAEO224324:AQ_832-MONOMER. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00060. SurE. [Tree] | ||||||||||||
| InterPro | IPR002828. SurE-like_Pase/nucleotidase. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.1210.10. SurE-like_Pase/nucleotidase. 1 hit. | ||||||||||||
| KO | K03787. | ||||||||||||
| Pfam | PF01975. SurE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF64167. SurE-like_Pase/nucleotidase. 1 hit. | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00087. SurE. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | SURE_AQUAE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O67004 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with