O60763 (USO1_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 100.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Alt products·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Alt products·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: General vesicular transport factor p115 Alternative name(s): Protein USO1 homolog Transcytosis-associated protein Short name=TAP Vesicle-docking protein | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 962 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | General vesicular transport factor required for intercisternal transport in the Golgi stack; it is required for transcytotic fusion and/or subsequent binding of the vesicles to the target membrane. May well act as a vesicular anchor by interacting with the target membrane and holding the vesicular and target membranes in proximity By similarity. |
| Subunit structure | Homodimer. Dimerizes by parallel association of the tails, resulting in an elongated structure with two globular head domains side by side, and a long rod-like tail structure Probable. Interacts with MIF. Ref.10 Ref.14 |
| Subcellular location | Cytoplasm › cytosol. Golgi apparatus membrane; Peripheral membrane protein. Note: Recycles between the cytosol and the Golgi apparatus during interphase. During interphase, the phosphorylated form is found exclusively in cytosol; the unphosphorylated form is associated with Golgi apparatus membranes. Ref.1 Ref.10 |
| Domain | Composed of a globular head, an elongated tail (coiled-coil) and a highly acidic C-terminal domain. Ref.14 |
| Post-translational modification | Phosphorylated in a cell cycle-specific manner; phosphorylated in interphase but not in mitotic cells. Dephosphorylated protein associates with the Golgi membrane; phosphorylation promotes dissociation. Ref.1 Ref.6 Ref.7 Ref.8 Ref.9 Ref.11 |
| Sequence similarities | Belongs to the VDP/USO1/EDE1 family. Contains 10 ARM repeats. |
| Sequence caution | The sequence AAH06398.1 differs from that shown. Reason: Contaminating sequence. Potential poly-A sequence. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | ER-Golgi transport Protein transport Transport |
| Cellular component | Cytoplasm Golgi apparatus Membrane |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing |
| Domain | Coiled coil Repeat |
| PTM | Acetylation Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | intracellular protein transport Inferred from electronic annotation. Source: InterPro vesicle fusion with Golgi apparatusInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular component | Golgi membrane Traceable author statement. Source: ProtInc cytosolInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro protein transporter activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: O60763-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: O60763-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 98-98: V → VDDVE 484-484: Q → QGDKIDRR |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 962 | 962 | General vesicular transport factor p115 | PRO_0000065774 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 48 – 91 | 44 | ARM 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 112 – 151 | 40 | ARM 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 154 – 194 | 41 | ARM 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 196 – 241 | 46 | ARM 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 242 – 290 | 49 | ARM 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 292 – 341 | 50 | ARM 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 342 – 393 | 52 | ARM 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 394 – 448 | 55 | ARM 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 450 – 501 | 52 | ARM 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 503 – 548 | 46 | ARM 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 1 – 637 | 637 | Globular head | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coiled coil | 638 – 930 | 293 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 935 – 962 | 28 | Asp/Glu-rich (acidic) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 202 | 1 | N6-acetyllysine Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 942 | 1 | Phosphoserine Ref.1 Ref.6 Ref.7 Ref.8 Ref.9 Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 952 | 1 | Phosphoserine Ref.7 Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 98 | 1 | V → VDDVE in isoform 2. | VSP_039120 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 484 | 1 | Q → QGDKIDRR in isoform 2. | VSP_039121 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 942 | 1 | S → A: Loss of phosphorylation. Promotes association with Golgi membranes. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 942 | 1 | S → D: Decreased association with Golgi membranes. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 75 | 1 | D → G in CAD89917. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 85 | 1 | T → I in BAA25300. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 93 | 1 | Missing in AAH32654. Ref.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 248 | 1 | N → Y in CAD89917. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 650 | 1 | N → D in CAD89917. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 877 | 1 | Q → R in BAG36947. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 60 – 62 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 63 – 71 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 76 – 78 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 82 – 91 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 112 – 119 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 122 – 130 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 136 – 139 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 144 – 152 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 156 – 163 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 169 – 172 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 173 – 176 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 180 – 184 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 188 – 194 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 200 – 206 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 209 – 219 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 228 – 240 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 244 – 251 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 256 – 259 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 261 – 263 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 274 – 290 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 300 – 309 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 313 – 321 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 327 – 341 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 345 – 352 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 364 – 372 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 379 – 393 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 405 – 407 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 434 – 448 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 452 – 458 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 474 – 481 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 495 – 502 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 506 – 513 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 518 – 522 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 534 – 537 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 541 – 544 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 548 – 551 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 557 – 559 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 561 – 571 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 575 – 580 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 590 – 593 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 604 – 606 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 611 – 620 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 624 – 627 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Phosphorylation of the vesicle docking protein p115 regulates its association with the Golgi membrane." Sohda M., Misumi Y., Yano A., Takami N., Ikehara Y. J. Biol. Chem. 273:5385-5388(1998) [PubMed: 9478999] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1), SUBCELLULAR LOCATION, MUTAGENESIS OF SER-942, PHOSPHORYLATION AT SER-942. |
| [2] | "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs." Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., Otsuki T., Sugiyama T., Irie R., Wakamatsu A., Hayashi K., Sato H., Nagai K., Kimura K., Makita H., Sekine M., Obayashi M., Nishi T., Shibahara T., Tanaka T., Ishii S. Sugano S.Nat. Genet. 36:40-45(2004) [PubMed: 14702039] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: Testis. |
| [3] | "The full-ORF clone resource of the German cDNA consortium." Bechtel S., Rosenfelder H., Duda A., Schmidt C.P., Ernst U., Wellenreuther R., Mehrle A., Schuster C., Bahr A., Bloecker H., Heubner D., Hoerlein A., Michel G., Wedler H., Koehrer K., Ottenwaelder B., Poustka A., Wiemann S., Schupp I. BMC Genomics 8:399-399(2007) [PubMed: 17974005] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 2). Tissue: Skeletal muscle. |
| [4] | "Generation and annotation of the DNA sequences of human chromosomes 2 and 4." Hillier L.W., Graves T.A., Fulton R.S., Fulton L.A., Pepin K.H., Minx P., Wagner-McPherson C., Layman D., Wylie K., Sekhon M., Becker M.C., Fewell G.A., Delehaunty K.D., Miner T.L., Nash W.E., Kremitzki C., Oddy L., Du H. Wilson R.K.Nature 434:724-731(2005) [PubMed: 15815621] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [5] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: Uterus. |
| [6] | "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks." Olsen J.V., Blagoev B., Gnad F., Macek B., Kumar C., Mortensen P., Mann M. Cell 127:635-648(2006) [PubMed: 17081983] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-942, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Cervix carcinoma. |
| [7] | "A quantitative atlas of mitotic phosphorylation." Dephoure N., Zhou C., Villen J., Beausoleil S.A., Bakalarski C.E., Elledge S.J., Gygi S.P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105:10762-10767(2008) [PubMed: 18669648] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-942 AND SER-952, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Cervix carcinoma. |
| [8] | "Large-scale phosphoproteome analysis of human liver tissue by enrichment and fractionation of phosphopeptides with strong anion exchange chromatography." Han G., Ye M., Zhou H., Jiang X., Feng S., Jiang X., Tian R., Wan D., Zou H., Gu J. Proteomics 8:1346-1361(2008) [PubMed: 18318008] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-942, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Liver. |
| [9] | "Lys-N and trypsin cover complementary parts of the phosphoproteome in a refined SCX-based approach." Gauci S., Helbig A.O., Slijper M., Krijgsveld J., Heck A.J., Mohammed S. Anal. Chem. 81:4493-4501(2009) [PubMed: 19413330] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-942, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Embryonic kidney. |
| [10] | "The Golgi-associated protein p115 mediates the secretion of macrophage migration inhibitory factor." Merk M., Baugh J., Zierow S., Leng L., Pal U., Lee S.J., Ebert A.D., Mizue Y., Trent J.O., Mitchell R., Nickel W., Kavathas P.B., Bernhagen J., Bucala R. J. Immunol. 182:6896-6906(2009) [PubMed: 19454686] [Abstract] Cited for: SUBCELLULAR LOCATION, INTERACTION WITH MIF. |
| [11] | "Quantitative phosphoproteomic analysis of T cell receptor signaling reveals system-wide modulation of protein-protein interactions." Mayya V., Lundgren D.H., Hwang S.-I., Rezaul K., Wu L., Eng J.K., Rodionov V., Han D.K. Sci. Signal. 2:RA46-RA46(2009) [PubMed: 19690332] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-942 AND SER-952, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Leukemic T-cell. |
| [12] | "Lysine acetylation targets protein complexes and co-regulates major cellular functions." Choudhary C., Kumar C., Gnad F., Nielsen M.L., Rehman M., Walther T., Olsen J.V., Mann M. Science 325:834-840(2009) [PubMed: 19608861] [Abstract] Cited for: ACETYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT LYS-202, MASS SPECTROMETRY. |
| [13] | "Initial characterization of the human central proteome." Burkard T.R., Planyavsky M., Kaupe I., Breitwieser F.P., Buerckstuemmer T., Bennett K.L., Superti-Furga G., Colinge J. BMC Syst. Biol. 5:17-17(2011) [PubMed: 21269460] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION BY MASS SPECTROMETRY [LARGE SCALE ANALYSIS]. |
| [14] | "Unusual armadillo fold in the human general vesicular transport factor p115." Striegl H., Roske Y., Kuemmel D., Heinemann U. PLoS ONE 4:E4656-E4656(2009) [PubMed: 19247479] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.22 ANGSTROMS) OF 53-629, DOMAIN ARM REPEATS, SUBUNIT. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | D86326 mRNA. Translation: BAA25300.1. AK314289 mRNA. Translation: BAG36947.1. AL832010 mRNA. Translation: CAD89917.1. AC110615 Genomic DNA. No translation available. AC104828 Genomic DNA. No translation available. BC006398 mRNA. Translation: AAH06398.1. Sequence problems. BC032654 mRNA. Translation: AAH32654.1. | ||||||||||||
| IPI | IPI00031583. IPI00941161. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_003706.1. NM_003715.2. | ||||||||||||
| UniGene | Hs.292689. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | O60763. | ||||||||||||
| SMR | O60763. Positions 17-629. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| IntAct | O60763. 7 interactions. | ||||||||||||
| MINT | MINT-1136055. | ||||||||||||
| STRING | O60763. | ||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||
| PhosphoSite | O60763. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PRIDE | O60763. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENST00000264904; ENSP00000264904; ENSG00000138768. | ||||||||||||
| GeneID | 8615. | ||||||||||||
| KEGG | hsa:8615. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CTD | 8615. | ||||||||||||
| GeneCards | GC04P076649. | ||||||||||||
| HGNC | HGNC:30904. USO1. | ||||||||||||
| HPA | CAB010108. | ||||||||||||
| MIM | 603344. gene. | ||||||||||||
| neXtProt | NX_O60763. | ||||||||||||
| PharmGKB | PA162408713. | ||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| GeneTree | ENSGT00390000017018. | ||||||||||||
| HOVERGEN | HBG018067. | ||||||||||||
| InParanoid | O60763. | ||||||||||||
| PhylomeDB | O60763. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | arf_3pathway. Arf1 pathway. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | O60763. | ||||||||||||
| Bgee | O60763. | ||||||||||||
| CleanEx | HS_USO1. | ||||||||||||
| Genevestigator | O60763. | ||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000138768. Homo sapiens. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR016024. ARM-type_fold. IPR000225. Armadillo. IPR006955. Uso1_p115_C. IPR024095. Vesicle_P115-like. IPR006953. Vesicle_Uso1_P115_head. [Graphical view] | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR10013. PTHR10013. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF04871. Uso1_p115_C. 1 hit. PF04869. Uso1_p115_head. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF48371. ARM-type_fold. 2 hits. | ||||||||||||
| PROSITE | PS50176. ARM_REPEAT. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| NextBio | 32287. | ||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | USO1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O60763 Secondary accession number(s): B2RAQ0 Q8N592 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 4 Human chromosome 4: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with