O59071 (GUAAA_PYRHO) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 76.
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| Protein names | Recommended name: GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] subunit A EC=6.3.5.2 Alternative name(s): Glutamine amidotransferase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 70601 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Archaea › Euryarchaeota › Thermococci › Thermococcales › Thermococcaceae › Pyrococcus |
Protein attributes
| Sequence length | 189 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the synthesis of GMP from XMP By similarity. HAMAP MF_01510 |
| Catalytic activity | ATP + xanthosine 5'-phosphate + L-glutamine + H2O = AMP + diphosphate + GMP + L-glutamate. HAMAP MF_01510 |
| Pathway | Purine metabolism; GMP biosynthesis; GMP from XMP (L-Gln route): step 1/1. HAMAP MF_01510 |
| Subunit structure | Heterodimer composed of a glutamine amidotransferase subunit (A) and a GMP-binding subunit (B) Potential. |
| Sequence similarities | Contains 1 glutamine amidotransferase type-1 domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | GMP biosynthesis Purine biosynthesis |
| Domain | Glutamine amidotransferase |
| Ligand | ATP-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Ligase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | GMP biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW glutamine metabolic processInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW GMP synthase (glutamine-hydrolyzing) activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 189 | 189 | GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] subunit A HAMAP MF_01510 | PRO_0000140230 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 2 – 189 | 188 | Glutamine amidotransferase type-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 79 | 1 | Nucleophile By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 166 | 1 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 168 | 1 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 7 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 13 – 22 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 26 – 31 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 36 – 41 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 45 – 49 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 61 – 66 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 68 – 70 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 75 – 78 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 80 – 89 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 92 – 95 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 102 – 109 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 120 – 126 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 129 – 134 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 139 – 147 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 151 – 158 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 160 – 165 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 175 – 186 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Complete sequence and gene organization of the genome of a hyper-thermophilic archaebacterium, Pyrococcus horikoshii OT3." Kawarabayasi Y., Sawada M., Horikawa H., Haikawa Y., Hino Y., Yamamoto S., Sekine M., Baba S., Kosugi H., Hosoyama A., Nagai Y., Sakai M., Ogura K., Otsuka R., Nakazawa H., Takamiya M., Ohfuku Y., Funahashi T. Kikuchi H.DNA Res. 5:55-76(1998) [PubMed: 9679194] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | BA000001 Genomic DNA. Translation: BAA30452.1. | ||||||||||||||||||
| PIR | D71006. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_143229.1. NC_000961.1. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | O59071. | ||||||||||||||||||
| SMR | O59071. Positions 2-189. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | EBPYRT00000000399; EBPYRP00000000399; EBPYRG00000000399. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 1443672. | ||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus PH1346 in contig BA000001_GR. | ||||||||||||||||||
| KEGG | pho:PH1346. | ||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|70601.1.peg.1325. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| GeneTree | EBGT00050000022457. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG292341. | ||||||||||||||||||
| OMA | GQYVHRI. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | O59071. | ||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK00758. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BioCyc | PHOR70601:PH1346-MONOMER. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_01510. GMP_synthase_A. [Tree] | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR017926. GATASE_1. IPR004739. GMP_synth_N. IPR023686. GMP_synthase_A. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| KO | K01951. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00117. GATase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00888. GuaA_Nterm. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS51273. GATASE_TYPE_1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | GUAAA_PYRHO | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O59071 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with