Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot O43488 (ARK72_HUMAN)
Last modified
December 15, 2009.
Version 97.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (6) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Aflatoxin B1 aldehyde reductase member 2 EC=1.1.1.n11 Alternative name(s): Succinic semialdehyde reductase Short name=SSA reductase AFB1-AR 1 Aldoketoreductase 7 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 359 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the NADPH-dependent reduction of succinic semialdehyde to gamma-hydroxybutyrate. May have an important role in producing the neuromodulator gamma-hydroxybutyrate (GHB). Has broad substrate specificity. Has NADPH-dependent aldehyde reductase activity towards 2-carboxybenzaldehyde, 2-nitrobenzaldehyde and pyridine-2-aldehyde (in vitro). Can reduce 1,2-naphthoquinone and 9,10-phenanthrenequinone (in vitro). Can reduce the dialdehyde protein-binding form of aflatoxin B1 (AFB1) to the non-binding AFB1 dialcohol. May be involved in protection of liver against the toxic and carcinogenic effects of AFB1, a potent hepatocarcinogen. Ref.3 Ref.9 |
| Subunit structure | Homodimer. Ref.3 |
| Subcellular location | Golgi apparatus By similarity. Cytoplasm. |
| Tissue specificity | Detected in brain, liver, small intestine and testis, and at lower levels in heart, prostate, skeletal muscle and spleen. Detected in kidney proximal and distal tubules, endothelial cells lining the Bowman's capsules and some cysts. Detected at low levels in lung and pancreas (at protein level). Widely expressed. Ref.3 Ref.7 |
| Sequence similarities | Belongs to the aldo/keto reductase 2 family. |
| Caution | It is uncertain whether Met-1 or Met-30 is the initiator. |
| Biophysicochemical properties | Kinetic parameters: KM=20 µM for succinic semialdehyde KM=17 µM for 2-carboxybenzaldehyde KM=8 µM for 9,10-phenanthrenequinone KM=102 µM for 1,2-naphthoquinone |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm Golgi apparatus |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Ligand | NADP |
| Molecular function | Oxidoreductase |
| PTM | Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | carbohydrate metabolic process Ref.3 Traceable author statement. Source: ProtInc cellular aldehyde metabolic process Ref.3Traceable author statement. Source: ProtInc oxidation reductionInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular component | Golgi apparatus Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | aldehyde reductase activity Ref.3 Traceable author statement. Source: ProtInc electron carrier activity Ref.3Traceable author statement. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 359 | 359 | Aflatoxin B1 aldehyde reductase member 2 | PRO_0000070375 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 171 – 172 | 2 | NADP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 226 – 236 | 11 | NADP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 318 – 326 | 9 | NADP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 77 | 1 | Proton donor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 72 | 1 | NADP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 141 | 1 | Substrate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 197 | 1 | NADP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 250 | 1 | NADP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 260 | 1 | Substrate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 263 | 1 | Substrate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 359 | 1 | Substrate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 105 | 1 | Lowers pKa of active site Tyr By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 40 | 1 | Phosphoserine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 255 | 1 | Phosphoserine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 135 | 1 | V → M: dbSNP rs6670759. | VAR_048209 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 142 | 1 | A → T: dbSNP rs1043657. Ref.3 Ref.13 | VAR_017413 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 157 | 1 | Q → H: dbSNP rs859208. Ref.13 | VAR_017414 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 180 | 1 | E → K: dbSNP rs859210. | VAR_060222 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 198 | 1 | G → S: dbSNP rs2231200. | VAR_048210 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 214 | 1 | C → Y: dbSNP rs2235794. | VAR_017415 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 255 | 1 | S → N: dbSNP rs2231203. | VAR_048211 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 39 – 43 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 48 – 50 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 53 – 65 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 70 – 72 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 77 – 80 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 81 – 87 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 101 – 106 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 116 – 130 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 135 – 140 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 149 – 161 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 164 – 172 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 175 – 188 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 193 – 199 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 206 – 208 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 211 – 218 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 221 – 225 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 229 – 234 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 239 – 242 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 243 – 245 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 252 – 254 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 257 – 264 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 267 – 284 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 285 – 287 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 291 – 302 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 307 – 309 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 312 – 315 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 320 – 330 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 337 – 350 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 351 – 353 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1." Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E., Kaul R., Swarbreck D., Dunham A., Scott C.E., Howe K.L., Woodfine K., Spencer C.C.A., Jones M.C., Gillson C., Searle S., Zhou Y., Kokocinski F., McDonald L., Evans R., Phillips K. Bentley D.R.Nature 441:315-321(2006) [PubMed: 16710414] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [2] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] OF 2-359. Tissue: Pancreas, Skin and Uterus. |
| [3] | "Molecular cloning, expression and catalytic activity of a human AKR7 member of the aldo-keto reductase superfamily: evidence that the major 2-carboxybenzaldehyde reductase from human liver is a homologue of rat aflatoxin B1-aldehyde reductase." Ireland L.S., Harrison D.J., Neal G.E., Hayes J.D. Biochem. J. 332:21-34(1998) [PubMed: 9576847] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 5-359, PARTIAL PROTEIN SEQUENCE, FUNCTION, SUBUNIT, SUBCELLULAR LOCATION, TISSUE SPECIFICITY, VARIANT THR-142. Tissue: Liver. |
| [4] | "Cloning of the human aflatoxin B1-aldehyde reductase gene at 1p35-1p36.1 in a region frequently altered in human tumor cells." Praml C., Savelyeva L., Perri P., Schwab M. Cancer Res. 58:5014-5018(1998) [PubMed: 9823300] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 7-359. Tissue: Brain. |
| [5] | "Cloning of human full-length CDSs in BD Creator(TM) system donor vector." Kalnine N., Chen X., Rolfs A., Halleck A., Hines L., Eisenstein S., Koundinya M., Raphael J., Moreira D., Kelley T., LaBaer J., Lin Y., Phelan M., Farmer A. Submitted (MAY-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] OF 30-359. |
| [6] | Lubec G., Vishwanath V. Submitted (MAR-2007) to UniProtKB Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 222-236; 251-261 AND 279-297, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Brain and Cajal-Retzius cell. |
| [7] | "Major differences exist in the function and tissue-specific expression of human aflatoxin B1 aldehyde reductase and the principal human aldo-keto reductase AKR1 family members." O'Connor T., Ireland L.S., Harrison D.J., Hayes J.D. Biochem. J. 343:487-504(1999) [PubMed: 10510318] [Abstract] Cited for: CATALYTIC ACTIVITY, BIOPHYSICOCHEMICAL PROPERTIES, TISSUE SPECIFICITY. |
| [8] | "Novel homodimeric and heterodimeric rat gamma-hydroxybutyrate synthases that associate with the Golgi apparatus define a distinct subclass of aldo-keto reductase 7 family proteins." Kelly V.P., Sherratt P.J., Crouch D.H., Hayes J.D. Biochem. J. 366:847-861(2002) [PubMed: 12071861] [Abstract] Cited for: GENE STRUCTURE. |
| [9] | "Synthesis and catabolism of gamma-hydroxybutyrate in SH-SY5Y human neuroblastoma cells: role of the aldo-keto reductase AKR7A2." Lyon R.C., Johnston S.M., Watson D.G., McGarvie G., Ellis E.M. J. Biol. Chem. 282:25986-25992(2007) [PubMed: 17591773] [Abstract] Cited for: FUNCTION. |
| [10] | Colinge J., Superti-Furga G., Bennett K.L. Submitted (OCT-2008) to UniProtKB Cited for: IDENTIFICATION [LARGE SCALE ANALYSIS], MASS SPECTROMETRY. |
| [11] | "Quantitative phosphoproteomic analysis of T cell receptor signaling reveals system-wide modulation of protein-protein interactions." Mayya V., Lundgren D.H., Hwang S.-I., Rezaul K., Wu L., Eng J.K., Rodionov V., Han D.K. Sci. Signal. 2:RA46-RA46(2009) [PubMed: 19690332] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-255, MASS SPECTROMETRY. Tissue: T-cell. |
| [12] | "Structure of the aflatoxin aldehyde reductase in complex with NADPH." Structural genomics consortium (SGC) Submitted (FEB-2009) to the PDB data bank Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.4 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH NADP. |
| [13] | "Genetic variation of aflatoxin B1 aldehyde reductase genes (AFAR) in human tumour cells." Praml C., Schulz W., Claas A., Mollenhauer J., Poustka A., Ackermann R., Schwab M., Henrich K.-O. Cancer Lett. 272:160-166(2008) [PubMed: 18752886] [Abstract] Cited for: VARIANTS THR-142 AND HIS-157. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AL035413 Genomic DNA. Translation: CAB72321.1. Different initiation. BC004111 mRNA. Translation: AAH04111.3. Different initiation. BC007352 mRNA. Translation: AAH07352.2. BC010852 mRNA. Translation: AAH10852.1. Different initiation. BC011586 mRNA. Translation: AAH11586.1. Different initiation. BC012171 mRNA. Translation: AAH12171.1. Different initiation. BC013996 mRNA. Translation: AAH13996.1. Different initiation. AF026947 mRNA. Translation: AAC52104.1. Different initiation. Y16675 mRNA. Translation: CAA76347.1. Different initiation. BT007347 mRNA. Translation: AAP36011.1. Different initiation. BK000395 mRNA. Translation: DAA00088.1. | |||||||||||||
| IPI | IPI00305978. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_003680.2. | ||||||||||||
| UniGene | Hs.571886 | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| |||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| IntAct | O43488. 2 interactions. | ||||||||||||
| STRING | O43488. | ||||||||||||
2-D gel databases | |||||||||||||
| REPRODUCTION-2DPAGE | IPI00305978. O43488. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PRIDE | O43488. | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENST00000235835; ENSP00000235835; ENSG00000053371; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||
| GeneID | 8574. | ||||||||||||
| KEGG | hsa:8574. | ||||||||||||
| UCSC | uc001bbw.1. human. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CTD | 8574. | ||||||||||||
| GeneCards | GC01M019503. | ||||||||||||
| H-InvDB | HIX0000198. | ||||||||||||
| HGNC | HGNC:389. AKR7A2. | ||||||||||||
| MIM | 603418. gene. | ||||||||||||
| PharmGKB | PA24682. | ||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | HBG605727. | ||||||||||||
| HOVERGEN | O43488. | ||||||||||||
| InParanoid | O43488. | ||||||||||||
| OMA | HHFEAIA. | ||||||||||||
| OrthoDB | EOG9VT8GK. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | O43488. | ||||||||||||
| Bgee | O43488. | ||||||||||||
| CleanEx | HS_AKR7A2. | ||||||||||||
| Genevestigator | O43488. | ||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000053371. Homo sapiens. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR001395. Aldo/ket_red. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.20.20.100. Aldo/ket_red. 1 hit. | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR11732. Aldo/ket_red. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF00248. Aldo_ket_red. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||
| NextBio | 32161. | ||||||||||||
| PMAP-CutDB | O43488. | ||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | ARK72_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O43488 Secondary accession number(s): O75749, Q5TG63 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 1 Human chromosome 1: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


