O33199 (O33199_MYCTU) Unreviewed, UniProtKB/TrEMBL
Last modified
May 1, 2013.
Version 93.
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| Protein names | Submitted name: MutT/nudix family protein EMBL AAK46008.1 Submitted name: NUDIX hydrolase EMBL CCP44465.1 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Mycobacterium tuberculosis [Reference proteome] [HAMAP] | ||
| Taxonomic identifier | 1773 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Actinobacteria › Actinobacteridae › Actinomycetales › Corynebacterineae › Mycobacteriaceae › Mycobacterium › Mycobacterium tuberculosis complex![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 207 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Ligand | Manganese PDB 1MR2 PDB 1MQW Metal-binding PDB 1MR2 PDB 1MQW |
| Molecular function | Hydrolase EMBL CCP44465.1 |
| Technical term | 3D-structure PDB 1MR2 PDB 1MQW PDB 1MP2 PDB 1MQE PDB 1MK1 Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Molecular_function | hydrolase activity Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW manganese ion bindingInferred from direct assay Ref.4. Source: MTBBASE |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Deciphering the biology of Mycobacterium tuberculosis from the complete genome sequence." Cole S.T., Brosch R., Parkhill J., Garnier T., Churcher C.M., Harris D.E., Gordon S.V., Eiglmeier K., Gas S., Barry C.E. III, Tekaia F., Badcock K., Basham D., Brown D., Chillingworth T., Connor R., Davies R.M., Devlin K. Barrell B.G.Nature 393:537-544(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 25618 / H37Rv and H37Rv EMBL CCP44465.1. |
| [2] | "Whole-genome comparison of Mycobacterium tuberculosis clinical and laboratory strains." Fleischmann R.D., Alland D., Eisen J.A., Carpenter L., White O., Peterson J.D., DeBoy R.T., Dodson R.J., Gwinn M.L., Haft D.H., Hickey E.K., Kolonay J.F., Nelson W.C., Umayam L.A., Ermolaeva M.D., Salzberg S.L., Delcher A., Utterback T.R. Fraser C.M.J. Bacteriol. 184:5479-5490(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: CDC 1551 / Oshkosh. |
| [3] | "Re-annotation of the genome sequence of Mycobacterium tuberculosis H37Rv." Camus J.C., Pryor M.J., Medigue C., Cole S.T. Microbiology 148:2967-2973(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE. Strain: H37Rv EMBL CCP44465.1. |
| [4] | "Structure and mechanism of MT-ADPRase, a nudix hydrolase from Mycobacterium tuberculosis." Kang L.W., Gabelli S.B., Cunningham J.E., O'Handley S.F., Amzel L.M. Structure 11:1015-1023(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.00 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH MANGANESE, ACTIVE SITE. |
| [5] | "TubercuList--10 years after." Lew J.M., Kapopoulou A., Jones L.M., Cole S.T. Tuberculosis 91:1-7(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE. Strain: H37Rv EMBL CCP44465.1. |
| [6] | Lew J.M. Submitted (DEC-2012) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE. Strain: H37Rv EMBL CCP44465.1. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE000516 Genomic DNA. Translation: AAK46008.1. AL123456 Genomic DNA. Translation: CCP44465.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | C70503. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_216216.1. NC_000962.3. NP_336194.1. NC_002755.2. YP_006515092.1. NC_018143.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
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| SMR | O33199. Positions 5-204. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 83332.Rv1700. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | AAK46008; AAK46008; MT1739. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 13316482. 885049. 923967. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | mtc:MT1739. mtu:Rv1700. mtv:RVBD_1700. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 18125576. VBIMycTub22151_1902. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TubercuList | Rv1700. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000045854. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K01515. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | HPGSVAV. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK791335. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 3.90.79.10. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000086. NUDIX_hydrolase_dom. IPR015797. NUDIX_hydrolase_dom-like. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00293. NUDIX. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF55811. NUDIX_hydrolase. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS51462. NUDIX. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | O33199. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | O33199_MYCTU | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O33199 Secondary accession number(s): F2GK38, Q7D845 | ||||||||
| Entry history |
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| Entry status | Unreviewed (UniProtKB/TrEMBL) | ||||||||

Clusters with
