O30143 (WTPB_ARCFU) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
November 16, 2011.
Version 67.
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| Protein names | Recommended name: Molybdate/tungstate transport system permease protein wtpB | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126) | ||||||
| Taxonomic identifier | 224325 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Archaea › Euryarchaeota › Archaeoglobi › Archaeoglobales › Archaeoglobaceae › Archaeoglobus |
Protein attributes
| Sequence length | 261 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Part of the ABC transporter complex wtpABC involved in molybdate/tungstate import. Probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane Probable. |
| Subunit structure | The complex is composed of two ATP-binding proteins (wtpC), two transmembrane proteins (wtpB) and a solute-binding protein (wtpA). Ref.2 |
| Subcellular location | |
| Sequence similarities | Belongs to the binding-protein-dependent transport system permease family. Contains 1 ABC transmembrane type-1 domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Transport |
| Cellular component | Cell membrane Membrane |
| Domain | Transmembrane Transmembrane helix |
| Ligand | Molybdenum |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Cellular component | integral to membrane Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW plasma membraneInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | transporter activity Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 261 | 261 | Molybdate/tungstate transport system permease protein wtpB | PRO_0000338496 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 1 – 2 | 2 | Cytoplasmic Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 3 – 28 | 26 | Helical; Name=1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 29 – 46 | 18 | Extracellular Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 47 – 76 | 30 | Helical; Name=2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 77 – 85 | 9 | Cytoplasmic Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 86 – 110 | 25 | Helical; Name=3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 111 – 123 | 13 | Extracellular Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 124 – 154 | 31 | Helical; Name=4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 155 – 184 | 30 | Cytoplasmic Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 185 – 209 | 25 | Helical; Name=5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 210 – 230 | 21 | Extracellular Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 231 – 251 | 21 | Helical; Name=6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 252 – 261 | 10 | Cytoplasmic Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 51 – 247 | 197 | ABC transmembrane type-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 93 – 107 | 15 | Gate 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 193 – 203 | 11 | Gate 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 2 – 29 | 28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 30 – 34 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 35 – 43 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 45 – 77 | 33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 84 – 96 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 99 – 110 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 115 – 119 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 128 – 153 | 26 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 156 – 164 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 169 – 175 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 177 – 198 | 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 201 – 204 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 213 – 224 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 226 – 228 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 230 – 249 | 20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [1] | "The complete genome sequence of the hyperthermophilic, sulphate-reducing archaeon Archaeoglobus fulgidus." Klenk H.-P., Clayton R.A., Tomb J.-F., White O., Nelson K.E., Ketchum K.A., Dodson R.J., Gwinn M.L., Hickey E.K., Peterson J.D., Richardson D.L., Kerlavage A.R., Graham D.E., Kyrpides N.C., Fleischmann R.D., Quackenbush J., Lee N.H., Sutton G.G. Venter J.C.Nature 390:364-370(1997) [PubMed: 9389475] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126. |
| [2] | "Structure of an ABC transporter in complex with its binding protein." Hollenstein K., Frei D.C., Locher K.P. Nature 446:213-216(2007) [PubMed: 17322901] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.1 ANGSTROMS) OF COMPLEX WITH WTPA AND WTPC, TOPOLOGY, SUBUNIT. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE000782 Genomic DNA. Translation: AAB91136.1. | ||||||||||||
| PIR | E69261. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_068934.1. NC_000917.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | O30143. | ||||||||||||
| SMR | O30143. Positions 1-252. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 1483305. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus AF_0093 in contig AE000782_GR. | ||||||||||||
| KEGG | afu:AF0093. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|224325.1.peg.93. | ||||||||||||
| TIGR | AF_0093. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | HBG685300. | ||||||||||||
| OMA | NGLINGW. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | AFUL224325:AF_0093-MONOMER. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR000515. BPD_transp. [Graphical view] | ||||||||||||
| KO | K15496. | ||||||||||||
| Pfam | PF00528. BPD_transp_1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PROSITE | PS50928. ABC_TM1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | WTPB_ARCFU | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O30143 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with