O29206 (Y1056_ARCFU) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
October 19, 2011.
Version 55.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: UPF0217 protein AF_1056 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126) | ||
| Taxonomic identifier | 224325 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Archaea › Euryarchaeota › Archaeoglobi › Archaeoglobales › Archaeoglobaceae › Archaeoglobus |
Protein attributes
| Sequence length | 288 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Sequence similarities | Belongs to the UPF0217 family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| None. [Check GOA] | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 288 | 288 | UPF0217 protein AF_1056 HAMAP MF_00587 | PRO_0000157945 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 1 – 94 | 94 | Unknown HAMAP MF_00587 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 95 – 288 | 194 | UPF0217 HAMAP MF_00587 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 96 – 104 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 115 – 119 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 121 – 132 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 142 – 148 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 151 – 153 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 156 – 161 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 162 – 164 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 172 – 184 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 192 – 195 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 198 – 201 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 205 – 215 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 216 – 221 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 225 – 227 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 228 – 230 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 235 – 242 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 249 – 256 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 260 – 264 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 272 – 287 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "The complete genome sequence of the hyperthermophilic, sulphate-reducing archaeon Archaeoglobus fulgidus." Klenk H.-P., Clayton R.A., Tomb J.-F., White O., Nelson K.E., Ketchum K.A., Dodson R.J., Gwinn M.L., Hickey E.K., Peterson J.D., Richardson D.L., Kerlavage A.R., Graham D.E., Kyrpides N.C., Fleischmann R.D., Quackenbush J., Lee N.H., Sutton G.G. Venter J.C.Nature 390:364-370(1997) [PubMed: 9389475] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE000782 Genomic DNA. Translation: AAB90184.1. | ||||||||||||
| PIR | H69381. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_069889.1. NC_000917.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | O29206. | ||||||||||||
| SMR | O29206. Positions 95-288. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 1484279. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus AF_1056 in contig AE000782_GR. | ||||||||||||
| KEGG | afu:AF1056. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|224325.1.peg.1048. | ||||||||||||
| TIGR | AF_1056. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | HBG508881. | ||||||||||||
| OMA | FSLNDMP. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK02135. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | AFUL224325:AF_1056-MONOMER. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00587. UPF0217. Fused. [Tree] | ||||||||||||
| InterPro | IPR007158. DUF358. [Graphical view] | ||||||||||||
| Pfam | PF04013. DUF358. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | Y1056_ARCFU | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O29206 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Uncharacterized protein families (UPF) List of uncharacterized protein family (UPF) entries |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with