O24248 (PRU1_PRUAV) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
April 3, 2013.
Version 75.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Major allergen Pru av 1 Alternative name(s): Allergen Pru a 1 Allergen=Pru av 1 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Prunus avium (Cherry) | ||
| Taxonomic identifier | 42229 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Viridiplantae › Streptophyta › Embryophyta › Tracheophyta › Spermatophyta › Magnoliophyta › eudicotyledons › core eudicotyledons › rosids › fabids › Rosales › Rosaceae › Amygdaloideae › Amygdaleae › Prunus![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 160 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Allergenic properties | Causes an allergic reaction in human. Binds to IgE and induces a strong histamine release. |
| Sequence similarities | Belongs to the BetVI family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Plant defense |
| Disease | Allergen |
| Molecular function | Pathogenesis-related protein |
| Technical term | 3D-structure |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | defense response Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW response to biotic stimulusInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 160 | 160 | Major allergen Pru av 1 | PRO_0000154202 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 3 – 14 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 16 – 23 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 24 – 26 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 27 – 34 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 36 – 38 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 39 – 50 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 54 – 59 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 62 – 64 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 75 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 77 – 79 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 81 – 86 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 90 – 92 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 93 – 95 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 96 – 105 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 111 – 123 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 131 – 154 | 24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 156 – 159 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Molecular cloning, expression and characterization of Pru a 1, the major cherry allergen." Scheurer S., Metzner K., Haustein D., Vieths S. Mol. Immunol. 34:619-629(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "Allergic cross-reactivity made visible. Solution structure of the major cherry allergen Pru av 1." Neudecker P., Schweimer K., Nerkamp J., Scheurer S., Vieths S., Sticht H., Rosch P. J. Biol. Chem. 276:22756-22763(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: STRUCTURE BY NMR. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | U66076 mRNA. Translation: AAC02632.1. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | O24248. | ||||||||||||||||||
| SMR | O24248. Positions 2-160. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||
| Allergome | 1316. Pru av 1.0101. 597. Pru av 1. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| Gene3D | 3.30.530.20. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR024949. Bet_v_I_allergen. IPR000916. Bet_v_I_dom. IPR023393. START-like_dom. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00407. Bet_v_1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00634. BETALLERGEN. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00451. PATHOGENESIS_BETVI. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | O24248. | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | PRU1_PRUAV | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O24248 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Plant Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Allergens Nomenclature of allergens and list of entries |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
