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UniProtKB/Swiss-Prot O14773 (TPP1_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
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90%,
50% identity |
Documents (7) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Tripeptidyl-peptidase 1 Short name=TPP-1 EC=3.4.14.9 Alternative name(s): Tripeptidyl-peptidase I Short name=TPP-I Tripeptidyl aminopeptidase Lysosomal pepstatin-insensitive protease Short name=LPIC Cell growth-inhibiting gene 1 protein | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 563 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Lysosomal serine protease with tripeptidyl-peptidase I activity. May act as a non-specific lysosomal peptidase which generates tripeptides from the breakdown products produced by lysosomal proteinases. Requires substrates with an unsubstituted N-terminus By similarity. |
| Catalytic activity | Release of an N-terminal tripeptide from a polypeptide, but also has endopeptidase activity. |
| Subcellular location | Lysosome. Melanosome. Note: Identified by mass spectrometry in melanosome fractions from stage I to stage IV. Ref.9 Ref.12 |
| Tissue specificity | Detected in all tissues examined with highest levels in heart and placenta and relatively similar levels in other tissues. |
| Post-translational modification | Activated by autocatalytic proteolytical processing upon acidification. |
| Involvement in disease | Defects in TPP1 are the cause of classical late-infantile neuronal ceroid lipofuscinosis (LINCL) [MIM:204500]; also known as ceroid lipofuscinosis neuronal 2 (CLN2). LINCL is a fatal childhood neurodegenerative disease characterized by progressive visual and mental decline, motor disturbance, epilepsy and behavioral changes. The three main subtypes of childhood NCLs defined by the age of onset, clinical features, and ultrastructural morphology are infantile NCL (INCL), classical late-infantile NCL (LINCL), or juvenile NCL (JNCL), although a number of other distinct variants forms have been described. Ref.1 Ref.15 Ref.16 Ref.17 Ref.18 Ref.20 Ref.21 Ref.22 |
| Sequence similarities | Belongs to the peptidase S53 family. |
| Caution | Ref.3 sequence is wrongly reported to originate from bovine. |
| Sequence caution | The sequence AAQ88866.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at position 551. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: O14773-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: O14773-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-243: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 19 | 19 | Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Propeptide | 20 – 195 | 176 | Removed in mature form | PRO_0000027374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 196 – 563 | 368 | Tripeptidyl-peptidase 1 | PRO_0000027375 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 272 | 1 | Charge relay system By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 276 | 1 | Charge relay system By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 475 | 1 | Charge relay system By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 210 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 222 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 286 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 313 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 443 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 243 | 243 | Missing in isoform 2. | VSP_013118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 62 | 1 | S → L: dbSNP rs2734715. | VAR_037572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 77 | 1 | G → R in LINCL. Ref.15 | VAR_009603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 100 | 1 | Q → R: dbSNP rs1800746. Ref.15 Ref.19 | VAR_009604 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 127 | 1 | R → Q in LINCL. Ref.17 Ref.20 | VAR_016790 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 153 | 1 | S → P in LINCL. | VAR_016791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 175 | 1 | R → H Ref.1 | VAR_005642 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 185 | 1 | R → C: dbSNP rs34758634. | VAR_037573 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 206 | 1 | R → C in LINCL. dbSNP rs28940573. Ref.16 Ref.22 | VAR_009605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 206 | 1 | R → H in LINCL. Ref.16 Ref.22 | VAR_016792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 277 | 1 | V → M in LINCL. Ref.21 | VAR_016793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 278 | 1 | Q → P in LINCL. Ref.21 | VAR_016794 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 284 | 1 | G → V in LINCL. Ref.17 Ref.21 | VAR_016795 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 286 | 1 | N → S in LINCL. Ref.20 | VAR_016796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 287 | 1 | I → N in LINCL. Ref.15 | VAR_009606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 343 | 1 | E → K in LINCL. Ref.15 | VAR_009607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 353 | 1 | T → P in LINCL. Ref.20 | VAR_016797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 365 | 1 | C → R in LINCL. Ref.1 Ref.15 | VAR_005643 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 365 | 1 | C → Y in LINCL. Ref.1 Ref.15 | VAR_005644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 385 | 1 | V → D in LINCL. Ref.15 | VAR_009608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 389 | 1 | G → E in LINCL. Ref.15 | VAR_009609 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 422 | 1 | Q → H in LINCL. Ref.15 | VAR_009610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 428 | 1 | K → N in LINCL. Ref.17 | VAR_016798 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 447 | 1 | R → H in LINCL. Ref.15 | VAR_005645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 454 | 1 | A → E in LINCL. Ref.15 | VAR_009611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 473 | 1 | G → R in LINCL. Ref.17 Ref.18 | VAR_016799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 475 | 1 | S → L in LINCL. Ref.15 | VAR_009612 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 481 | 1 | F → C in LINCL. Ref.21 | VAR_016800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 236 | 1 | H → A: No effect. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 360 | 1 | D → A: Inactive. Impaired processing. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 475 | 1 | S → A: Inactive. Impaired processing. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 517 | 1 | D → A: Inactive. Impaired processing. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 115 | 1 | I → N in BAD96219. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 373 | 1 | Q → E in AAH14863. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 202 – 204 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 206 – 208 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 209 – 212 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 234 – 246 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 271 – 279 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 282 – 284 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 298 – 300 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 304 – 310 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 311 – 314 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 329 – 335 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 337 – 348 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 349 – 351 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 360 – 366 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 367 – 369 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 370 – 374 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 379 – 381 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 386 – 390 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 411 – 416 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 425 – 427 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 445 – 449 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 452 – 454 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 458 – 463 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 466 – 470 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 474 – 476 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 478 – 484 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 485 – 487 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 492 – 494 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 504 – 507 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 511 – 513 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 514 – 516 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 525 – 528 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 531 – 533 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 540 – 543 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 544 – 546 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 553 – 558 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 559 – 561 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AF017456 mRNA. Translation: AAB80725.1. AF039704 Genomic DNA. Translation: AAC98480.1. AF491290 mRNA. Translation: AAM08412.1. AY268890 mRNA. Translation: AAQ72732.1. AY358502 mRNA. Translation: AAQ88866.1. Frameshift. AK222499 mRNA. Translation: BAD96219.1. BC014863 mRNA. Translation: AAH14863.1. | |||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00298237. IPI00554617. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000382.3. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.523454 | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||||||||
| MEROPS | S53.003. | ||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | O14773. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | O14773. | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000166340. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 1200. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:1200. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC11M006591. | ||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0009410. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:2073. TPP1. | ||||||||||||||||||||||||
| MIM | 204500. phenotype. 607998. gene. | ||||||||||||||||||||||||
| Orphanet | 216. Ceroid lipofuscinosis, neuronal. 168491. Late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA26600. | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | O14773. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | O14773. | ||||||||||||||||||||||||
| OMA | O14773. SVIRKRY. | ||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 3.4.14.9. 247. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | O14773. | ||||||||||||||||||||||||
| Bgee | O14773. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_TPP1. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000166340. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000209. Pept_S8_S53. IPR015366. Peptidase_S53_propep. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.50.200. Pept_S8_S53. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF09286. Pro-kuma_activ. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 4955. | ||||||||||||||||||||||||
| PMAP-CutDB | O14773. | ||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | TPP1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O14773 Secondary accession number(s): Q53HT1 Q96C37 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 11 Human chromosome 11: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| Peptidase families Classification of peptidase families and list of entries |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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