O00238 (BMR1B_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 141.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Alt products·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Alt products·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Bone morphogenetic protein receptor type-1B Short name=BMP type-1B receptor Short name=BMPR-1B EC=2.7.11.30 Alternative name(s): CD_antigen=CDw293 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 502 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | On ligand binding, forms a receptor complex consisting of two type II and two type I transmembrane serine/threonine kinases. Type II receptors phosphorylate and activate type I receptors which autophosphorylate, then bind and activate SMAD transcriptional regulators. Receptor for BMP7/OP-1 and GDF5. |
| Catalytic activity | ATP + [receptor-protein] = ADP + [receptor-protein] phosphate. |
| Cofactor | Magnesium or manganese By similarity. |
| Subcellular location | |
| Involvement in disease | Acromesomelic chondrodysplasia, with genital anomalies (AMDGA) [MIM:609441]: A form of chondrodysplasia. Acromesomelic chondrodysplasias are rare hereditary skeletal disorders characterized by short stature, very short limbsand hand/foot malformations. The severity of limb abnormalities increases from proximal to distal with profoundly affected hands and feet showing brachydactyly and/or rudimentary fingers (knob-like fingers). Brachydactyly A2 (BDA2) [MIM:112600]: A form of brachydactyly. Brachydactyly defines a group of inherited malformations characterized by shortening of the digits due to abnormal development of the phalanges and/or the metacarpals. In brachydactyly type A2 shortening of the middle phalanges is confined to the index finger and the second toe, all other digits being more or less normal. Because of a rhomboid or triangular shape of the affected middle phalanx, the end of the second finger usually deviates radially. |
| Sequence similarities | Belongs to the protein kinase superfamily. TKL Ser/Thr protein kinase family. TGFB receptor subfamily. Contains 1 GS domain. Contains 1 protein kinase domain. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: O00238-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: O00238-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-1: M → MGWLEELNWQLHIFLLILLSMHTRANFLDNM |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 13 | 13 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 14 – 502 | 489 | Bone morphogenetic protein receptor type-1B | PRO_0000024412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 14 – 126 | 113 | Extracellular Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 127 – 148 | 22 | Helical; Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 149 – 502 | 354 | Cytoplasmic Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 174 – 203 | 30 | GS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 204 – 494 | 291 | Protein kinase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 210 – 218 | 9 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 332 | 1 | Proton acceptor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 231 | 1 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 32 ↔ 53 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 34 ↔ 38 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 47 ↔ 71 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 81 ↔ 95 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 96 ↔ 102 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 | 1 | M → MGWLEELNWQLHIFLLILLS MHTRANFLDNM in isoform 2. | VSP_045100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 31 | 1 | R → H in a gastric adenocarcinoma sample; somatic mutation. Ref.10 | VAR_041401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 149 | 1 | R → W. Ref.10 Corresponds to variant rs34231464 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_041402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 200 | 1 | I → K in BDA2. Ref.7 Corresponds to variant rs28939703 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_023819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 224 | 1 | R → H. Ref.10 Corresponds to variant rs35973133 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_041403 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 297 | 1 | D → N in a metastatic melanoma sample; somatic mutation. Ref.10 | VAR_041404 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 371 | 1 | R → Q. Ref.10 Corresponds to variant rs34970181 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_041405 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 486 | 1 | R → Q in brachydactyly type C and BDA2; with also additional features of symphalangism-1. Ref.9 | VAR_037967 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 486 | 1 | R → W in BDA2. Ref.7 Corresponds to variant rs28939704 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_023820 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 176 – 186 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 190 – 192 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 194 – 197 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 200 – 203 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 205 – 213 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 216 – 223 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 226 – 234 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 235 – 237 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 238 – 248 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 261 – 268 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 270 – 272 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 274 – 279 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 287 – 293 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 298 – 316 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 337 – 340 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 346 – 348 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 375 – 377 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 380 – 383 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 393 – 411 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 426 – 430 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 437 – 444 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 455 – 459 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 461 – 473 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 478 – 480 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 484 – 496 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 497 – 499 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Cloning of human bone morphogenetic protein type IB receptor (BMPR-IB) and its expression in prostate cancer in comparison with other BMPRs." Ide H., Katoh M., Sasaki H., Yoshida T., Aoki K., Nawa Y., Osada Y., Sugimura T., Terada M. Oncogene 14:1377-1382(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: Prostate. |
| [2] | "Chromosomal localization of three human genes encoding bone morphogenetic protein receptors." Astroem A.-K., Jin D.F., Imamura T., Roijer E., Rosenzweig B., Miyazono K., ten Dijke P., Stenman G. Mamm. Genome 10:299-302(1999) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: Ovary. |
| [3] | "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs." Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., Otsuki T., Sugiyama T., Irie R., Wakamatsu A., Hayashi K., Sato H., Nagai K., Kimura K., Makita H., Sekine M., Obayashi M., Nishi T., Shibahara T., Tanaka T., Ishii S. Sugano S.Nat. Genet. 36:40-45(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORMS 1 AND 2). Tissue: Brain and Uterus. |
| [4] | "Generation and annotation of the DNA sequences of human chromosomes 2 and 4." Hillier L.W., Graves T.A., Fulton R.S., Fulton L.A., Pepin K.H., Minx P., Wagner-McPherson C., Layman D., Wylie K., Sekhon M., Becker M.C., Fewell G.A., Delehaunty K.D., Miner T.L., Nash W.E., Kremitzki C., Oddy L., Du H. Wilson R.K.Nature 434:724-731(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [5] | Mural R.J., Istrail S., Sutton G.G., Florea L., Halpern A.L., Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R., Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V., Hannenhalli S., Turner R. Venter J.C.Submitted (JUL-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [6] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: PNS. |
| [7] | "Mutations in bone morphogenetic protein receptor 1B cause brachydactyly type A2." Lehmann K., Seemann P., Stricker S., Sammar M., Meyer B., Suering K., Majewski F., Tinschert S., Grzeschik K.-H., Mueller D., Knaus P., Nuernberg P., Mundlos S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100:12277-12282(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS BDA2 LYS-200 AND TRP-486. |
| [8] | "A homozygous BMPR1B mutation causes a new subtype of acromesomelic chondrodysplasia with genital anomalies." Demirhan O., Tuerkmen S., Schwabe G.C., Soyupak S., Akguel E., Tastemir D., Karahan D., Mundlos S., Lehmann K. J. Med. Genet. 42:314-317(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INVOLVEMENT IN AMDGA. |
| [9] | "A novel R486Q mutation in BMPR1B resulting in either a brachydactyly type C/symphalangism-like phenotype or brachydactyly type A2." Lehmann K., Seemann P., Boergermann J., Morin G., Reif S., Knaus P., Mundlos S. Eur. J. Hum. Genet. 14:1248-1254(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANT BRACHYDACTYLY TYPE C/BDA2 GLN-486. |
| [10] | "Patterns of somatic mutation in human cancer genomes." Greenman C., Stephens P., Smith R., Dalgliesh G.L., Hunter C., Bignell G., Davies H., Teague J., Butler A., Stevens C., Edkins S., O'Meara S., Vastrik I., Schmidt E.E., Avis T., Barthorpe S., Bhamra G., Buck G. Stratton M.R.Nature 446:153-158(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS [LARGE SCALE ANALYSIS] HIS-31; TRP-149; HIS-224; ASN-297 AND GLN-371. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | D89675 mRNA. Translation: BAA19765.1. U89326 mRNA. Translation: AAC28131.1. AK299930 mRNA. Translation: BAG61763.1. AK313642 mRNA. Translation: BAG36400.1. AC004061 Genomic DNA. No translation available. AC092609 Genomic DNA. No translation available. AC093634 Genomic DNA. No translation available. AC105395 Genomic DNA. No translation available. CH471057 Genomic DNA. Translation: EAX06060.1. BC047773 mRNA. Translation: AAH47773.1. BC069796 mRNA. Translation: AAH69796.1. BC069803 mRNA. Translation: AAH69803.1. | ||||||||||||
| IPI | IPI00939250. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_001194.1. NM_001203.2. NP_001243721.1. NM_001256792.1. NP_001243722.1. NM_001256793.1. NP_001243723.1. NM_001256794.1. | ||||||||||||
| UniGene | Hs.598475. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | O00238. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| MINT | MINT-1340235. | ||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000264568. | ||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||
| PhosphoSite | O00238. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PaxDb | O00238. | ||||||||||||
| PRIDE | O00238. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| DNASU | 658. | ||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENST00000264568; ENSP00000264568; ENSG00000138696. ENST00000394931; ENSP00000378389; ENSG00000138696. ENST00000440890; ENSP00000401907; ENSG00000138696. ENST00000509540; ENSP00000421671; ENSG00000138696. ENST00000512312; ENSP00000425444; ENSG00000138696. ENST00000515059; ENSP00000426617; ENSG00000138696. | ||||||||||||
| GeneID | 658. | ||||||||||||
| KEGG | hsa:658. | ||||||||||||
| UCSC | uc003htm.4. human. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CTD | 658. | ||||||||||||
| GeneCards | GC04P095679. | ||||||||||||
| HGNC | HGNC:1077. BMPR1B. | ||||||||||||
| HPA | CAB009634. | ||||||||||||
| MIM | 112600. phenotype. 603248. gene. 609441. phenotype. | ||||||||||||
| neXtProt | NX_O00238. | ||||||||||||
| Orphanet | 93396. Brachydactyly type A2. 93384. Brachydactyly type C. | ||||||||||||
| PharmGKB | PA25387. | ||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG0515. | ||||||||||||
| HOGENOM | HOG000230587. | ||||||||||||
| HOVERGEN | HBG054502. | ||||||||||||
| InParanoid | O00238. | ||||||||||||
| KO | K13578. | ||||||||||||
| OMA | DGPIHHK. | ||||||||||||
| PhylomeDB | O00238. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BRENDA | 2.7.10.2. 2681. | ||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | bmppathway. BMP receptor signaling. | ||||||||||||
| Reactome | REACT_111102. Signal Transduction. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | O00238. | ||||||||||||
| Bgee | O00238. | ||||||||||||
| CleanEx | HS_BMPR1B. | ||||||||||||
| Genevestigator | O00238. | ||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000138696. Homo sapiens. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR000333. Activin_II/TGFBeta-II_recpt. IPR000472. Activin_rcpt. IPR011009. Kinase-like_dom. IPR000719. Prot_kinase_cat_dom. IPR017441. Protein_kinase_ATP_BS. IPR008271. Ser/Thr_kinase_AS. IPR003605. TGF_beta_rcpt_GS. [Graphical view] | ||||||||||||
| Pfam | PF01064. Activin_recp. 1 hit. PF00069. Pkinase. 1 hit. PF08515. TGF_beta_GS. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PRINTS | PR00653. ACTIVIN2R. | ||||||||||||
| SMART | SM00467. GS. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF56112. Kinase_like. 1 hit. | ||||||||||||
| PROSITE | PS51256. GS. 1 hit. PS00107. PROTEIN_KINASE_ATP. 1 hit. PS50011. PROTEIN_KINASE_DOM. 1 hit. PS00108. PROTEIN_KINASE_ST. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| BindingDB | O00238. | ||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL5476. | ||||||||||||
| ChiTaRS | BMPR1B. human. | ||||||||||||
| EvolutionaryTrace | O00238. | ||||||||||||
| GenomeRNAi | 658. | ||||||||||||
| NextBio | 2676. | ||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | BMR1B_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: O00238 Secondary accession number(s): B2R953, B4DSV1, P78366 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human and mouse protein kinases Human and mouse protein kinases: classification and index |
| Human cell differentiation molecules CD nomenclature of surface proteins of human leucocytes and list of entries |
| Human chromosome 4 Human chromosome 4: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
