true
2012-11-28
2024-03-27
72
PRRP3_ARATH
Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis thaliana.
Mayer K.F.X.
Schueller C.
Wambutt R.
Murphy G.
Volckaert G.
Pohl T.
Duesterhoeft A.
Stiekema W.
Entian K.-D.
Terryn N.
Harris B.
Ansorge W.
Brandt P.
Grivell L.A.
Rieger M.
Weichselgartner M.
de Simone V.
Obermaier B.
Mache R.
Mueller M.
Kreis M.
Delseny M.
Puigdomenech P.
Watson M.
Schmidtheini T.
Reichert B.
Portetelle D.
Perez-Alonso M.
Boutry M.
Bancroft I.
Vos P.
Hoheisel J.
Zimmermann W.
Wedler H.
Ridley P.
Langham S.-A.
McCullagh B.
Bilham L.
Robben J.
van der Schueren J.
Grymonprez B.
Chuang Y.-J.
Vandenbussche F.
Braeken M.
Weltjens I.
Voet M.
Bastiaens I.
Aert R.
Defoor E.
Weitzenegger T.
Bothe G.
Ramsperger U.
Hilbert H.
Braun M.
Holzer E.
Brandt A.
Peters S.
van Staveren M.
Dirkse W.
Mooijman P.
Klein Lankhorst R.
Rose M.
Hauf J.
Koetter P.
Berneiser S.
Hempel S.
Feldpausch M.
Lamberth S.
Van den Daele H.
De Keyser A.
Buysshaert C.
Gielen J.
Villarroel R.
De Clercq R.
van Montagu M.
Rogers J.
Cronin A.
Quail M.A.
Bray-Allen S.
Clark L.
Doggett J.
Hall S.
Kay M.
Lennard N.
McLay K.
Mayes R.
Pettett A.
Rajandream M.A.
Lyne M.
Benes V.
Rechmann S.
Borkova D.
Bloecker H.
Scharfe M.
Grimm M.
Loehnert T.-H.
Dose S.
de Haan M.
Maarse A.C.
Schaefer M.
Mueller-Auer S.
Gabel C.
Fuchs M.
Fartmann B.
Granderath K.
Dauner D.
Herzl A.
Neumann S.
Argiriou A.
Vitale D.
Liguori R.
Piravandi E.
Massenet O.
Quigley F.
Clabauld G.
Muendlein A.
Felber R.
Schnabl S.
Hiller R.
Schmidt W.
Lecharny A.
Aubourg S.
Chefdor F.
Cooke R.
Berger C.
Monfort A.
Casacuberta E.
Gibbons T.
Weber N.
Vandenbol M.
Bargues M.
Terol J.
Torres A.
Perez-Perez A.
Purnelle B.
Bent E.
Johnson S.
Tacon D.
Jesse T.
Heijnen L.
Schwarz S.
Scholler P.
Heber S.
Francs P.
Bielke C.
Frishman D.
Haase D.
Lemcke K.
Mewes H.-W.
Stocker S.
Zaccaria P.
Bevan M.
Wilson R.K.
de la Bastide M.
Habermann K.
Parnell L.
Dedhia N.
Gnoj L.
Schutz K.
Huang E.
Spiegel L.
Sekhon M.
Murray J.
Sheet P.
Cordes M.
Abu-Threideh J.
Stoneking T.
Kalicki J.
Graves T.
Harmon G.
Edwards J.
Latreille P.
Courtney L.
Cloud J.
Abbott A.
Scott K.
Johnson D.
Minx P.
Bentley D.
Fulton B.
Miller N.
Greco T.
Kemp K.
Kramer J.
Fulton L.
Mardis E.
Dante M.
Pepin K.
Hillier L.W.
Nelson J.
Spieth J.
Ryan E.
Andrews S.
Geisel C.
Layman D.
Du H.
Ali J.
Berghoff A.
Jones K.
Drone K.
Cotton M.
Joshu C.
Antonoiu B.
Zidanic M.
Strong C.
Sun H.
Lamar B.
Yordan C.
Ma P.
Zhong J.
Preston R.
Vil D.
Shekher M.
Matero A.
Shah R.
Swaby I.K.
O'Shaughnessy A.
Rodriguez M.
Hoffman J.
Till S.
Granat S.
Shohdy N.
Hasegawa A.
Hameed A.
Lodhi M.
Johnson A.
Chen E.
Marra M.A.
Martienssen R.
McCombie W.R.
doi:10.1038/47134
1999
Nature
402
769-777
NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]
cv. Columbia
Araport11: a complete reannotation of the Arabidopsis thaliana reference genome.
Cheng C.Y.
Krishnakumar V.
Chan A.P.
Thibaud-Nissen F.
Schobel S.
Town C.D.
doi:10.1111/tpj.13415
2017
Plant J.
89
789-804
GENOME REANNOTATION
Large-scale analysis of RIKEN Arabidopsis full-length (RAFL) cDNAs.
Totoki Y.
Seki M.
Ishida J.
Nakajima M.
Enju A.
Morosawa T.
Kamiya A.
Narusaka M.
Shin-i T.
Nakagawa M.
Sakamoto N.
Oishi K.
Kohara Y.
Kobayashi M.
Toyoda A.
Sakaki Y.
Sakurai T.
Iida K.
Akiyama K.
Satou M.
Toyoda T.
Konagaya A.
Carninci P.
Kawai J.
Hayashizaki Y.
Shinozaki K.
2006-07
EMBL/GenBank/DDBJ
NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]
A single Arabidopsis organellar protein has RNase P activity.
Gobert A.
Gutmann B.
Taschner A.
Goessringer M.
Holzmann J.
Hartmann R.K.
Rossmanith W.
Giege P.
doi:10.1038/nsmb.1812
2010
Nat. Struct. Mol. Biol.
17
740-744
IDENTIFICATION
SUBCELLULAR LOCATION
PRORP proteins support RNase P activity in both organelles and the nucleus in Arabidopsis.
Gutmann B.
Gobert A.
Giege P.
doi:10.1101/gad.189514.112
2012
Genes Dev.
26
1022-1027
FUNCTION
CATALYTIC ACTIVITY
DISRUPTION PHENOTYPE
MUTAGENESIS OF 480-ASP-ASP-481
BIOPHYSICOCHEMICAL PROPERTIES
Sequence problems.
Sequence problems.
Different initiation.
Sequence problems.
PRORP3
Eukaryota
399
baseline and differential
PIN_PRORP-Zc3h12a-like
Tetratricopeptide repeat domain
PPR_long
PRORP_C
TPR-like_helical_dom_sf
PROTEINACEOUS RNASE P 3
UNCHARACTERIZED
PPR_long
PRORP
Proteinaceous RNase P 3
3.1.26.5
PRORP3
At4g21900
T8O5.110
Endonuclease RNase P responsible for the 5' maturation of tRNA precursors. Also involved in the maturation of mRNA and small nucleolar RNA (snoRNA).
Binds 2 Mg(2+) or Mg(2+) ions per subunit.
0.3 uM for tRNA(Gln) precursor
No visible phenotype; due to the redundancy with PRORP2. Prorp2 and prorp3 double mutant is lethal.
Belongs to the PPR family. P subfamily.
Truncated N-terminus.
Intron retention.
Proteinaceous RNase P 3
64396
1
576
PPR 1
88
123
PPR 2
129
166
PPR 3
167
201
PPR 4
204
238
PRORP
335
570
Disordered
65
340
343
402
480
481
499
553
Loss of activity.
AA
G
185
1
catalytic
2
catalytic
2011-06-28
1
64396
890bb3a379f16458a2f5a20630811e2e
MKLKKPSLPSSLLCAVPPCLSQIRLLIPRRVRVSSSTFANAKLVTLRNHTVNLHIYYCSMAGTDNRRSRHDDESPKNPNKKKKGNRNPEKSLLINLHSCSKRKDLSAALALYDAAITSSDIRLNQQHFQSLLYLCSAFISDPSLQTVAIDRGFQIFDRMVSSGISPNESSVTAVARLAAAKGDGDYAFKLVKDLVAVGGVSVPRLRTYAPALLCFCDTLEAEKGYEVEDHMDASGIVLEEAEISALLKVSAATGRENKVYRYLQKLRECVGCVSEETSKAIEEWFYGVKASEVSDNGIGSDIELLRAAVLKNGGGWHGLGWVGEGKWIVKKGNVSSAGKCLSCDEHLACVDTNEVETEDFVNSLVTLAMERKAKMNSCEPMADFSEFQEWLEKHGDYEAILDGANIGLYQQNFADGGFSLPQLEAVVKELYNKSGSKKQPLILLHKKRVNALLENPNHRNLVEEWINNNVLYATPPGSNDDWYWLYAAAKLKCLLVTNDEMRDHIFELLSNSFFQKWKERHQVRFTFVKGCLKLEMPPPFSVVIQESEKGSWHVPITSQDKEESLRSWMCITRQSS
true
true
true
true
true
true
true